References
- Uversky , V. N. , Oldfield , C. J. and Dunker , A. K. 2005 . J Mol Recognit , 18 : 343 – 384 .
- Liu , J. , Perumal , N. B. , Oldfield , C. J. , Su , E. W. , Uversky , V. N. and Dunker , A. K. 2006 . Biochemistry-Us , 45 : 6873 – 6888 .
- Galea , C. A. , Wang , Y. , Sivakolundu , S. G. and Kriwacki , R. W. 2008 . Biochemistry-Us , 47 : 7598 – 7609 .
- Fuxreiter , M. , Tompa , P. , Simon , I. , Uversky , V. N. , Hansen , J. C. and Asturias , F. J. 2008 . Nature Chemical Biology , 4 : 728 – 737 .
- Dunker , A. K. , Cortese , M. S. , Romero , P. , Iakoucheva , L. M. and Uversky , V. N. 2005 . The FEBS Journal , 272 : 5129 – 5148 .
- Wright , P. E. and Dyson , H. J. 1999 . J Mol Biol , 293 : 321 – 331 .
- Xie , H. , Vucetic , S. , Iakoucheva , L. M. , Oldfield , C. J. , Dunker , A. K. , Uversky , V. N. and Obradovic , Z. 2007 . J Proteome Res , 6 : 1882 – 1898 .
- Dunker , A. K. , Obradovic , Z. , Romero , P. , Garner , E. C. and Brown , C. J. 2000 . Genome informatics. Workshop on Genome Informatics , 11 : 161 – 171 .
- Sussman , J. L. , Dunker , A. K. , Silman , I. and Uversky , V. N. 2008 . Curr Opin Struc Biol , 18 : 756 – 764 .
- Ward , J. J. , Sodhi , J. S. , McGuffin , L. J. , Buxton , B. F. and Jones , D. T. 2004 . J Mol Biol , 337 : 635 – 645 .
- Iakoucheva , L. M. , Brown , C. J. , Lawson , J. D. , Obradovic , Z. and Dunker , A. K. 2002 . J Mol Biol , 323 : 573 – 584 .
- Raychaudhuri , S. , Dey , S. , Bhattacharyya , N. P. and Mukhopadhyay , D. 2009 . PLoS One , 4 : e5566
- Uversky , V. N. , Oldfield , C. J. and Dunker , A. K. 2008 . Ann Rev Biophys , 37 : 215 – 246 .
- Eliezer , D. 2009 . Curr Opin Struc Biol , 19 : 23 – 30 .
- Longhi , S. , Bourhis , J. M. and Canard , B. 2007 . Curr Protein Pept Sc , 8 : 135 – 149 .
- Turoverov , K. K. , Kuznetsova , I. M. and Uversky , V. N. 2010 . Prog Biophys Mol Bio , 102 : 73 – 84 .
- Uversky , V. N. and Dunker , A. K. 2010 . Bba-Proteins Proteom , 1804 : 1231 – 1264 .
- Wright , P. E. and Dyson , H. J. 2009 . Curr Opin Struc Biol , 19 : 31 – 38 .
- Receveur-Brechot , V. , Bourhis , J. M. , Uversky , V. N. , Canard , B. and Longhi , S. 2006 . Proteins , 62 : 24 – 45 .
- He , B. , Wang , K. J. , Liu , Y. L. , Xue , B. , Uversky , V. N. and Dunker , A. K. 2009 . Cell Res , 19 : 929 – 949 .
- Peng , K. , Radivojac , P. , Vucetic , S. , Dunker , A. K. and Obradovic , Z. 2006 . BMC Bioinformatics , 7 : 208
- Radivojac , P. , Obradovic , Z. , Smith , D. K. , Zhu , G. , Vucetic , S. , Brown , C. J. , Lawson , J. D. and Dunker , A. K. 2004 . Protein Sci , 13 : 71 – 80 .
- Romero , P. , Obradovic , Z. and Dunker , K. 1997 . Genome Informatics. Workshop on Genome Informatics , 8 : 110 – 124 .
- Cheng , J. L. , Sweredoski , M. J. and Baldi , P. 2005 . Data Min Knowl Disc , 11 : 213 – 222 .
- Dosztanyi , Z. , Csizmok , V. , Tompa , P. and Simon , I. 2005 . Bioinformatics , 21 : 3433 – 3434 .
- Feng , Z. P. , Han , P. F. and Zhang , X. Z. 2009 . BMC Bioinformatics , 10
- Hirose , S. , Shimizu , K. , Kanai , S. , Kuroda , Y. and Noguchi , T. 2007 . Bioinformatics , 23 : 2046 – 2053 .
- Mizianty , M. J. , Stach , W. , Chen , K. , Kedarisetti , K. D. , Disfani , F. M. and Kurgan , L. 2010 . Bioinformatics , 26 : i489 – i496 .
- Obradovic , Z. , Peng , K. , Vucetic , S. , Radivojac , P. and Dunker , A. K. 2005 . Proteins , 61 ( Suppl. 7 ) : 176 – 182 .
- Pollastri , G. , Vullo , A. , Bortolami , O. and Tosatto , S. C. E. 2006 . Nucleic Acids Research , 34 : W164 – W168 .
- Romero , P. , Obradovic , Z. , Li , X. H. , Garner , E. C. , Brown , C. J. and Dunker , A. K. 2001 . Proteins-Structure Function and Genetics , 42 : 38 – 48 .
- Shimizu , K. , Hirose , S. and Noguchi , T. 2007 . Bioinformatics , 23 : 2337 – 2338 .
- Zhang , T. , Faraggi , E. and Zhou , Y. Q. 2010 . Proteins , 78 : 3353 – 3362 .
