54
Views
8
CrossRef citations to date
0
Altmetric
Original Articles

Homology Modeling and Docking Mechanism of the Mercaptosuccinate and Methotrexate to P. falciparum 1-Cys Peroxiredoxin: A Preliminary Molecular Study

Pages 7-19 | Received 27 Mar 2002, Published online: 15 May 2012

References and Footnotes

  • Chae , H. Z. , Robinson , K. , Poole , L. B. , Church , G. , Storz , G. and Rhee , S. G. 1994 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 91 : 7017 – 7021 .
  • Netto , L. E. S. , Chae , H. Z. , Kang , S. W. , Rhee , S. G. and Stadtman , E. R. 1996 . J. Biol. Chem. , 271 : 15315 – 15321 .
  • Chae , H. Z. , Chung , S. J. and Rhee , S. G. J. 1994 . Biol. Chem. , 269 : 27670 – 27678 .
  • Chae , H. Z. , Uhm , T. B. and Rhee , S. G. 1994 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 91 : 7022 – 7026 .
  • Kang , S. W. , Baines , I. C. and Rhee , S. G. 1998 . J. Biol. Chem , 273 : 6303 – 6311 .
  • Schirmer , R. H. , Müller , J. G. , Krauth-Siegel and Angew , R. L. 1995 . Chem. Int. Ed. Engl. , 34 : 141 – 154 .
  • Cattani , J. , Davidson , D. and Engers , H. 1993 . Program Report , 11
  • Becker , K. , Gui , M. , Traxler , A. , Kirsten , C. and Schirmer , R. H. 1994 . Histochemistry , 102 : 389395
  • Atamna , H. and Ginsburg , H. 1993 . Mol. Biochem. Parasitol , 61 : 231 – 241 .
  • Gamain , B. , Langsley , G. , Fourmaux , M. N. , Touzel , J. P. , Camus , D. , Dive , D. and Slomianny , C. 1996 . Mol. Biochem. Parasitol , 78 : 237 – 248 .
  • McGonigle , S. , Dalton , J. P. and James , E. R. 1998 . Parasitol. Today , 14 : 139 – 145 .
  • Kawazu , S-I. , Tsuji , N. , Toshimitsu , H. , Kawai , S. , Matsumoto , Y. and Kano , S. 2000 . Mol. Biochem. Parasitol , 109 : 165 – 169 .
  • Choi , H. J. , Kang , S. W. , Yang , C-H. , Rhee , S. G. and Ryu , S. E. 1998 . Nat. Struct. Biol. , 5 : 400 – 406 .
  • Li , Z. , Chen , X. , Davidson , E. , Zwang , O. , Dis , C. , Ring , C. S. , Roush , W. R. , Fegley , G. , Li , R. , Rosenthal , P. J. , Lee , G. K. , Kenyon , G. L. , Kuntz , I. D. and Cohen , F. E. 1994 . Chem Biol , 1 : 31 – 37 .
  • Lemcke , T. , Christensen , I. T. and Jorgensen , F. S. 1999 . Bio. Med. Chem , 7 : 1003 – 1011 .
  • Altschul , S. F. , Madden , T. L. , Schaffer , A. A. , Zhang , J. , Zhang , Z. , Miller , W. and Lipman , D. J. 1997 . Nucleic Acids Res. , 25 : 3389 – 3402 .
  • Bernstein , F. C. , Koetzle , T. F. , Williams , G. J. B. , Meyer , E. F. Jr. , Brice , M. D. , Rodgers , J. R. , Kennard , O. , Shimanouchi , T. and Tasumi , M. 1977 . J. Mol. Biol. , 112 : 535 – 542 .
  • 2000 . Insight II, version Molecular simulations Inc., San Diego, CA
  • Sali , A. and Blundell , T. L. 1990 . J. Mol. Biol. , 212 : 403 – 428 .
  • Sali , A. and Blundell , T. L. 1993 . J. Mol. Biol. , 234 : 779 – 815 .
  • Pearlman , D. A. , Case , D. A. , Caldwell , J. , Ross , W. S. , Cheatham , T. E. , Ferguson , D. M. , Seibel , G. L. , Singh , U. C. , Weiner , P. and Kollman , P. A. 1995 . AMBER version 4.1. Department of Pharmaceutical Chemistry. San Francisco , CA : University of California .
  • Harvey , S. C. 1989 . Proteins. , 5 : 78 – 92 .
  • Van Gunsteren , W. F. and Berendsen , H. J. C. 1977 . Mol. Phys. , 34 : 1311 – 1327 .
  • Laskowski , R. A. , MacArthur , M. W. , Moss , D. S. and Thornton , J. M. 1993 . J. Appl. Crystallogr. , 26 : 283 – 291 .
  • Sippl , M. J. 1993 . Proteins. , 17 : 355 – 362 .
  • Bowie , J. U. , Luthy , R. and Eisenberg , D. 1991 . Science. , 253 : 164 – 170 .
  • Luthy , R. , Bowie , J. U. and Eisenberg , D. 1992 . Nature. , 356 : 83 – 85 .
  • Vriend , G. 1990 . J. Mol. Graph. , 8 : 52 – 56 .
  • Sharp , K. A. and Nicholls , A. 1989 . DelPhi (v. 3.0) Manual. New York : Columbia University, Dept. of Biochemistry and Molecular Biophysics .
  • Nicholls , A. and Honig , B. 1991 . J. Comput. Chem. , 12 : 435 – 445 .
  • Dewar , M. J. S. , Zoebisch , E. G. , Healy , E. F. and Stewart , J. J. P. 1985 . J. Am. Chem. Soc , 107 : 3902
  • Schmidt , M. W. , Baldridge , K. K. , Boatz , J. A. , Elbert , S. T. , Gordon , M. S. , Jensen , J. J. , Koseki , S. , Matsunaga , N. , Nguyen , K. A. , Su , S. , Windus , T. L. , Dupuis , M. and Montgomery , J. A. 1993 . J. Comput. Chem , 14 : 1347
  • Mulholland , A. J. and Richards , W. G. 1998 . J. Mol. Struct. (Theochem.) , 429 : 13 – 21 .
  • Parr , R. G. and Yang , W. 1989 . Density Functionnal Theory of Atoms and Molecules. 99 New York , NY : Oxford University Press .
  • Fleming , I. 1976 . Frontier Orbitals and Organic Chemical Reactions. New York : John Wiley & Sons .
  • Chen , J-W. , Dodia , C. , Feinstein , S. I. , Jain , M. K. and Fisher , A. B. 2000 . J. Biological Chemistry. Vol. , 275 : 28421 – 28427 . 37
  • WebLab ViewerPro 3.7 San Diego , CA : Molecular simulations Inc. .

Reprints and Corporate Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

To request a reprint or corporate permissions for this article, please click on the relevant link below:

Academic Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

Obtain permissions instantly via Rightslink by clicking on the button below:

If you are unable to obtain permissions via Rightslink, please complete and submit this Permissions form. For more information, please visit our Permissions help page.