50
Views
7
CrossRef citations to date
0
Altmetric
Original Articles

Analysis of the Dynamics of Rhizomucor miehei Lipase at Different Temperatures

, , &
Pages 1003-1018 | Received 04 Aug 1998, Published online: 21 May 2012

References and Footnotes

  • Wulfson , E. N. 1994 . In Lipases—Their Structure, Biochemistry and Applications Edited by: Woolley , P. and Petersen , S. B. 271 – 288 . Cambridge : Cambridge University Press .
  • Goodenough , P. W. and Jenkins , J. A. 1991 . Biochem. Soc. Trans., Food Biotechn. , 19 : 655 – 662 .
  • Margesin , R. and Schinner , F. 1994 . J. Biotechn. , 33 : 1 – 14 .
  • Haas , M. J. , Cichowicz , D. J. and Bailey , D. G. 1992 . Lipids , 27 : 571 – 576 .
  • Goward , C. R. , Miller , J. , Nicholls , D. J. , Irons , L. I. , Scawen , M. D. , O'Brien , R. and Chowdhry , B. Z. 1994 . Eur. J. Biochem. , 224 : 249 – 255 .
  • Shih , P. , Holland , D. R. and Kirsch , J. F. 1995 . Protein Sci. , 4 : 2050 – 2062 .
  • Gupta , M. N. 1991 . Biotechn. and Appl. Biochem. , 14 : 1 – 11 .
  • Gupta , M. N. , ed. 1993 . Thermostability of Enzymes. Berlin : Springer .
  • Spassov , V. Z. , Karshikoff , A. D. and Ladenstein , R. 1995 . Protein Sci. , 4 : 1516 – 1527 .
  • Krokoszynska , I. and Otlewski , J. 1996 . J. Mol. Biol. , 256 : 793 – 802 .
  • Argos , P. , Rossmann , M. G. , Gau , U. M. , Zuber , H. , Frank , G. and Tratshin , J. D. 1979 . Biochemistry , 18 : 5698 – 5703 .
  • Folcarelli , S. , Battistoni , A. , Carri , M. T. , Polticelli , F. , Falconi , M. , Nicolini , L. , Stella , L. , Rosato , N. , Rotilio , G. and Desideri , A. 1996 . Protein Engng. , 9 : 323 – 325 .
  • Warren , G. L. and Petsko , G. A. 1995 . Protein Engng. , 8 : 905 – 913 .
  • Wasserman , B. P. 1984 . Food Techn. , 38 : 78 – 98 .
  • Mrabet , N. T. , van den Broeck , A. , van den Brande , I. , Stanssens , P. , Laroche , Y. , Lambeir , A. M. , Matthijssens , G. , Jenkins , J. , Chiadmi , M. , van Tilbeurgh , H. , Rey , F. , Janin , J. , Quax , W. J. , Lasters , I. , De Maeyer , M. and Wodak , S. J. 1992 . Biochemistry , 31 : 2239 – 2253 .
  • Menendez-Arias , L. and Argos , P. 1989 . J. Mol. Biol. , 206 : 397 – 406 .
  • Merkler , D. J. , Farrington , G. K. and Wedler , F. C. 1981 . Int. J. Peptide Protein Res. , 31 : 430 – 442 .
  • Adams , M. W.W. 1993 . Annu. Rev. Microbiol. , 17 : 627 – 658 .
  • Adams , M. W.W. and Kelly , R. M. 1995 . C.* & EN , : 32 – 42 .
  • Nicholsen , H. , Becktel , W. J. and Matthews , B. W. 1988 . Nature , 336 : 651 – 656 .
  • Moneta , O. D. , Sereda , T. J. , Zhou , N. E. , Kay , C. M. and Hodges , R. S. 1995 . J. Peptide Sci. , 1 : 319 – 329 .
  • Querol , E. , Perez-Pons , J. A. and Mozo-Villarias , A. 1996 . Protein Engng. , 9 : 265 – 271 .
  • Eijsink , V. G.H. , Vriend , G. , van der Burg , B. , van der Zee , J. R. and Venema , G. 1992 . Protein Engng. , 5 : 165 – 170 .
  • Hol , W. G.J. , Halie , L. M. and Sander , C. 1981 . Nature , 294 : 532 – 536 .
  • Knowles , J. R. 1991 . Nature , 350 : 121 – 124 .
  • Yutani , K. , Ogasahara , K. , Kimura , A. and Sugino , Y. 1982 . J. Mol. Biol. , 160 : 387 – 390 .
