References and Footnotes
- Felsenfeld , G. , Davies , D. R. and Rich , A. 1957 . J. Amer. Chem. Soc. , 79 : 2023 – 2024 .
- Riley , M. , Maling , B. and Chamberlin , M. J. 1966 . J. Mol. Biol. , 20 : 359 – 389 .
- Morgan , A. R. and Wells , R. D. 1968 . J. Mol. Biol. , 37 : 63 – 80 .
- Miles , H. T. 1964 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 51 : 1105 – 1109 .
- Voet , D. and Rich , A. 1970 . Progr. Nucl. Acids Res. Mol. Biol. Edited by: Davidson , J. N. and Cohn , W. E. Vol. 10 , 182 – 265 . NY : Academic Press .
- Sakore , T. D. , Tavale , S. S. and Sobell , H. M. 1969 . J. Mol. Biol. , 43 : 361 – 374 .
- Sakore , T. D. , Sobell , H. M. , Mazza , F. and Kartha , G. 1969 . J. Mol. Biol. , 43 : 385 – 406 .
- Rich , A. and RajBhandary , U. L. 1976 . Ann. Rev. Biochem. , 45 : 805 – 860 .
- Pullman , B. , Claverie , P. and Caillet , J. 1967 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 57 : 1663 – 1669 .
- Lee , J. S. , Woodsworth , M. L. , Latimer , L. J.P. and Morgan , A. R. 1984 . Nucleic Acids Res. , 12 : 6603 – 6614 .
- Broitman , S. L. , Im , D. D. and Fresco , J. R. 1987 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 84 : 5120 – 5124 .
- Moser , H. E. and Dervan , P. B. 1987 . Science , 238 : 645 – 650 .
- Mirkin , S. M. , Lyamichev , V. I. , Drushlyak , K. N. , Dobrynin , V. N. , Filippov , S. A. and Frank-Kamenetskii , M. D. 1987 . Nature , 230 : 495 – 497 .
- Htun , H. and Dahlberg , J. E. 1988 . Science , 241 : 1791 – 1796 .
- Cooney , M. , Czernuszewicz , G. , Postel , E. H. , Flint , S. J. and Hogan , M. E. 1988 . Science , 241 : 456 – 459 .
- Johnston , B. H. 1988 . Science , 241 : 1800 – 1804 .
- Griffin , L. C. and Dervan , P. B. 1989 . Science , 245 : 967 – 971 .
- Pilch , D. S. , Levenson , C. and Shafer , R. H. 1991 . Biochemistry , 30 : 6081 – 6087 .
- Durland , R. H. , Kessler , D. J. , Gunnell , S. , Duvic , M. , Pettitt , B. M. and Hogan , M. E. 1991 . Biochemistry , 30 : 9250 – 9255 .
- Kohwi , Y. and Kohwi-Shigematsu , T. 1988 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 85 : 3781 – 3785 .
- Hsieh , P. , Camerini-Otero , C. S. and Camerini-Otero , R. D. 1990 . Genes and Development , 4 : 1951 – 1963 .
- Zhurkin , V. B. , Raghunathan , G. , Ulyanov , N. B. , Camerini-Otero , R. D. and Jernigan , R. L. 1994 . Structural Biology: State of the An 1993 Proceedings of the Eigth Conversation Edited by: Sarma , R. H. and Sarma , M. H. Adenine Press .
- Arnott , S. and Bond , P. J. 1973 . Nature (London) New Biol. , 244 : 99 – 101 . (b) Arnott, S. and Selsing, E., J. Mol. Biol. 88, 509–521 (1974)
- Raghunathan , G. , Miles , H. T. and Sasisekharan , V. 1993 . Biochemistry , 32 : 455 – 462 .
- Howard , F. B. , Miles , H. T. , Liu , K. , Frazier , J. , Raghunathan , G. and Sasisekharan , V. 1992 . Biochemistry , 31 : 10671 – 10677 .
- Liquer , J. , Coffinier , P. , Firon , M. and Tailandier , E. 1991 . J. Biomol. Str. Dyn. , 9 : 437 – 445 .
