A Monte Carlo approach for estimation of haplotype probabilities

Riassunto

Un approccio Monte Carlo per la stima delle probabilità aplotipiche – L’obiettivo di questo studio era di stimare le probabilità delle combinazioni di aplotipi per famiglie di mezzi fratelli, con genotipi noti per tutta la progenie e sconosciuti per i genitori. Un algoritmo, basato sul metodo Monte Carlo, è stato implementato e testato. Il software utilizza i genotipi dei mezzi fratelli per determinare la probabilità di ogni possibile combinazione di aplotipi per un genitore ed usa questa informazione per ricostruire gli aplotipi dei mezzi fratelli. È quindi possibile stimare l’effetto degli aplotipi mediante regressione dei fenotipi sulle probabilità degli aplotipi.

Key Words:

• haplotype reconstruction
• casein