  • Malcom , B. A. , Wilson , K. P. , Matthews , B. W. , Kirsch , J. F. and Wilson , A. C. 1990 . Nature , 345 : 86 – 89 .
  • Koehl , P. and Delarue , M. 1994 . Proteins: Struc. Func. Gen. , 20 : 264 – 278 .
  • Wigley , D. B. , Clarke , A. R. , Dunn , C. R. , Barstow , D. A. , Atkinson , T. , Chia , W. N. , Muirhead , H. and Holbrook , J. J. 1987 . Biochim. Biophys. Acta , 916 : 145 – 148 .
  • Pakula , A. A. and Sauer , R. T. 1990 . Nature , 344 : 363 – 364 .
  • Casal , J. I. , Ahern , T. J. , Davenport , R. C. , Petsko , G. A. and Klibanov , A. M. 1987 . Biochemistry , 26 : 1258 – 1264 .
  • Tyler-Cross , R. and Schirch , V. 1991 . J. Biol. Chem. , 266 : 22549 – 22556 .
  • Volkin , D. B. and Klibanov , A. M. 1987 . J. Biol. Chem. , 262 : 2945 – 2950 .
  • Tomazic , S. J. and Klibanov , A. M. 1988 . J. Biol. Chem. , 263 : 3086 – 3091 .
  • Goddette , D. W. , Christianson , T. , Ladin , B. F. , Lau , M. , Mielenz , J. R. , Paech , C. , Reynolds , R. B. , Yang , S. S. and Wilson , C. R. 1993 . J. Biotechnol. , 28 : 41 – 54 .
  • Norin , M. , Haeffner , F. , Huit , K. and Edholm , O. 1994 . Biophys. J. , 67 : 548 – 559 .
  • Fitzpatrick , P. A. , Steinmetz , A. C.U. , Ringe , D. and Klibanov , A. M. 1993 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 90 : 8653 – 8657 .
  • de Loof , H. , Nilsson , L. and Rigler , R. 1992 . J. Am. Chem. Soc. , 114 : 4028 – 4035 .
  • Lautz , J. , Kessler , H. , van Gunsteren , W. F. , Weber , H. P. and Wenger , R. M. 1990 . Biopolymers , 29 : 1669 – 1687 .
  • Hartsough , D. S. and Merz , M. Jr . 1993 . J. Am. Chem. Soc. , 115 : 6529 – 6537 .
  • Peters , G. H. , van Aalten , D. M.F. , Edholm , O. , Toxvaerd , S. and Bywater , R. 1996 . Biophys. J. , 71 : 2245 – 2255 .
  • Pugliese , L. , Prevost , M. and Wodak , S. J. 1995 . J. Mol. Biol. , 251 : 432 – 447 .
  • Caflisch , A. and Karplus , M. 1994 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 91 : 1746 – 1750 .
  • Caflisch , A. and Karplus , M. 1995 . J. Mol. Biol. , 252 : 672 – 708 .
  • Dagget , V. and Levitt , M. 1992 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 89 : 5142 – 5146 .
  • Mark , A. E. and van Gunsteren , W. F. 1992 . Biochemistry , 31 : 7745 – 7748 .
  • Session , R. B. , Dauber-Osguthorpe , P. and Osguthorpe , D. J. 1989 . J. Mol. Biol. , 209 : 617 – 633 .
  • Ichiye , T. and Karplus , M. 1991 . Proteins: Struc. Func. Gen. , 11 : 205 – 217 .
  • Amadei , A. , Linssen , A. B.M. and Berendsen , H. J.C. 1993 . Proteins: Struc. Func. Gen. , 17 : 412 – 425 .
  • Balsera , M. A. , Wriggers , W. , Oono , Y. and Schulten , K. 1996 . J. Phys. Chem. , 100 : 2567 – 2572 .
  • Karplus , M. and Kushick , J. N. 1981 . Macromolecules , 14 : 325 – 332 .
  • Perahia , D. , Levy , R. M. and Karplus , M. 1990 . Biopolymers , 29 : 645 – 677 .
  • Janezic , D. , Venable , M. and Brooks , B. R. 1995 . J. Comp. Chem. , 16 : 1554 – 1566 .
  • de Groot , B. L. , Amadei , A. , Scheek , R. M. , van Nuland , N. A.J. and Berendsen , H. J.C. 1996 . Proteins: . Struc. Func. Gen. , 26 : 314 – 322 .
