HLA-DRB1 frequencies of the Comorian population and their genetic affinities with Sub-Saharan African and Indian Oceanian populations

Abstract

Background: Ethnic–historic sources have considered the Comorian population to be the result of an amalgamation of African, Arabian and Southeast Asian groups.

Aim: This study seeks to determine the genetic relationships and contributions from Sub-Saharan Africa and Indian Oceania and to reconstruct past migration events.

Subjects and methods: The human leukocyte antigen (HLA) polymorphism of a Comorian population was described and analysed.

Results: Genetic distances and multidimensional scaling analyses showed complex patterns of genetic differentiation in the Indian Oceanian area as a result of continuous gene flow occurring within the past ∼2500 years. Nevertheless, the Comorian genetic pool appears to be a mix of Bantu-speaking and Arab populations as testified to by admixture estimations of almost 50–60% and 27–33%, respectively.

Conclusion: The Comorian population may represent the eastern limit of the recent and massive eastward Bantu expansion. In contrast to the population from Madagascar (Merina), only a restricted influence of Austronesian populations was found.

Résumé. Arrière plan: Les sources ethno-historiques ont considéré la population comorienne comme le produit d’un amalgame entre groupes africains, arabes et d’Asie du sud-est.

But: Cette étude cherche à déterminer les relations génétiques et les contributions en provenance de l’Afrique sub-saharienne ainsi que de l’Océan Indien et à reconstruire les mouvements migratoires du passé.

Sujets et méthodes: On décrit et analyse le polymorphisme de l’antigène leucocytaire humain (HLA) d’une population comorienne.

Résultats: Les distances génétiques et les analyses de gradation multidimensionnelle montrent des tableaux complexes de différenciation génétique dans l’aire de l’Océan Indien, suite à un flux génique continu qui s’est produit au cours des ∼2500 ans passés. Pour autant, le patrimoine génétique comorien paraît être un mélange de populations de langues bantoues et d’arabes, comme l’attestent les estimations de métissage qui sont respectivement de 50 à 60% et de 27 à 33%.

Conclusion: La population comorienne peut être la représentante la limite orientale de l’expansion bantoue, massive et récente. Par contraste avec la population malgache (Mérina), seule une influence restreinte des populations austronésiennes y a été trouvée.

Zusammenfassung. Hintergrund: Ethnisch—historische Quellen gehen davon aus, dass die Bevölkerung der Komoren das Resultat einer Mischung Afrikanischer, Arabischer und Südostasiatischer Gruppen ist.

Ziel: Diese Studie versucht, die genetischen Beziehungen und das Ausmaß der Zumischung aus der Afrikanischen Subsahara und Indisch-Ozeanien zu bestimmen und frühere Migrationsbewegungen zu rekonstruieren.

Probanden und Methoden: Es wurde der Polymorphismus des humanen Leukozytenantigens (HLA) einer Bevölkerungsgruppe der Komoren beschrieben und analysiert.

Ergebnisse: Genetische Abstände und multidimensionale scaling-Analysen zeigten komplexe Muster von genetischer Differenzierung in der Region Indisch-Ozeanien infolge eines kontinuierlichen Genfluxes im Verlauf der vergangenen ∼2500 Jahren. Nichtsdestotrotz erscheint der genetische Pool der Komoren eine Mischung von Bantu-sprechenden und Arabischen Populationen zu sein, was sich durch die Zumischungen von jeweils etwa 50–60% bzw. 27–33% abschätzen lässt.

Zusammenfassung: Die Bevölkerung der Komoren dürfte die östliche Begrenzung der jüngsten und sehr ausgedehnten Bantu-Expansion darstellen. Im Gegensatz zur Bevölkerung von Madagaskar (Merina) fand sich nur ein geringer Einfluss Austronesischer Populationen.

Resumen. Antedecentes: Las fuentes étnico-históricas han considerado a la población de las Comores como el resultado de la amalgama de grupos africanos, árabes y del sudeste asiático.

Objetivo: Este estudio intenta determinar la relaciones genéticas y las contribuciones del África sub-sahariana y del Océano Índico y reconstruir los acontecimientos de las pasadas migraciones.

Sujetos y métodos: Se describió y analizó el polimorfismo del antígeno leucocitario humano (HLA) de una población de las Comores.

Resultados: Los análisis de distancias genéticas y de escalamiento multidimensional mostraron patrones complejos de diferenciación genética en el área del Océano Índico como resultado de un flujo génico continuo ocurrido durante, aproximadamente, los últimos 2.500 años. No obstante el “pool” génico de las Comores parece ser una mezcla de poblaciones de habla Bantú y árabes, como demuestran las estimas de mezcla de aproximadamente el 50–60% y el 27–33%, respectivamente.

Conclusión: La población de las Comores puede representar el límite más oriental de la reciente y masiva expansión Bantú hacia el este. Al contrario que la población de Madagascar (Merina), únicamente se encontró una reducida influencia de poblaciones Austronesias.

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