References and Footnotes
- Kahl , G. , ed. 1988 . Architecture of Eukaryotic Genes Weinheim , , FRG : VCH Verlagsgesellschaft .
- van Holde , K. E. 1989 . Chromatin New York , NY : Springer Verlag Inc. .
- Wassarman , P. M. and Kornberg , R. D. 1989 . Methods in Enzymology Vol. 170 , San Diego : Academic Press .
- Simpson , R. T. 1991 . Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology Vol. 40 , 143 – 184 .
- Lorch , Y. , LaPointe , J. W. and Kornberg , R. D. 1987 . Cell , 49 : 203 – 210 .
- Simpson , R. T. 1990 . Nature , 343 : 387 – 389 .
- Thoma , F. 1992 . Biochimica et Biophysica Acta , 1130 : 1 – 19 .
- Kornberg , R. D. and Stryer , L. 1988 . Nucl. Acids Res. , 16 : 6677 – 6690 .
- Fedor , M. J. , Lue , N. F. and Romberg , R. D. 1988 . J. Mol. Biol. , 204 : 109 – 127 .
- Roth , S. Y. , Dean , A. and Simpson , R. T. 1990 . Mol. Cell. Biol. , 10 : 2247 – 2260 .
- Kunkel , G. R. and Martinson , H. G. 1981 . Nucl. Acids Res. , 9 : 6869 – 6888 .
- Widmer , R. M. , Lezzi , M. and Koller , T. 1987 . EMBO J. , 6 : 743 – 748 .
- Thoma , F. and Zatchej , M. 1988 . Cell , 55 : 945 – 953 .
- Meersseman , G. , Pennings , S. and Bradbury , E. M. 1991 . J. Mol. Biol. , 220 : 89 – 100 .
- Soumpasis , D. M. 1985 . J. Biomol. Str. Dyn. , 3 : 1 – 10 .
- Travers , A. A. 1987 . Trends in Biochemical Sciences , 12 : 108 – 112 .
- Travers , A. A. 1989 . Annu. Rev. Biochem. , 58 : 427 – 452 .
- Travers , A. A. 1991 . Current Opinion in Structural Biology , 1 : 114 – 122 .
- Trifonov , E. N. 1991 . Trends in Biochemical Sciences , 16 : 467 – 470 .
- Olson , W. K. , Sarma , M. H. , Sarma , R. H. and Sundaralingam , M. 1988 . Structure & Expression Edited by: Olson , W. K. , Sarma , M. H. , Sarma , R. H. and Sundaralingam , M. Vol. 3 , Guilderland , NY : Adenine Press . DNA Bending & Curvature
- Hagerman , P. J. 1992 . Biochimica et Biophysica Acta , 1131 : 125 – 132 .
- Calladine , C. R. and Drew , H. R. 1986 . J. Mol. Biol. , 192 : 907 – 918 .
- Mengeritsky , G. and Trifonov , E. M. 1983 . Nucl. Acids Res. , 11 : 3833 – 3851 .
- Zhurkin , V. B. 1985 . J. Biomol. Str. Dyn. , 2 : 785 – 804 .
- Zhurkin , V. B. , Ulyanov , N. B. and Ivanov , V. I. 1988 . Structure & Expression Edited by: Olson , W. K. , Sarma , M. H. , Sarma , R. H. and Sundaralingam , M. Vol. 3 , 169 – 190 . Guilderland , NY : Adenine Press . DNA Bending & Curvature
- Trifonov , E. N. and Mengeritsky , G. 1987 . Structure & Expression Edited by: Olson , W. K. , Sarma , M. H. , Sarma , R. H. and Sundaralingam , M. Vol. 3 , 159 – 167 . NY : Adenine Press Guilderland . DNA Bending & Curvature
- Ioshikes , I. and Trifonov , E. N. 1993 . Nucl. Acids Res. , 21 : 4857 – 4859 .
- Drew , H. R. and McCall , M. J. 1987 . J. Mol. Biol. , 197 : 485 – 511 .
- Drew , H. R. and Calladme , C. R. 1987 . Mol. Biol. , 195 : 143 – 173 .
- Uberbacher , E. C. , Harp , J. M. and Bunick , G. J. 1988 . J. Biomol. Str. Dyn. , 6 : 105 – 120 .
- Satchwell , S. C. , Drew , H. R. and Travers , A. A. 1986 . J. Mol. Biol. , 191 : 659 – 675 .
- Calladine , C. R. 1982 . J. Mol. Biol. , 161 : 343 – 352 .
- Dickerson , R. E. 1983 . J. Mol. Biol. , 166 : 419 – 441 .
