References and Footnotes
- Avery , O. T. , Macleod , C. M. and McCarthy , M. 1944 . J. Exp. Med. , 79 : 137 – 158 .
- Franklin , R. E. and Gosling , R. G. 1953 . Acta Cryst. , 6 : 673 – 677 .
- Berman , H. M. , Olson , W. K. , Beveridge , D. L. , Westbrook , J. , Gelbin , A. , Demeny , T. , Hsieh , S.-H. , Srinivasan , A. R. and Schneider , B. 1992 . J. Biophys , 63 : 751 – 759 .
- Calladine , C. R. 1982 . J. Mol. Biol. , 161 : 343 – 352 .
- Dickerson , R. E. 1983 . J. Mol. Biol. , 205 : 787 – 791 .
- Haran , T. E. , Berkovich-Yellin , Z. and Shakked , Z. 1984 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 2 : 397 – 412 .
- Sponer , J. and Kypr , J. 1990 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 7 : 1211 – 1220 .
- Yanagi , K. , Privé , G. G. and Dickerson , R. E. 1991 . J. Mol. Biol. , 217 : 201 – 214 .
- Sponer , J. and Kypr , J. 1993 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 11 : 027 – 041 .
- Sponer , J. and Kypr , J. 1993 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 11 : 277 – 292 .
- Gorin , A. A. , Zhurkin , V. B. and Olson , W. K. 1995 . J. Mol. Biol. , 247 : 34 – 48 .
- ElHassan , M. A. and Calladine , C. R. 1996 . J. Mol. Biol. , 259 : 95 – 103 .
- Hunter , Ch. A. and Lu , X.-J. 1997 . J. Mol. Biol. , 265 : 603 – 619 .
- Lam , S. L. and Au-Yeung , S. C. F. 1997 . J. Mol. Biol. , 266 : 745 – 760 .
- Suzuki , M. , Amano , N. , Kakinuma , J. and Tateno , M. 1997 . J. Mol. Biol. , 274 : 421 – 435 .
- Packer , M. J. and Hunter , Ch. A. 1998 . J. Mol. Biol. , 280 : 407 – 420 .
- Olson , W. K. , Gorin , A. A. , Lu , X.-J. , Hock , L. M. and Zhurkin , V. B. 1998 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 95 : 11163 – 11168 .
- Jursa , J. and Kypr , J. 1993 . Gen. Physiol. Biophys. , 12 : 401 – 419 .
- Sponer , J. and Kypr , J. 1994 . Int. J. Biol. Macromol. , 16 : 3 – 6 .
- Jursa , J. 1994 . CABIOS , 10 : 61 – 65 .
- Santalucia , J. Jr. 1998 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 95 : 1460 – 1465 .
- Bolshoy , A. , Mcnamara , P. , Harrington , R. E. and Trifonov , E. N. 1991 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 88 : 2312 – 2316 .
- Davies , D. R. and Baldwin , R. L. 1963 . J. Mol. Biol. , 6 : 251 – 255 .
- Leslie , A. G. W. , Arnott , S. , Chandrasekaran , R. and Ratliff , R. L. 1980 . J. Mol. Biol. , 143 : 49 – 72 .
- Wells , R. D. , Larson , J. E. , Grant , R. C. , Shortle , B. E. and Cantor , C. R. 1970 . J. Mol. Biol. , 54 : 465 – 497 .
- Bram , S. 1971 . Nature New Biology , 232 : 174 – 176 .
- Pohl , F. M. and Jovin , T. M. 1972 . J. Mol. Biol. , 67 : 375 – 396 .
- Sarocchi , M.-T. and Guschlbauer , W. 1973 . Eur. J. Biochem. , 34 : 232 – 240 .
- Pohl , F. M. 1976 . Nature , 260 : 365 – 366 .
- Greve , J. , Maestre , M. F. and Levin , A. 1977 . Biopolymers , 16 : 1489 – 1504 .
- Klug , A. , Jack , A. , Viswamitra , M. A. , Kennard , O. , Shakked , Z. and Steitz , T. A. 1979 . J. Mol. Biol. , 131 : 669 – 680 .
- Shindo , H. , Simpson , R. T. and Cohen , J. S. 1979 . Biolochem. , 254 : 8125 – 8128 . J
- Strauss , F. , Gaillard , C. and Prunell , A. 1981 . Eur. J. Biochem. , 118 : 215 – 222 .
- Prunell , A. , Goulet , I. , Jacob , Y. and Goutorbe , F. 1984 . Eur. J. Bio-chem. , 138 : 253 – 257 .
- Park , H.-S. , Arnott , S. , Chandrasekaran , R. and Millane , R. P. 1987 . J. Mol. Biol. , 197 : 513 – 523 .
- Puhl , H. L. and Behe , M. J. 1995 . J. Mol. Biol. , 245 : 559 – 567 .
- Pilet , J. , Blicharski , J. and Brahms , J. 1975 . Biochemistry , 14 : 1869 – 1876 .
- Suzuki , M. , Yagi , N. and Finch , J. T. 1996 . FEBS Letters , 379 : 148 – 152 .
- Howard , F. B. , Miles , H. T. and Ross , P. D. 1995 . Biochemistry , 34 : 7135 – 7144 .
- Chen , H. H. , Rau , D. C. and Charney , E. 1985 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 2 : 709 – 719 .
- Scheffler , I. E. , Elson , E. L. and Baldwin , R. L. 1968 . J. Mol. Biol. , 36 : 291 – 304 .
- Patel , D. J. and Tonelli , A. E. 1974 . Biopolymers , 13 : 1943 – 1946 .
- Vorlícková , M. , Sedlácek , P. , Kypr , J. and Sponar , J. 1982 . Nucleic Acids Res. , 10 : 6969 – 6979 .
- McNamara , P. T. , Bolshoy , A. , Trifonov , E. N. and Harrington , R. E. 1990 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 8 : 529 – 538 .
- Beutel , B. A. and Gold , L. 1992 . J. Mol. Biol. , 228 : 803 – 812 .
- Lu , P. , Cheung , S. and Arndt , K. 1983 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 1 : 509 – 521 .
- Barber , A. M. and Zhurkin , V. B. 1990 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 8 : 213 – 232 .
- Schultz , S. C. , Shields , G. C. and Steitz , T. A. 1991 . Science , 253 : 1001 – 1007 .
- Vorlícková , M. and Kypr , J. 1985 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 3 : 67 – 83 .
- Woisard , A. and Fazakerley , G. V. 1986 . Biochemistry , 25 : 2672 – 2676 .
- Jeffares , D. C. , Poole , A. M. and Penny , D. 1998 . J. Mol. Evol. , 46 : 18 – 36 .
- Bartenev , V. N. , Golovamov , Eu. I. , Kapitonova , K. A. , Mokulskii , M. A. , Volkova , L. I. and Skuratovskii , I. Ya. 1983 . J. Mol. Biol. , 169 : 217 – 234 .
- Young , M. A. , Jayaram , B. and Beveridge , D. L. 1997 . J. Am. Chem. Soc. , 119 : 59 – 69 .