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Abstract
Omics technologies emerged as complementary strategies to genomics in the attempt to understand human illnesses. In general, proteomics technologies emerged earlier than those of metabolomics for major depressive disorder (MDD) research, but both are driven by the identification of proteins and/or metabolites that can delineate a comprehensive characterization of MDD's molecular mechanisms, as well as lead to the identification of biomarker candidates of all types—prognosis, diagnosis, treatment, and patient stratification. Also, one can explore protein and metabolite interactomes in order to pinpoint additional molecules associated with the disease that had not been picked up initially. Here, results and methodological aspects of MDD research using proteomics, metabolomics, and protein interactomics are reviewed, focusing on human samples.
Las tecnologías “ómicas” aparecieron como estrategías complementarías a la genómica en el intento de comprender las enfermedades humanas. Aunque en general las tecnologías proteómicas surgieron antes que las metabolómicas en la investigación del trastorno depresivo mayor (TDM), ambas están orientadas a la identificación de proteínas ylo metabolítos que permita esbozar una completa caracterización de los mecanismos moleculares del TDM, así como también llevar a la identificación de biomarcadores candidatos de todos los tipos: pronóstico, diagnóstico, tratamiento y estratificación de pacientes. También se pueden explorar interactomas de proteínas y metabolitos para precisar moléculas adicionales, asociadas con la enfermedad, que no han sido identificadas inicialmente. En este artículo se revisan los resultados y aspectos metodológicos de la investigación en el TDM que emplea proteómica, metabolómica e interactómica de proteínas, centrándose en muestras de humanos.
Les technologies dites « omiques » sont apparues pour compléter la génomique afin de comprendre les maladies humaines. D'une façon générale, les technologies protéomiques sont antérieures aux métabolomiques dans la recherche sur l'épisode dépressif caractérisé (EDC) mais les deux sont fondées sur l'identification des protéines etlou des métabolites pour définir une description complète des mécanismes moléculaires de l'EDC et identifier des biomarqueurs candidats de tout type, pronostique, diagnostique, thérapeutique, et pour la stratification des patients. Il est également possible d'analyser les interactomes des protéines et des métabolites afin de repérer d'autres molécules associées à la maladie et non détectées au début. Cet article étudie chez l'homme les résultats et les aspects méthodologiques de la recherche sur l'EDC par la protéomique, la métabolomique et l'interactomique des protéines.
The author declares no conflict of interest and thanks Prof Chris Turck from the Max Planck Institute of Psychiatry, Prof Andrea Schmitt from the Department of Psychiatry and Psychotherapy of the LMU, and Prof Wagner Gattaz from the Institute of Psychiatry of the University of Sao Paulo. The author is funded by FAPESP (Sao Paulo Research Foundation, grant 2013/08711-3).