- Ulanovsky , L. E. and Trifonov , E. N. 1987 . Nature , 326 : 720 – 722 .
- Tung , C.-S. and Harvey , S. C. 1986 . J. Biol. Chem. , 261 : 3700 – 3709 .
- Srinivasan , A. R. and Olson , W. K. 1987 . J. Biomol. Str. Dyn. , 4 : 895 – 938 .
- Srinivasan , A. R. , Torres , R. , Clark , W. and Olson , W. K. 1987 . J. Biomol. Str. Dyn. , 5 : 459 – 493 .
- Bolshoy , A. , McNamara , P. , Harrington , R. E. and Trifonov , E. N. 1991 . Biochemistry , 88 : 2312 – 2316 .
- Carr , K. D. and Richard-Foy , H. 1990 . Proc. Nat. Acad. Sei., U.S.A. , 87 : 9300 – 9304 .
- Sachs , L. 1974 . Angewandte Statistik Berlin , , FRG : Springer Verlag .
- Sokal , R. R. and Rohlf , F. J. 1981 . Biometry 440 – 445 . San Franciso , CA : W.H. Freeman .
- Richmond , T. J. , Finch , J. T. , Rushton , B. , Rhodes , D. and Klug , A. 1984 . Nature , 311 : 532 – 537 .
- Gale , J. M. and Smerdon , M. J. 1988 . J. Mol. Biol. , 204 : 949 – 958 .
- Dickerson , R. E. and Drew , H. R. 1981 . J. Mol. Biol. , 149 : 761 – 786 .
- Drew , H. R. , Wing , R. M. , Takano , T. , Broka , C. , Tanaka , S. , Itakura , K. and Dickerson , R. E. 1981 . Proc. Nat. Acad. Sci., U.S.A. , 78 : 2179 – 2183 .
- Zhurkin , V. B. , Gorin , A. A. , Charakhchyan , A. A. and Ulyanov , N. B. 1990 . Theoretical Biochemistry and Molecular Biophysics Edited by: Beveridge , D. L. and Lavery , R. 409 – 429 . Guilderland , NY : Adenine Press .
- Ulyanov , N. B. and Zhurkin , V. B. 1984 . J. Biomol. Str. Dyn. , 2 : 361 – 385 .
- Burks , C. , Cassidy , M. , Cinkosky , M. J. , Cumella , K. E. , Gilna , P. , Hayden , J. E.-D. , Keen , G. M. , Kelley , T. A. , Kristofferson , D. and Ryals , J. 1991 . Nucl. Acids Res. , 19 : 2221 – 2225 .
- Cavalier-Smith , T. 1985 . The evolution of genome siz. 69 – 104 . New York , NY : John Wiley Sons .
- Cartwright , I. L. and Elgin , S. C.R. 1986 . Mol. Cell. Biol. , 6 : 779 – 791 .
- Simpson , R. T. and Stafford , D. W. 1983 . Proc. Nat. Acad. Sci., U.S.A. , 80 : 51 – 55 .
- Karlin , S. and Brendel , V. 1992 . Science , 257 : 39 – 49 .
- Stormo , G. D. 1988 . Ann. Rev. Biophys. Chem. , 17 : 241 – 263 .
- Dong , F. , Hansen , J. C. and Van Holde , K. E. 1990 . Proc. Nat. Acad. Sci., U.S.A. , 87 : 5724 – 5728 .
- Tan , R. K. and Harvey , S. C. 1987 . J. Biomol. Str. Dyn. , 5 : 497 – 512 .
- Satchwell , S. C. and Travers , A. A. 1989 . EMBO J. , 8 : 229 – 238 .
- Ambrose , C. , Lowman , H. , Rajadhyaksha , A. , Blasquez , V. and Bina , M. 1990 . J. Mol. Biol. , 214 : 875 – 884 .
- Pina , B. , Brueggemeier , U. and Beato , M. 1990 . Cell , 60 : 719 – 731 .
- Shrader , T. E. and Crothers , D. M. 1990 . J. Mol. Biol. , 216 : 69 – 84 .
- Sarma , R. 1988 . J. Biomol. Str. Dyn. , 6 : 391 – 395 . see also EMBO J. 8, 1–4 (1989)
- McNamara , P. T. , Winicov , I. and Harrington , R. E. 1986 . Biochem. Biophys. Res. Comm. , 138 : 110 – 117 .
- Losa , R. and Brown , D. D. 1987 . Cell , 50 : 801 – 808 .
- Ramsay , N. , Felsenfeld , G. , Rushton , B. M. and McGhee , J. D. 1984 . EMBO J. , 3 : 2605 – 2611 .
- Ramsay , N. 1986 . J. Mol. Biol. , 189 : 179 – 188 .