- Macaya , R. , Wang , E. , Schultze , P. , Sklenar , V. and Feigon , J. 1992 . J. Mol. Biol. , 225 : 755 – 773 .
- Jiang , S. P. , Raghunathan , G. , Ting , K. L. , Xuan , J. C. and Jernigan , R. L. Accompanying paper
- Frisch , M. J. , Head-Gordon , M. , Trucks , G. W. , Foresman , J. B. , Schlegal , H. B. , Raghavachari , K. , Robb , M. A. , Binkley , J. S. , Gonzalez , C. , Defrees , D. J. , Fox , D. J. , Whiteside , R. A. , Seeger , R. , Melius , C. F. , Baker , J. , Martin , R. , Kahn , L. R. , Stewart , J. J.P. , Topiol , S. and Pople , J. A. 1990 . Gaussian Vol. 90 , Pittsburg , PA : Gaussian Inc. .
- Hoogsteen , K. 1963 . Acta Cryst. , 16 : 907 – 916 .
- Liu , K. , Frazier , J. , Miles , H. T. and Saisekharan , V. 1993 . Biochemistry , 9 : 11802 – 11809 .
- Raghunathan , G. , Miles , H. T. and Sasisekharan , V. 1994 . Biopolymers , in press
- Sarma , M. H. , Umemoto , K. , Gupta , G. , Luo , J. and Sarma , R. H. 1990 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 8 : 461 – 484 .
- Katz , L. , Tomita , K. and Rich , A. 1965 . J. Mol. Biol. , 13 : 340 – 350 .
- Katz , L. , Tomita , K. and Rich , A. 1966 . Acta Cryst. , 21 : 754 – 764 .
- Mathews , F. S. and Rich , A. 1964 . J. Mol. Biol. , 8 : 89 – 95 .
- Haschemeyer , E. V. and Sobell , H. M. 1965 . Acta Cryst , 18 : 525 – 532 .
- Langlet , J. , Claverie , P. , Caron , F. and Boeuve , J. C. 1981 . Int. J. Quantum Chem. , 20 : 299 – 338 .
- Jeffrey , G. A. and Saenger , W. 1991 . Hydrogen Bonding in Biological Structures Berlin , New York : Springer-Verlag .
- Bene , Del and Pople , J. A. 1970 . J. Chem. Phys. , 52 : 4858 – 4866 .
- Povsic , T. J. and Dervan , P. B. 1989 . J. Amer. Chem. Soc. , : 3059 – 3061 .
- Rajagopal , P. and Feigon , J. 1989 . Nature , 339 : 637 – 640 .
- Radhakrishnan , I. , de los Santos , C. and Patel , D. J. 1991 . J. Mol. Biol. , 221 : 1403 – 1418 .
- Beal , P. A. and Dervan , P. B. 1991 . Science , 251 : 1360 – 1363 .
- Beal , P. A. and Dervan , P. B. 1991 . Nucleic Acids Res. , 20 : 2773 – 2776 .
- Radhakrishnan , I. , Gao , X. , de los Santos , C. , Live , D. and Patel , D. J. 1992 . Biochemistry , 31 : 2514 – 2523 .
- Macaya , R. F. , Gilbert , D. A. , Malek , S. , Sinsheimer , J. S. and Feigon , J. 1991 . Science , 254 : 270 – 273 .
- Wang , E. , Malek , S. and Feigon , J. 1992 . Biochemistry , 31 : 4838 – 4846 .
- Belotserkovskii , B. P. , Veselkov , A. G. , Filippov , S. A , Dobrynin , V. N. , Mirkin , S. M. and Frank-Kamenetskii , M. D. 1990 . Nucleic Acids Res. , 18 : 6621
- Mergny , J. L. , Sun , J.-S. , Rougee , M. , Montenary-Garestier , T. , Barcelo , F. , Chomilier , J. and Helene , C. 1991 . Biochemistry , 30 : 9791 – 9798 .
- Roberts , R. W. and Crothers , D. M. 1991 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 88 : 9397 – 9401 .