Differentiation of egg drop syndrome virus isolates by restriction endonuclease analysis of virus dna

Summary

Thirteen isolates of egg drop syndrome (EDS) virus were compared by restriction endonuclease analysis of the virus DNA. One virus, an Australian chicken isolate, was distinguished from the others using the endonucleases EcoRl, BamUl, Kpnl, Hindlll, Pstl and Pvull, all of which recognise six base pair DNA sequences. Polyacrylamide gel restriction fragment patterns generated by Haelll, Hhall and TaqI, which recognise four base pairs, allowed further differentiation of the virus isolates. Nine chicken viruses isolated in the United Kingdom and Belgium in the period 1976 to 1987 were identical and could be distinguished from three United Kingdom duck isolates. The Australian isolate, in addition to possessing a DNA deletion (0.4 kbp) at one end of the genome (32.6 kbp) also differed from the European isolates at base sequence level. Genome maps for EcoRl, BamHl, Kpnl and Pstl are reported for the 127 isolate of EDS virus.

Resume

Différenciation des souches de virus de la maladie des oeufs hardés par analyse de l'ADN viral avec l'endonucléase de restriction

Trente souches du virus de la maladie des oeufs hardés (EDS) ont été comparées par analyse de l'ADN viral avec l'endonucléase de restriction. Un virus isolé de poulet en Australie s'est révélé différent des autres en utilisant les endonucléases EcoRI, BamHI, KpnI, HindIII, PstI et PuvII, toutes reconnaissant six séquences de paires de base d'ADN. En gel de polyacrylamide les modèles de fragments générés par restriction avec Haelll, HhaII et Taql, qui reconnaissent quatre paires de base, permettent une différenciation plus complète des virus isolés. Neuf virus isolés de poulets en Grande‐Bretagne et en Belgique pendant la période 1976–1987 se sont révélés identiques et sont distincts de trois souches isolées de canard en Grande‐Bretagne. La souche isolée en Australie, qui possède en plus une délétion d'ADN (0,4 kbp) à une extrêmité du génome (32,6 kbp) était différente des souches isolées en Europe en ce qui concerne la séquence de base. Les cartes des génomes pour Eco RI, BamHI, Kpnl et PifI sont données pour la souche 127 de virus EDS.

Zusammenfassung

Die Differenzierung von Eggdrop‐Syndrom Virusisolaten durch restriktive Endonuklease‐Analyse der Virus DNA

Dreizehn Isolate des Eggdrop Syndrom Virus (EDS) wurden durch restriktive Endonuklease Analyse der Virus DNA verglichen. Ein Virus, ein australisches Hühnerisolat, wurde von andern durch Verwendung der Endonukleasen Esco RI, BamHI, Kpnl, HindIII, Pstl, PvuII, die alle die sechs Basenpaare der DNA Sequenzen erkennen, unterschieden. Die Polyacrylamidgel Restriktionsfragmentmuster, die durch HaeIII, HhaII und TaqI entstanden und die vier Basenpaare erkennen, erlaubten eine weitere Differenzierung der Virusisolate. Neun 1976 bis 1983 im Vereinigten Königreich und in Belgien isolierte Hühnerisolate waren identisch und konnten von drei Entenisolaten aus dem Vereinigten Königreich unterschieden werden. Das australische Isolat unterscheidet sich von den europäischen Isolaten außer durch das Fehlen einer DNA (0.4 kbp) an einem Ende des Genom (32.6 kbp) auch bei der Basensequenz. Es werden die Genommuster von EcoRI, BamHI, Kpnl und Pstl für 127 Isolate des EDS mitgeteilt.

Resumen

Diferenciación de aislamientos del virus del síndrome de la caída de la puesta mediante análisis del DNA viral por endonucleasas de restricción

Se compararon trece aislamientos del virus del síndrome de la caída de la puesta (EDS) mediante análisis del DNA viral por endonucleasas de restricción. Un aislamiento australiano en un pollo fue distinguido del resto usando las endonucleasas Eco RI, BamHI, Kpnl, Hindlll, Pstl, PvuII todas las cuales reconocen secuencias de DNA de seis pares de bases. Los modelos electroforéticos obtenidos en gel de poliacri‐lamida mediante las endonucleasas HaeIII, HhaII y TaqI, las cuales reconocen cuatro pares de bases, permitieron una mayor diferenciación de los aislamientos virales. Nueve aislamientos en pollo procedentes del Reino Unido y de Bélgica en el período entre 1976 y 1987 fueron idénticos y se pudieron distinguir de tres aislamientos de patos en el Reino Unido. El aislamiento australiano, además de poseer una delección en el DNA (0.4 kbp) en un extremo del genoma (32.6 kbp) también se diferenció de los aislamientos europeos en la secuencia de bases. Se describen los mapas genómicos obtenidos con EcoRl, BamRI, Kpnl y PstI en el aislamiento 127 del virus EDS.