References and Footnotes
- Saenger , W. 1984 . Principles of Nucleic Acid Structure New York : Springer-Verlag .
- Chandrasekaran , R. and Arnott , S. 1989 . Landolt-Bornstein, Group VII, Vol lb Edited by: Saenger , W. Berlin : Springer-Verlag .
- Shakked , Z. and Rabinovich , D. 1986 . Prog. Biophys. Molec. Biol. , 47 : 159
- Dickerson , R. E. and Drew , H. R. 1981 . J. Mol. Biol. , 149 : 761
- Nelson , H. C.M. , Finch , J. T. , Luisi , B. F. and Klug , A. 1987 . Nature , 330 : 221
- Clark , G. R. , Brown , D. G. , Sanderson , M. R. , Chwalinski , T. , Neidle , S. , Veal , J. M. , Jones , R. L. , Wilson , W. D. , Zon , G. , Garman , E. and Stuart , D. I. 1990 . Nucleic Acids Res. , 18 : 5521
- Tilton , R. F. , Weiner , P. K. and Kollman , P. A. 1983 . Biopolymers , 22 : 696
- Rao , S. H. and Kollman , P. A. 1985 . J. Amer. Chem. Soc. , 107 : 1611
- Tilton , R. F. , Weiner , P. K. and Kollman , P. A . 1983 . Biopolymers , 22 : 969
- Levitt , M. Cold Spring Harbor Symposium , 47 251 (1982)
- van Gunsteren , W. F. , Berendsen , H. J.C. , Geurtsen , R. G. and Zwinderman , H. R.J. 1986 . Annals New York Acad, of Sci. , 482 : 286
- Seibel , G. L. , Singh , U. C. and Kollman , P. A . 1985 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 82 : 6532
- Ravishanker , G. , Swaminathan , S. , Beveridge , D. L. , Lavery , R. and Sklenar , H. 1989 . J. Biomol Struct. Dynamics , 6 : 669
- Rao , S. N. and Kollman , P. 1990 . Biopolymers , 29 : 517
- Singh , I. C. , Weiner , S. J. and Kollman , P. 1985 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 82 : 755
- Tidor , B. , Irikura , K. K. , Brooks , B. R. and Karplus , M. 1983 . J. Biomol. Struc. Dynamics , 1 : 231
- Prabhakaran , M. and Harvey , S. C. 1985 . J. Phys. Chem. , 89 : 5767
- Prabhakaran , M. and Harvey , S. C. 1988 . Biopolymers , 27 : 1239
- Rao , S. N. and Kollman , P. A. 1987 . Proc. Natl Acad. Sci. USA , 84 : 5735
- Cieplak , P. , Rao , S. N. , Grootenhuis , P. D.J. and Kollman , P. A. 1990 . Biopolymers , 29 : 717
- Rosenberg , J. M. , Seeman , N. C. , Day , R. O. and Rich , A. 1976 . J. Mol. Biol , 104 : 145
- Shieh , H.-S. , Berman , H. M. , Dabrow , M. and Neidle , S. 1980 . Nucl. Acids Res. , 8 : 85
- Neidle , S. , Berman , H. M. and Shieh , H. S. 1980 . Nature , 288 : 129
- Mezei , M. , Beveridge , D. L. , Berman , H. M. , Goodfellow , J. M. , Finney , J. L. and Neidle , S. 1983 . J. Biomol. Struct. Dynamics , 1 : 287
- Subramanian , P. S. , Pitchumani , S. , Beveridge , D. L. and Berman , H. M. 1990 . Biopolymers , 29 : 771
- Swaminathan , S. , Beveridge , D. L. and Berman , H. M. 1990 . J. Phys. Chem. , 94 : 4660
- Singh , U. C. , Weiner , P. K. , Caldwell , J. W. and Kollman , P. A. 1986 . AMBER (UCSF) version 3.1 Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California at San Francisco .
- Weiner , S. J. , Kollman , P. A. , Case , D. A. , Singh , U. C. , Alagona , G. , Profeta , S. Jr. and Weiner , P. 1984 . J. Am. Chem. Soc. , 106 : 765
- Weiner , S. J. , Kollman , P. A. , Nguyen , D. T. and Case , D. A . 1986 . J. Comp. Chem. , 7 : 230
- Jorgensen , W. L. , Chandrasekhan , J. , Madua , J. D. , Impey , R. W. and Klein , M. L. 1983 . J. Chem. Phys. , 70 : 926
- Heinzinger , K. and Vogel , P. C. 1976 . Z. Naturforsch , 31a : 463
- Singh , V. C. and Kollman , P. 1984 . J. Comp. Chem. , 5 : 129
- Prabhakaran , M. , Harvey , S. C. and McCammon , J. A . 1985 . Biopolymers , 24 : 1189
- Harvey , S. C. , Prabhakaran , M. and McCammon , J. A . 1985 . Biopolymers , 24 : 1169
- Holbrook , S. R. and Kim , S.-H. 1984 . J. Mol. Biol. , 173 : 361
- Aggarwal , A. K. and Neidle , S. 1985 . Nucleic Acids Res. , 13 : 5671
- van Gunsteren , W. F. and Karplus , M. 1982 . Biochemistry , 21 : 2259
- van Gunsteren , W. F. , Berendesen , H. J.C. , Herman , S. J. , Hol , W. G.J. and Postma , J. P.M. 1983 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 80 : 4315
- Holbrook , S. R. , Wang , A. H.-J. , Rich , A. and Kim , S.-H. 1988 . J. Mol. Biol. , 199 : 349
- Tang , P. , Juang , C.-L. and Harbison , G. S. 1988 . Science , 249 : 70