References and Footnotes
- Zimmer , C. h. and Wahnert , U. 1986 . Preg. Biophys. Mol. Biol. , 47 : 31 – 112 .
- Kopka , M. L. , Yoon , c. , Goodsell , D. , Pjura , P. and Dickerson , R. E. 1985 . Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , 82 : 1376 – 1380 .
- Coll , M. , Frederick , C. A.-J , Wang , A. H. and Rich , A. 1987 . Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , 84 : 8385 – 8389 .
- Tabernero , L. , Verdaguer , N. , Coll , M. , Fita , I. , Van Der Marei , G. A. , van Boom , J. H. , Rich , A. and Aymami , J. 1993 . Biochemistry , 32 : 8403
- Kievit , R. E. , Wemmer , D. E. and Reid , B. R. 1986 . Biochemistry , 25 : 3296 – 3303 .
- Zasedatelev , A. S. , Gursky , G. V. , Zimmer , C. h. and Thrum , H. 1974 . Mol. Biol. Rep. , 1 : 337 – 342 .
- Zasedatelev , A. S. , Zhuze , A. L. , Zimmer , C. h. , Grokhovsky , S. L. , Tumanyan , V. G. , Gursky , G. V. and Gottikh , B. P. 1976 . DoklAkad. Nauk USSR , 231 : 1006 – 1009 .
- Burckhardt , G. , Votavova , H. , Sponar , J. , Luck , G. and Zimmer , C. h. 1985 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 2 : 721 – 736 .
- Pelton , J. G. and Wemmer , D. E. 1989 . Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , 86 : 5723 – 5727 .
- Pelton , J. G. and Wemmer , D. E. 1990 . J. Am. Chem. Soc. , 112 : 1393 – 1399 .
- Chen , X. , Ramakrishnan , b. , Rao , S. T. and Sundaralingam , M. 1994 . Struct. Biol. , 1 : 169 – 175 .
- Wade , W. S. , Mrksich , M. and Dervan , P. B. 1992 . J. Am. Chem. Soc. , 114 : 8783 – 8792 .
- Mrksich , M. , Wade , W. S. , Dwyer , T. J. , Geierstanger , b. H. , Wemmer , D. E. and Dervan , P. B. 1992 . Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , 89 : 7586 – 7590 .
- Dwyer , T. , Geierstanger , B. H. , Bathini , Y. , Lown , J. W. and Wemmer , D. E. 1992 . J. Am. Chem. Soc. , 114 : 5911 – 5919 .
- Mrksich , M. and Dervan , P. B. 1993 . J. Am. Chem. Soc. , 115 : 2572 – 2576 .
- Chen , Y-H. and Lown , J. W. 1994 . J. Am. Chem. Soc. , 116 : 6995 – 7005 .
- Geierstanger , B. H. , Mrksich , M. , Dervan , P. B. and Wemmer , D. E. 1994 . Science , 266 : 646 – 650 .
- Gursky , G. V. , Zasedatelev , A. S. , Zhuze , A. L. , Khorlin , A. A. , Grokhovsky , S. L. , Streltsov , S. A. , Surovaya , A. N. , Nikitin , S. M. , Krylov , A. S. , Retchinsky , V. O. , Mikhailov , M. V. , Sh. Beabealaschvilli , R. and Gottikh , B. P. 1983 . Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. , 47 : 367 – 378 .
- Mrksich , M. , Parks , M. E. and Dervan , P. B. 1994 . J. Am. Chem. Soc. , 116 : 7983 – 7988 .
- Parks , M. E. , Baird , E. E. and Dervan , P. B. 1996 . J. Am. Chem. Soc. , 118 : 6141 – 6146 .
- Pilch , D. S. , Poklar , N. , Gelfand , C. A. , Law , S. M. , Breslauer , K. J. , Baird , E. E. and Dervan , P. B. 1996 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 93 : 8306 – 8311 .
- Grokhovsky , S. L. and Zubarev , V. E. 1990 . Nucleic Acids Res. , 19 : 257 – 264 .
- Grokhovsky , S. L. , Zhuze , A. L. and Gottikh , B. P. 1992 . Bioorg. Chem. (Russia) , 18 : 570 – 583 .
- Nechipurenko , Yu. D. and Gursky , G. V. 1986 . Biophys. Chem. , 24 : 195 – 209 .
- In the noncooperative ligand case, Eqs.[22] and [23] (see ref. 24) can be easily rearranged into Eqs.[l] and [2]
- Nikolaev , V. A. , Grokhovsky , S. L. , Surovaya , A. N. , Leinsoo , T. A. , Yu. Sidorova , N. , Zasedatelev , A. S. , Zhuze , A. L. , Strachan , G. A. , Shafer , R. H. and Gursky , G. V. 1996 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 14 : 31 – 47 .