- Faraggi , E. , Zhang , T. , Yang , Y. , Kurgan , L. and Zhou , Y. 2012 . J Computational Chemistry , doi: 10.1002/jcc.21968 (Epub ahead of print)
- Dor , O. and Zhou , Y. 2007 . Proteins , 66 : 838 – 845 .
- Faraggi , E. , Xue , B. and Zhou , Y. 2009 . Proteins , 74 : 847 – 856 .
- Schlessinger , A. , Punta , M. and Rost , B. 2007 . Bioinformatics , 23 : 2376 – 2384 .
- Sirota , F. L. , Ooi , H. S. , Gattermayer , T. , Schneider , G. , Eisenhaber , F. and Maurer-Stroh , S. 2010 . BMC Genomics , 11 ( Suppl. 1 ) S15
- Vucetic , S. , Brown , C. J. , Dunker , A. K. and Obradovic , Z. 2003 . Proteins , 52 : 573 – 584 .
- Sickmeier , M. , Hamilton , J. A. , LeGall , T. , Vacic , V. , Cortese , M. S. , Tantos , A. , Szabo , B. , Tompa , P. , Chen , J. , Uversky , V. N. , Obradovic , Z. and Dunker , A. K. 2007 . Nucleic Acids Research , 35 : D786 – 793 .
- Schlessinger , A. , Punta , M. , Yachdav , G. , Kajan , L. and Rost , B. 2009 . PLoS One , 4
- Monastyrskyy , B. , Fidelis , K. , Moult , J. , Tramontano , A. and Kryshtafovych , A. 2011 . Proteins , 79 ( Suppl. 10 ) : 107 – 18 .
- Faraggi , E. , Yang , Y. D. , Zhang , S. S. and Zhou , Y. 2009 . Structure , 17 : 1515 – 1527 .
- Zupan , J. 1994 . Acta Chimica Slovenica , 41 : 327 – 354 .
- Meiler , J. , Müller , M. , Zeidler , A. and Schmäschke , F. 2001 . J Mol Model , 7 : 360 – 369 .
- Altschul , S. F. , Madden , T. L. , Schaffer , A. A. , Zhang , J. H. , Zhang , Z. , Miller , W. and Lipman , D. J. 1997 . Nucleic Acids Research , 25 : 3389 – 3402 .
- Wootton , J. C. 1994 . Curr Opin Struc Biol , 4 : 413 – 421 .
- Vucetic , S. , Obradovic , Z. , Vacic , V. , Radivojac , P. , Peng , K. , Iakoucheva , L. M. , Cortese , M. S. , Lawson , J. D. , Brown , C. J. , Sikes , J. G. , Newton , C. D. and Dunker , A. K. 2005 . Bioinformatics , 21 : 137 – 140 .
- Noivirt-Brik , O. , Prilusky , J. and Sussman , J. L. 2009 . Proteins , 77 ( Suppl. 9 ) : 210 – 216 .
- McGuffin , L. J. 2008 . Bioinformatics , 24 : 1798 – 1804 .
- Li , X. , Romero , P. , Rani , M. , Dunker , A. K. and Obradovic , Z. 1999 . Genome Informatics. Workshop on Genome Informatics , 10 : 30 – 40 .
- Hecker , J. , Yang , J. Y. and Cheng , J. L. 2007 . BMC Genomics , 9
- Ward , J. J. , Sodhi , J. S. , McGuffin , L. J. , Buxton , B. F. and Jones , D. T. 2004 . J Mol Biol , 337 : 635 – 645 .
- Schlessinger , A. , Liu , J. and Rost , B. 2007 . PLoS Computational Biology , 3 : e140
- Xue , B. , Dunbrack , R. L. , Williams , R. W. , Dunker , A. K. and Uversky , V. N. 2010 . Biochimica et Biophysica Acta , 1804 : 996 – 1010 .
- Mizianty , M. J. , Zhang , T. , Xue , B. , Zhou , Y. Q. , Dunker , A. K. , Uversky , V. N. and Kurgan , L. 2011 . BMC Bioinformatics , 12
- Mohan , A. , Oldfield , C. J. , Radivojac , P. , Vacic , V. , Cortese , M. S. , Dunker , A. K. and Uversky , V. N. 2006 . J Mol Biol , 362 : 1043 – 1059 .
- Oldfield , C. J. , Cheng , Y. G. , Cortese , M. S. , Romero , P. , Uversky , V. N. and Dunker , A. K. 2005 . Biochemistry-Us , 44 : 12454 – 12470 .
- Vacic , V. , Oldfield , C. J. , Mohan , A. , Radivojac , P. , Cortese , M. S. , Uversky , V. N. and Dunker , A. K. 2007 . J Proteome Res , 6 : 2351 – 2366 .
- Cheng , Y. , Oldfield , C. J. , Meng , J. , Romero , P. , Uversky , V. N. and Dunker , A. K. 2007 . Biochemistry-Us , 46 : 13468 – 13477 .
- Garner , E. , Romero , P. , Dunker , A. K. , Brown , C. and Obradovic , Z. 1999 . Genome Inform Ser Workshop Genome Inform , 10 : 41 – 50 .
- Obradovic , Z. , Peng , K. , Vucetic , S. , Radivojac , P. , Brown , C. J. and Dunker , A. K. 2003 . Proteins-Structure Function and Genetics , 53 : 566 – 572 .
- Le Gall , T. , Romero , P. R. , Cortese , M. S. , Uversky , V. N. and Dunker , A. K. 2007 . J Biomol Struct Dyn , 24 : 325 – 341 .