Role of non-Condon vibronic coupling and conformation change on two-photon absorption spectra of green fluorescent protein

References

• Tsien , R. Y. 1998 . Annu. Rev. Biochem. , 67 : 509 M. Zimmer, Chem. Rev. 102, 759 (2002); W.B. Frommer, M.W. Davidson, and R.E. Campbell, Chem. Soc. Rev. 38, 2833 (2009); R.N. Day and M.W. Davidson, Chem. Soc. Rev. 38, 2887 (2009) doi: 10.1146/annurev.biochem.67.1.509
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Drobizhev , M. , Makarov , N. S. , Tillo , S. E. , Hughes , T. E. and Rebane , A. 2011 . Nat. Methods , 8 : 393 doi: 10.1038/nmeth.1596
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Drobizhev , M. , Tillo , S. , Makarov , N. S. , Hughes , T. E. and Rebane , A. 2009 . J. Phys. Chem. B , 113 : 855 doi: 10.1021/jp8087379
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Hosoi , H. , Yarnaguchi , S. , Mizuno , H. , Miyawaki , A. and Tahara , T. 2008 . J. Phys. Chem. B , 112 : 2761 doi: 10.1021/jp711628u
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Kamarchik , E. and Krylov , A. I. 2011 . J. Phys. Chem. Lett , 2 : 488 doi: 10.1021/jz101616g
   Web of Science ®Google Scholar
• Drobizhev , M. , Makarov , N. S. , Tillo , S. E. , Hughes , T. E. and Rebane , A. 2012 . J. Phys. Chem. B , 116 : 1736 doi: 10.1021/jp211020k
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Luo , Y. , Ågren , H. , Knuts , S. , Minaev , B. F. and Jorgensen , P. 1993 . Chem. Phys. Lett , 209 : 513 Y. Luo, H. Ågren, S. Knuts, and P. Jorgensen, Chem. Phys. Lett. 213, 356 (1993) doi: 10.1016/0009-2614(93)80126-A
   Web of Science ®Google Scholar
• Voliani , V. , Bizzarri , R. , Nifosi , R. , Abbruzzetti , S. , Grandi , E. , Viappiani , C. and Beltram , F. 2008 . J. Phys. Chem. B , 112 : 10714 K. Nienhaus, H. Nar, R. Heilker, J. Wiedenmann, and G.U. Nienhaus, J. Am. Chem. Soc. 130, 12578 (2008) doi: 10.1021/jp802419h
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Stavrov , S. S. , Solntsev , K. M. , Tolbert , L. M. and Huppert , D. 2006 . J. Am. Chem. Soc , 128 : 1540 R. Nifosi and V. Tozzini, Chem. Phys. 323, 358 (2006); J.N. Henderson, H.-w. Ai, R.E. Campbell, and S.J. Remington, Proc. Nat. Acad. Sci. USA 104, 6672 (2007) doi: 10.1021/ja0555421
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Olsen , S. and Smith , S. C. 2008 . J. Am. Chem. Soc , 130 : 8677 doi: 10.1021/ja078193e
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• He , X. , Bell , A. F. and Tonge , P. J. 2003 . Febs Letters , 549 : 35 doi: 10.1016/S0014-5793(03)00761-0
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Olsen , S. and Smith , S. C. 2007 . J. Am. Chem. Soc , 129 : 2054 doi: 10.1021/ja066430s
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Kent , K. P. and Boxer , S. G. 2011 . J. Am. Chem. Soc , 133 : 4046 doi: 10.1021/ja110256c
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Zhao , K. and Luo , Y. 2010 . J. Phys. Chem. B , 114 : 13167 doi: 10.1021/jp103527q
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Frisch , M. J. , Trucks , G. W. , Schlegel , H. B. , Scuseria , G. E. , Robb , M. A. , Cheeseman , J. R. , Scalmani , G. , Barone , V. , Mennucci , B. , Petersson , G. A. , Nakatsuji , H. , Caricato , M. , Li , X. , Hratchian , H. P. , Izmaylov , A. F. , Bloino , J. , Zheng , G. , Sonnenberg , J. L. , Hada , M. , Ehara , M. , Toyota , K. , Fukuda , R. , Hasegawa , J. , Ishida , M. , Nakajima , T. , Honda , Y. , Kitao , O. , Nakai , H. , Vreven , T. , Montgomery , J. A. Jr. , Peralta , J. E. , Ogliaro , F. , Bearpark , M. , Heyd , J. J. , Brothers , E. , Kudin , K. N. , Staroverov , V. N. , Kobayashi , R. , Normand , J. , Raghavachari , K. , Rendell , A. , Burant , J. C. , Iyengar , S. S. , Tomasi , J. , Cossi , M. , Rega , N. , Millam , J. M. , Klene , M. , Knox , J. E. , Cross , J. B. , Bakken , V. , Adamo , C. , Jaramillo , J. , Gomperts , R. , Stratmann , R. E. , Yazyev , O. , Austin , A. J. , Cammi , R. , Pomelli , C. , Ochterski , J. W. , Martin , R. L. , Morokuma , K. , Zakrzewski , V. G. , Voth , G. A. , Salvador , P. , Dannenberg , J. J. , Dapprich , S. , Daniels , A. D. , Farkas , O. , Foresman , J. B. , Ortiz , J. V. , Cioslowski , J. and Fox , D. J. 2009 . Gaussian 09 , Wallingford CT : Gaussian, Inc .
