The Next Rung: Validation of Modified Allelic Ladders from Applied Biosystems

ABSTRACT

It is a quality assurance/quality control requirement to perform internal validation studies on new or modified reagents used in forensic DNA typing, even when performance verification studies have been conducted by the manufacturer. In 2006, Applied Biosystems (AB) released modified AmpFlSTR® Profiler Plus™ and AmpFlSTR® COfiler™ allelic ladders. Prior to adopting the modified allelic ladders, an in-house validation study was conducted and it was found that there was no significant difference in sizing precision and genotyping concordance between the previous and modified allelic ladders. A definite improvement in allele balance was observed across all loci with both allelic ladders. However, we did not necessarily observe an overall increase in peak heights as claimed by the manufacturer. We can conclude that the modified allelic ladders are still robust, reliable, and reproducible for forensic DNA typing.

RÉSUMÉ

Avant d'utiliser des réactifs nouveaux ou modifiés en profilage génétique judiciaire, on doit faire des études internes de validation pour satisfaire aux exigences de l'assurance qualité/contrôle de la qualité, ceci même si le manufacturier a effectué des études de vérification de performance. En 2006, la compagnie Applied Biosystems (AB) a mis en marché des échelles alléliques modifiées AmpFlSTR® Profiler Plus™ et AmpFlSTR® COfiler™. Avant l'adoption de ces échelles modifiées, une étude interne de validation fut entreprise et aucune différence significative quant à la précision du mesurage et la concordance génotypique ne fut observée entre les échelles alléliques originales et modifiées. On a observé une nette amélioration de l'équilibre des allèles dans tous les loci des deux échelles. Par contre nous n'avons pas observé une augmentation générale dans la hauteur des pics tel que le prétend le manufacturier. Nous concluons que les échelles alléliques modifiées sont encore robustes, fiables et reproductibles pour le profilage génétique judiciaire.