538
Views
15
CrossRef citations to date
0
Altmetric
Original Articles

Modelling and Bioinformatics Analysis of the Dimeric Structure of House Dust Mite Allergens from Families 5 and 21: Der f 5 Could Dimerize as Der p 5

, , &
Pages 663-675 | Received 16 May 2011, Published online: 11 Jul 2012

References

  • Meno , K. , Thorsted , P. B. , Ipsen , H. , Kristensen , O. , Larsen , J. N. , Spangfort , M. D. , Gajhede , M. and Lund , K. 2005 . J Immunol , 175 : 3835 – 3845 .
  • de Halleux , S. , Stura , E. , VanderElst , L. , Carlier , V. , Jacquemin , M. and Saint-Remy , J.-M. 2006 . J Allergy Clin Immunol , 117 : 571 – 576 .
  • Mueller , G. A. , Benjamin , D. C. and Rule , G. S. 1998 . Biochemistry , 37 : 12707 – 12714 .
  • Mueller , G. A. , Gosavi , R. A. , Krahn , J. M. , Edwards , L. L. , Cuneo , M. J. , Glesner , J. , Pomés , A. , Chapman , M. D. , London , R. E. and Pedersen , L. C. 2010 . J Biol Chem , 285 : 25394 – 25401 .
  • Mueller , G. A. , Edwards , L. L. , Aloor , J. J. , Fessler , M. B. , Glesner , J. , Pomés , A. , Chapman , M. D. , London , R. E. and Pedersen , L. C. 2010 . J Allergy Clin Immunol , 125 : 909 – 917 . e4
  • Chruszcz , M. , Chapman , M. D. , Vailes , L. D. , Stura , E. A. , Saint-Remy , J.-M. , Minor , W. and Pomés , A. 2009 . J Mol Biol , 386 : 520 – 530 .
  • Johannessen , B. R. , Skov , L. K. , Kastrup , J. S. , Kristensen , O. , Bolwig , C. , Larsen , J. N. , Spangfort , M. , Lund , K. and Gajhede , M. 2005 . FEBS Lett , 579 : 1208 – 1212 .
  • Chan , S. L. , Ong , S. T. , Ong , S. Y. , Chew , F. T. and Mok , Y. K. 2006 . J Immunol , 176 : 4852 – 4860 .
  • Naik , M. T. , Chang , C.-F. , Kuo , I.-C. , Kung , C. C.-H. , Yi , F.-C. , Chua , K.-Y. and Huang , T.-H. 2008 . Structure , 16 : 125 – 136 .
  • Chan , S. L. , Ong , T. C. , Gao , Y. F. , Tiong , Y. S. , Wang , D. Y. , Chew , F. T. and Mok , Y. K. 2008 . J Immunol , 181 : 2586 – 2596 .
  • Thomas , W. R. , Hales , B. J. and Smith , W. A. 2005 . Curr Allergy Asthma , 5 : 388 – 393 .
  • Weghofer , M. , Dall'Antonia , Y. , Grote , M. , Stçcklinger , A. , Kneidinger , M. , Balie , N. , Krauth , M.-T. , Fernández-Caldas , E. , Thomas , W. R. , van Hage , M. , Vieths , S. , Spitzauer , S. , Horak , F. , Svergun , D.-I. , Konarev , P.-V. , Valent , P. , Thalhamer , J. , Keller , W. , Valenta , R. and Vrtala , S. 2008 . Allergy , 63 : 758 – 767 .
  • Larkin , M. A. , Blackshields , G. , Brown , N. P. , Chenna , R. , McGettigan , P. A. , McWilliam , H. , Valentin , F. , Wallase , I. M. , Wilm , A. , Lopez , R. , Thompson , J. D. , Gibson , T. J. and Higgins , D. G. 2007 . Bioinformatics , 23 : 2947 – 2948 .
  • Altschul , S. F. , Madden , T. L. , Sch , A. A. , Zhang , J. , Miller , W. and Lipman , D. J. 1997 . Nucleic Acids Res , 25 : 3389 – 3402 .
  • Sali , A. and Blundell , T. L. 1993 . J Mol Biol , 234 : 779 – 815 .
  • Rose , P. W. , Beran , B. , Bi , C. , Bluhm , W. F. , Dimitropoulos , D. , Goodsell , D. S. , Prlic , A. , Quesada , M. , Quinn , G. B. , Westbrook , J. D. , Young , J. , Yukich , B. , Zardecki , C. , Berman , H. M. and Bourne , P. E. 2011 . Nucleic Acids Res , 39 : D392 – D401 .
  • Van Der Spoel , D. , Lindahl , E. , Hess , B. , Groenhof , G. , Mark , A. E. and Berendsen , H. J. C. 2005 . J Comput Chem , 26 : 1701 – 1718 .
  • Melo , F. and Feytmans , E. 1998 . J Mol Biol , 277 : 1141 – 1152 .
  • Kozakov , D. , Brenke , R. , Comeau , S. R. and Vajda , S. 2006 . Proteins , 65 : 392 – 406 .
  • Kozakov , D. , Hall , D. R. , Beglov , D. , Brenke , R. , Comeau , S. R. , Shen , Y. , Li , K. , Zheng , J. , Vakili , P. , Paschalidis , I. C. and Vajda , S. 2010 . Proteins , 78 : 3124 – 3130 .
  • Kabsch , W. 1978 . Acta Crystallogr Sect A , 34 : 827 – 828 .
  • Tina , K. G. , Bhadra , R. and Srinivasan , N. 2007 . Nucleic Acids Res , 35 : W473 – 476 .
  • Dundas , J. , Ouyang , Z. , Tseng , J. , Binkowski , A. , Turpaz , Y. and Liang , J. 2006 . Nucleic Acids Res , 34 : W116 – 118 .
  • Jacquet , A. 2011 . Trends Mol Med , In press