Validation of the DNA IQ™ System for use in the DNA Extraction of High Volume Forensic Casework

ABSTRACT

A modified DNA IQ™ System (Promega) protocol was validated for the rapid processing of a range of samples, including cigarette butts, gum, dried nasal secretions on tissue, swabbed drink containers and blood samples. Promega's standard Database Protocol was primarily designed for DNA extraction from blood stains. Modifications to this protocol were required to increase extraction efficiency from a range of sample types. These included: decreasing the incubation temperature; replacing the initial incubation in the kit's lysis buffer with an extraction buffer containing proteinase K; using a 25 μL elution volume; decreasing the number of resin washes from 3 to 1. Complete 9-locus STR (short tandem repeat) profiles were generated in most instances without the need for additional sample purification prior to amplification. In addition to being a fast and effective method of DNA extraction, the use of a single protocol for a range of samples makes the procedure amenable to automation.

RÉSUMÉ

Un protocole DNAIQ™ (Promega) modifié fut validé pour le traitement rapide d'une gamme d'échantillons incluant mégots de cigarettes, gomme à mâcher, sécrétions nasales sèches sur papier mouchoir, écouvillons de contenants de boissons et échantillons de sang. Le protocole standard de Promega pour base de données fut développé principalement afin d'extraire l'ADN de taches de sang. Des modifications furent apportées à ce protocole afin d'augmenter l'efficacité de l'extraction de différents types d'échantillons. Ces modifications ont inclus une diminution de la température d'incubation, le remplacement du tampon de lyse de la trousse par un tampon d'extraction contenant de la protéinase K lors de l'incubation initiale; l'utilisation d'un volume d'élution de 25 μL et une diminution du nombre de lavage de la résine de 3 à 1. Des profils complets, 9 loci STR (séquences répétitives en tandem) furent obtenus dans la plupart des cas sans avoir recours à des techniques de purification avant amplification. En plus d'être rapide et efficace, cette méthode d'extraction se prête bien à l'automatisation puisqu'un même protocole peut être utilisé pour l'extraction d'ADN provenant d'un assortiment d'échantillons.