  • Derewenda , U. , Swenson , L. , Wei , Y. , Green , R. , Kobos , P. M. , Joerger , R. , Haas , M. J. and Derewenda , Z. S. 1994 . J. Up. Res. , 35 : 524 – 534 . a)
  • Brzozowski , A. M. , Derewenda , U. , Derewenda , Z. S. , Dodson , G. G. , Lawson , D. M. , Turkenburg , J. P. , Bjorkling , F. , Huge-Jensen , B. , Patkar , S. A. and Thim , L. 1991 . Nature , 351 : 491 – 494 .
  • van Aalten , D. M.F. , Amadei , A. , Linssen , A. B.M. , Eijsink , V. G.H. and Vriend , G. 1995 . Proteins: Struc. Func. Gen. , 22 : 45 – 54 .
  • Peters , G. H. , van Aalten , D. M.F. , Svendsen , A. and Bywater , R. 1997 . Protein Engng. , 10 : 149 – 158 .
  • van Aalten , D. M.F. , Jones , P. C. , de Sousa , M. and Findlay , J. B.C. 1996 . c) Submitted
  • Derewenda , Z. S. , Derewenda , U. and Dodson , G. G. 1992 . J. Mol. Biol. , 227 : 818 – 839 .
  • Bernstein , F. C. , Koetzle , T. F. , Williams , G. J.B. , Meyer , E. F. , Brice , M. D. , Rogers , J. R. , Kennard , O. , Shimanouchi , S. and Tasumi , M. 1977 . J. Mol. Biol. , 112 : 535 – 542 .
  • van Gunsteren , W. F. and Berendsen , H. J.C. 1987 . GROMOS: Groningen molecular simulation computer program package The Netherlands : University of Groningen .
  • Berendsen , H. J.C. , Postma , J. P.M. , van Gunsteren , W. F. and Hermans , J. 1981 . In Membrane Proteins: Structures, Interactions and Models. Edited by: Pullman , A. 457 – 470 . Leiden University , , The Netherlands : Kluwer Academic Publishers . et al.
  • Berendsen , H. J.C. , Postma , J. P.M. , van Gunsteren , W. F. , DiNola , A. and Haak , J. R. 1984 . J. Chem. Phys. , 81 : 3684 – 3690 .
  • Ryckaert , J. P. , Ciccotti , G. and Berendsen , H. J.C. 1977 . J. Comp. Phys. , 23 : 327 – 341 .
  • Allen , M. P. and Tildesley , D. J. 1989 . Computer simulation of liquids. Oxford : Clarendon .
  • Vriend , G. 1990 . J. Mol. Graph. , 8 : 52 – 56 .
  • van Aalten , D. M.F. , Amadei , A. , Bywater , R. , Findlay , J. B.C. , Berendsen , H. J.C. , Sander , C. and Stouten , P. F.W. 1996 . Biophys. J. , 70 : 684 – 692 . a)
  • Ramachandran , G. N. , Ramakrishnan , C. and Sasisekharan , V. 1963 . J. Mol. Biol. , 7 : 95 – 99 .
  • 1992 . CHARMm Molecular Modeling Software Package—Release 3.3. Molecular Simulations Inc., 200 Fifth Avenue, Waltham, MA 02154, U.S.A
  • Goldsack , D. E. 1970 . Biopolymers , 9 : 247 – 252 .
  • van Aalten , D. M.F. , Findlay , J. B.C. , Amadei , A. and Berendsen , H. J.C. 1996 . Protein Engng. , 8 : 1129 – 1135 . b)
  • Derewenda , U. , Swenson , L. , Green , R. , Wei , Y. , Dodson , G. G. , Yamaguchi , S. , Haas , M. J. and Derewenda , Z. S. 1994 . Nature Struc. Biol. , 1 : 36 – 47 . b)
  • Matthews , B. W. , Nicholson , H. and Becktel , W. J. 1987 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 32 : 25 – 38 . b)
  • Dao-Pin , S. , Baase , W. A. and Matthews , B. W. 1990 . Proteins: Struc. Func. Gen. , 7 : 198 – 204 .
  • Blaber , M. , Lindstrom , J. D. , Gassner , N. , Xu , J. , Heinz , D. W. and Matthews , B. W. 1993 . Biochemistry , 32 : 11363 – 11373 .