- Estruch , F. , Perez-Ortin , J. E. , Matallana , E. , Rodriguez , J. L. and Franco , L. 1989 . Plasmid , 22 : 143 – 150 .
- Pavlovic , B. and Hoerz , W. 1988 . Mol. Cell. Biol. , 8 : 5513 – 5520 .
- Bitter , G. A. and Egan , K. M. 1984 . Gene , 32 : 263 – 274 .
- Martinez-Garcia , J. F. , Estruch , F. and Perez-Ortin , J. E. 1989 . Mol. Gen. Genet. , 217 : 464 – 470 .
- Thoma , F. 1986 . J. Mol. Biol. , 190 : 177 – 190 .
- Bajwa , W. , Meyhack , B. , Rudolph , H. , Schweingruber , A.-M. and Hinnen , A. 1984 . Nucl. Acids Res. , 12 : 7721 – 7739 .
- Amer , A. and Hörz , W. 1986 . EMBO J. , 5 : 2681
- Bergman , L. W. 1986 . Mol. Cell. Biol. , 6 : 2298 – 2304 .
- Veit , B. E. and Fangman , W. L. 1985 . Mol. Cell. Biol. , 5 : 2190 – 2196 .
- Perez-Ortin , J. E. , Estruch , F. , Matallana , E. and Franco , L. 1986 . FEBS , 208 : 31 – 33 .
- Thoma , F. , Bergman , L. W. and Simpson , R. T. 1984 . J. Mol. Biol. , 177 : 715 – 733 .
- Long , C. M. , Brajkovich , C. M. and Scott , J. F. 1985 . Mol. Cell. Biol. , 5 : 3124 – 3130 .
- Ewel , A. , Jackson , J. R. and Benyajati , C. 1990 . Nucl. Acids Res. , 18 : 1771 – 1781 .
- Cartwright , I. L. 1987 . EMBO J. , 6 : 3097 – 3101 .
- Udvardy , A. and Schedl , P. 1984 . J. Mol. Biol. , 172 : 385 – 403 .
- Cartwright , I. L. and Elgin , S. C.R. 1984 . EMBO J. , 3 : 3101 – 3108 .
- Roberson , A. E. , Wolffe , A. P. , Hauser , L. J. and Olins , D. E. 1989 . Nucl. Acids Res. , 17 : 4699 – 4712 .
- Gottschling , D. E. and Cech , T. R. 1984 . Cell , 38 : 501 – 510 .
- Hansen , J. C. , Ausio , J. , Stanik , V. H. and van Holde , K. E. 1989 . Biochemistry , 28 : 9129 – 9136 .
- Palen , T. E. and Cech , T. R. 1984 . Cell , 36 : 933 – 942 .
- Budarf , M. L. and Blackburn , E. H. 1986 . J. Biol. Chem. , 261 : 363 – 369 .
- Pederson , D. S. , Shupe , K. S. and Gorovsky , M. A. 1984 . Nucl. Acids Res. , 12 : 8489 – 8507 .
- Pederson , D. S. , Shupe , K. S. , Bannon , G. A. and Gorovsky , M. A. 1986 . Mol. Cell. Biol. , 6 : 3014 – 3017 .
- Kefalas , P. , Gray , F. C. and Allan , J. 1988 . Nucl. Acids Res. , 16 : 501 – 517 .
- Wittig , S. and Wittig , B. 1982 . Nature , 297 : 31 – 38 .
- Rhodes , D. 1985 . EMBO J. , 4 : 3473 – 3482 .
- Gottesfeld , J. M. 1987 . Mol. Cell. Biol. , 7 : 1612 – 1622 .
- Nobile , C. , Nickol , J. and Martin , R. G. 1986 . Mol. Cell. Biol , 6 : 2916 – 2922 .
- Clarke , M. F. , FitzGerald , P. C. , Brubaker , J. M. and Simpson , R. T. 1985 . J. Biol. Chem. , 260 : 12394 – 12397 .
- Capranico , G. , Jaxel , C. , Roberge , M. , Kohn , K. W. and Pommier , Y. 1990 . Nucl. Acids Res. , 18 : 4553 – 4559 .
- Pina , B. , Barettino , B. , Truss , M. and Beato , M. 1990 . J. Mol. Biol. , 216 : 975 – 990 .
- Richard-Foy , H. and Hager , G. L. 1987 . EMBO J. , 6 : 2321 – 2328 .
- Perlmann , T. and Wrange , O. 1988 . EMBO J. , 7 : 3073 – 3079 .
- Shimada , T. , Inokuchi , K. and Nienhuis , A. W. 1986 . J. Biol. Chem. , 261 : 1445 – 1452 .