   Google Scholar
• Andersson , K. M. , Malmqvist , P. -Å and Roos , B. O. 1992 . J. Chem. Phys , 96 : 1218 doi: 10.1063/1.462209
   Web of Science ®Google Scholar
• Karlström , G. , Lindh , R. , Malmqvist , P. -Å. , Roos , B. O. , Ryde , U. , Veryazov , V. , Widmark , P. O. , Cossi , M. , Schimmelpfennig , B. , Neogrady , P. and Seijo , L. 2003 . Comput. Mater. Sci , 28 : 222 doi: 10.1016/S0927-0256(03)00109-5
   Web of Science ®Google Scholar
• 2005 . DALTON, a molecular electronic structure program, Release 2.0 see http://www.kjemi.uio.no/software/dalton/dalton.html
   Google Scholar
• Tian , G. , Duan , S. , Hua , W. and Luo , Y. 2012 . DynaVib, Version 1.0 , Sweden : Royal Institute of Technology .
   Google Scholar
• Ruhoff , P. T. and Ratner , M. A. 2000 . Int. J. Quantum Chem , 77 : 383 doi: 10.1002/(SICI)1097-461X(2000)77:1<383::AID-QUA38>3.0.CO;2-0
   Web of Science ®Google Scholar
• Ai , Y. -j. , Tian , G. , Liao , R. -z. , Zhang , Q. , Fang , W. -h. and Luo , Y. 2011 . ChemPhysChem , 12 : 2899 doi: 10.1002/cphc.201100663
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Chen , X. , Tian , G. , Rinkevicius , Z. , Vahtras , O. , Cao , Z. , Ågren , H. and Luo , Y. 2012 . Chem. Phys , 405 : 40 doi: 10.1016/j.chemphys.2012.06.004
   Web of Science ®Google Scholar
• Nemukhin , A. V. , Grigorenko , B. L. and Savitskii , A. P. 2009 . Acta Nat , 2
   Google Scholar
• Nielsen , S. B. , Lapierre , A. , Andersen , J. U. , Pedersen , U. V. , Tomita , S. and Andersen , L. H. 2001 . Phys. Rev. Lett , 87 A. Sinicropi, T. Andruniow, N. Ferre, R. Basosi, and M. Olivucci, J. Am. Chem. Soc. 127, 11534 (2005).
   Google Scholar
• Altoe , P. , Bernardi , F. , Garavelli , M. , Orlandi , G. and Negri , F. 2005 . J. Am. Chem. Soc , 127 : 3952 doi: 10.1021/ja0451517
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Lin , N. , Luo , Y. , Ruud , K. , Zhao , X. , Santoro , F. and Rizzo , A. 2011 . ChemPhysChem , 12 : 3392 doi: 10.1002/cphc.201100500
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Forbes , M. W. and Jockusch , R. A. 2009 . J. Am. Chem. Soc , 131 : 17038 doi: 10.1021/ja9066404
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Macak , P. , Luo , Y. and Ågren , H. 2000 . Chem. Phys. Lett , 330 : 447 P. Macak, Y. Luo, P. Norman, and H. Å gren, J. Chem. Phy. 113, 7055 (2000); A. Painelli, L. Del Freo, and F. Terenziani, Chem. Phys. Lett. 346, 470 (2001). doi: 10.1016/S0009-2614(00)01096-4
   Web of Science ®Google Scholar
• Ai , Y. -J. , Zhang , F. , Chen , S. -F. , Luo , Y. and Fang , W. -H. 2010 . J. Phys. Chem. Lett , 1 : 743 doi: 10.1021/jz900434z
   Web of Science ®Google Scholar