  • Ulbrich-Hofmann , R. , Golbik , R. and Damerau , W. 1992 . Stability and Stabilization of Enzymes. Edited by: van den Tweel , W. J.J. , Harder , A. and Buitelaar , R. M. 133 – 144 . New York : Elsevier Science Publishers .
  • Stempfer , G. , Höll-Neugebauer , B. , Kopetzki , E. and Rodolph , R. 1996 . Nature Biotechn. , 14 : 481 – 484 .
  • Olsen , O. and Thomsen , K. K. 1991 . J. Gen. Microbiol. , 137 : 579 – 585 .
  • Kuroki , R. , Taniyama , Y. , Seko , C. , Nakamura , H. , Kikuchi , M. and Ikehara , M. 1989 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 86 : 6903 – 6907 .
  • Haezebrouck , P. , de Baetselier , A. , Joniau , M. , van Dael , H. , Rosenberg , S. and Hanssens , I. 1993 . Protein Engng. , 6 : 643 – 649 .
  • Toma , S. , Campagnoli , S. , Margarit , I. , Gianna , R. , Grandi , G. , Bolognesi , M. , de Filippis , V. and Fontana , A. 1991 . Biochemistry , 30 : 97 – 106 .
  • Matsumura , M. , Signor , G. and Matthews , B. W. 1989 . Nature , 342 : 291 – 293 .
  • Nishikawa , S. , Adiwinata , J. , Morioka , H. , Fujimura , T. , Tanaka , T. , Uesugi , S. , Hakoshima , T. , Tomita , K. , Nakagawa , S. and Ikehara , M. 1990 . Protein Engng. , 3 : 443 – 448 .
  • Takagi , H. , Takahashi , T. , Momose , H. , Inouye , M. , Maeda , Y. , Matsuzawa , H. and Ohta , T. 1990 . J. Biol. Chem. , 265 : 6874 – 6878 .
  • Clarke , J. and Fersht , A. R. 1993 . Biochemistry , 32 : 4322 – 4329 .
  • Wakarchuk , W. W. , Sung , W. L. , Campbell , R. L. , Cunningham , A. , Watson , D. C. and Yaguchi , M. 1994 . Protein Engng. , 7 : 379 – 386 .
  • King , J. 1996 . Nature Biotechn. , 14 : 436 – 437 .
  • Lehle , K. , Kohnert , U. , Stern , A. , Popp , F. and Jaenicke , R. 1996 . Nature Biotechn. , 14 : 476 – 480 .
  • von der Osten , C. , Hedegaard , L. , Ostergaard , P. , Lauridsen , C. , Kierstein , L. and Branner , S. 1992 . Stability and Stabilization of Enzymes. Edited by: Van den Tweel , W. J.J. , Harder , A. and Buitelaar , R. M. 133 – 144 . New York : Elsevier Science Publishers .
  • Hardy , F. , Vriend , G. , Veltman , O. R. , van der Vinne , B. , Venema , G. and Eijsink , V. G.H. 1993 . FEBS Lett. , 317 : 89 – 92 .
  • Masui , A. , Fujiwara , N. and Imanaka , T. 1994 . Appl. Environ. Microbiol. , 60 : 3579 – 3584 .
  • Vermersch , P. S. , Tesmer , J. J.G. , Lemon , D. D. and Quiocho , F. A. 1990 . J. Biol. Chem. , 265 : 16592 – 16603 .
  • Matthews , B. W. 1987 . Biochemistry , 26 : 6885 – 6888 . a)
  • Kabsch , W. and Sander , C. 1983 . Biopolymers , 22 : 2577 – 2637 .
  • Kraulis , P. 1991 . J. Appl. Crystallogr. , 24 : 946 – 950 .

Reprints and Corporate Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

To request a reprint or corporate permissions for this article, please click on the relevant link below:

Academic Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

Obtain permissions instantly via Rightslink by clicking on the button below:

If you are unable to obtain permissions via Rightslink, please complete and submit this Permissions form. For more information, please visit our Permissions help page.