References and Footnotes
- Dickenson , R. E. , Goodsell , D. S. and Neile , S. 1994 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 91 : 3579
- Lipanov , A. , Kopka , M. L. , Kaczor-Grzeskowiak , M. , Quintana , J. and Dickerson , R. E. 1993 . Biochemistry , 32 : 1373
- Ulyanov , N. B. and James , T. L. 1995 . Methods Enzymol. , 261 : 3
- Darden , T. , York , D. and Pedersen , L. 1993 . J. Chem. Phys. , 98 : 10089
- Pearlman , D. A. , Case , D. ?. , Caldwell , J. W. , Ross , W. S. , Cheatham , T. E. III , Ferguson , D. M. , Seibel , G. L. , Singh , U. C. , Weiner , J. W. and Kollman , P. A. 1995 . Vol. 41 , San Francisco : University of California .
- York , D. M. , Yang , W. , Lee , H. , Darden , T. and Pedersen , L. G. 1995 . J. Am. Chem. Soc. , 117 : 5001
- Cheatham , T. E. III , Miller , J. J. , Fox , T. , Darden , T. A. and Kollman , P. A. 1995 . J. Am. Soc. , 117 : 4193
- Zichi , D. A. 1995 . J. Am. Soc. , 117 : 2957
- Weerasinghe , S. , Smith , P. E. , Mohan , V. , Cheng , Y.-K. and Pettit , B. M. 1995 . J. Am. Chem. Soc. , 117 : 2147
- Lee , H. , Darden , T. A. and Pedersen , L. G. 1995 . J. Chem. Phys. , 102 : 3830
- Cormack , B. P. and Strahl , K. 1992 . Cell , 69 : 685
- Kim , J. L. , Nikolov , D. B. and Burley , S. K. 1993 . Nature , 365 : 520
- Kim , Y. , Geiger , J. H. , Hahn , S. and Sigler , P. B. 1993 . Nature , 365 : 512
- Kim , J. L. and Burley , S. K. 1994 . Nature Struct. Biol. , 1 : 638
- Wobbe , C. R. and Struhl , K. 1990 . Mol. Cell. Biol. , 10 : 3859
- Myslinski , E. , Schuster , C. , Huet , J. , Sentenac , A. , Krol , A. and Carbon , P. 1993 . Nucleic Acids Res. , 21 : 5852
- Starr , D. B. , Hoopes , B. C. and Hawley , D. K. 1995 . J. Mol. Biol. , 250 : 434
- Wong , J. M. and Bateman , E. 1994 . Nucleic Acids Res. , 22 : 1890
- Auffinger , P. , Louise-May , S. and Westhof , E. 1995 . J. Am. Chem. Soc. , 117 : 6720
- Lousie-May , S. , Auffinger , P. and Westhof , E. 1995 . Curr Opin. Struct. Biol. , 6 : 289
- Lousie-May , S. , Auffinger , P. and Westhof , E. 1996 . Biological Structure and Dynamics Edited by: Sarma , R. H. and Sarma , M. H. Vol. 2 , 73 Adenine Press .
- Auffinger , P. and Westhoff , E. 1996 . Biophys. J. , 71 : 940
- Cheatham , T. E. III and Kollman , P. A. 1996 . J. Mol. Biol. , 259 : 434
- Cornell , W. D. , Cieplak , P. , Bayly , C. I. , Gould , L. R. , Merz , K. M. Jr. , Ferguson , D. M. , Spellmeyer , D. C. , Fox , T. , Caldwell , J. W. and Kollman , P. A. 1995 . J. Am. Chem. Soc. , 117 : 5179
- Arnott , S. and Hukins , D. W. L. 1972 . Biochem. Biophy. Res. Commun. , 47 : 1504
- van Gunsteren , W. F. and Berendsen , H. J. C. 1977 . Mol. Phys. , 34 : 1311