References and Footnotes
- Arthanari , H. and Bolton , P. H. 2001 . Chem. & Biol. , 8 : 221 – 230 .
- Simonsson , T. 2001 . Biol. Chem. , 382 : 621 – 628 .
- Shafer , R. H. and Smirnov , I. 2001 . Biopolymers , 56 : 209 – 227 .
- Moine , H. and Mandel , J.-L. 2001 . Science , 294 : 2487 – 2488 .
- Han , H. and Hurley , L. H. 2000 . Trends. Pharm. Sci. , 21 : 136 – 142 .
- Kerwin , S. M. 2000 . Curr. Pharm. Des. , 6 : 441 – 471 .
- Neidle , S. and Read , M. A. 2001 . Biopolymers , 56 : 195 – 208 .
- Perry , P. J. , Arnold , J. R. P. and Jenkins , T. C. 2001 . Expert. Opin. Investig. Drugs , 10 : 2141 – 2156 .
- Gilbert , D. E. and Feigon , J. 1999 . Curr. Opin. Struct. Biol. , 9 : 305 – 314 .
- Lane , A. N. and Jenkins , T. C. 2001 . Curr. Org. Chem. , 5 : 845 – 869 .
- Sühnel , J. 2002 . Biopolymers , 61 : 31 – 51 .
- Patel , D. J. , Bouaziz , S. , Kettani , A. and Wang , Y. 1999 . Oxford Handbook of Nucleic Acid Structure Edited by: Neidle , S. 389 – 453 . Oxford : Oxford University Press . In
- Keniry , M. A. 2001 . Biopolymers , 56 : 123 – 146 .
- Deng , J. , Xiong , Y. and Sundaralingam , M. 2001 . Proc. Natl. Acad. Sci. , 98 : 13665 – 13670 .
- Cheong , C. and Moore , P. B. 1992 . Biochemistry , 31 : 8406 – 8414 .
- Patel , P. K. , Koti , A. S. R. and Hosur , R. V. 1999 . Nucleic Acids Res. , 27 : 3836 – 3843 .
- Patel , P. K. , Bhavesh , N. S. and Hosur , R. V. 2000 . Biochem. Biophys. Res. Comm. , 270 : 967 – 971 .
- Patel , P. K. and Hosur , R. V. 1999 . Nucleic Acids Res. , 27 : 2457 – 2464 .
- Bouaziz , S. , Kettani , A. and Patel , D. J. 1998 . J. Mol. Biol. , 282 : 637 – 652 .
- Escaja , N. , Pedroso , E. , Rio , M. and Gonzalez , C. 2000 . J. Am. Chem. Soc. , 122 : 12732 – 12742 .
- Gallego , J. , Chou , S.-H. and Reid , B. R. 1997 . J. Mol. Biol. , 273 : 840 – 856 .
- Parkinson , G. N. , Lee , M. P. H. and Neidle , S. 2002 . Nature , 417 : 876 – 880 .
- Wang , Y. and Patel , D. J. 1993 . Structure , 1 : 263 – 282 .
- Phillips , K. , Dauter , Z. , Murchie , A. I. , Lilley , D. M. and Luisi , B. 1997 . J. Mol. Biol. , 273 : 171 – 182 .
- Guschlbauer , W. , Chantot , J. F. and Thiele , D. 1990 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 8 : 491 – 511 .
- Spackova , N. , Berger , I. and Sponer , J. 1999 . J. Am. Chem. Soc. , 121 : 5519
- Jing , N. , Xiong , W. , Guan , Y. , Pallansch , L. and Wang , S. 2002 . Biochemistry , 41 : 5397 – 5403 .
- Kotch , F. W. , Fettinger , J. C. and Davis , J. T. 2000 . Org. Lett. , 2 : 3277 – 3280 .
- Meyer , M. , Steinke , T. , Brandl , M. and Sühnel , J. 2001 . J. Comput. Chem. , 22 : 109 – 124 .
- Gu , J. and Leszczynski , J. 2002 . J. Phys. Chem. A , 106 : 529 – 532 .
- Hud , N. V. , Smith , F. W. , Anet , F. A. L. and Feigon , J. 1996 . Biochemistry , 35 : 15838 – 15390 .
- Gu , J. and Leszczynski , J. 2000 . J. Phys. Chem. A , 104 : 6308 – 6313 .
- Gu , J. and Leszczynski , J. 2001 . J. Phys. Chem. A , 105 : 10366 – 10371 .
- Becke , A. D. 1993 . J. Chem. Phys. , 98 : 5648 – 5652 .
- Lee , C. , Yang , G. and Parr , R. G. 1988 . Phys. Rev. B , 37 : 785 – 789 .
- Stephens , P. J. , Delvin , F. J. , Chabolowski , C. F. and Frisch , M. J. 1994 . J. Phys. Chem. , 98 : 11623 – 11627 .
- Godbout , N. , Salahub , D. R. , Andzelm , J. and Wimmer , E. 1992 . Can. J. Chem. , 70 : 560 – 571 .
- Frisch , M. J. , Trucks , G. W. , Schlegel , H. B. , Scuseria , G. E. , Robb , M. A. , Cheeseman , J. R. , Zakrzewski , V. G. , Montgomery , J. A. Jr. , Stratmann , R. E. , Burant , J. C. , Dapprich , S. , Millam , J. M. , Daniels , A. D. , Kudin , K. N. , Strain , M. C. , Farkas , O. , Tomasi , J. , Barone , V. , Cossi , M. , Cammi , R. , Mennucci , B. , Pomelli , C. , Adamo , C. , Clifford , S. , Ochterski , J. , Petersson , G. A. , Ayala , P. Y. , Cui , Q. , Morokuma , K. , Malick , D. K. , Rabuck , A. D. , Raghavachari , K. , Foresman , J. B. , Cioslowski , J. , Ortiz , J. V. , Baboul , A. G. , Stefanov , B. B. , Liu , G. , Liashenko , A. , Piskorz , P. , Komaromi , I. , Gomperts , R. , Martin , R. L. , Fox , D. J. , Keith , T. , Al-Laham , M. A. , Peng , C. Y. , Nanayakkara , A. , Gonzalez , C. , Challacombe , M. , Gill , P. M. W. , Johnson , B. G. , Chen , W. , Wong , M. W. , Andres , J. L. , Head-Gordon , M. , Replogle , E. S. and Pople , J. A. 1998 . GAUSSIAN , 98 Gaussian, Inc., Pittsburgh PA
- Boys , S. F. and Bernardi , F. 1970 . Mol. Phys. , 19 : 553 – 577 .
- Gu , J. , Leszczynski , J. and Bansal , M. 1999 . Chem. Phys. Lett. , 311 : 209 – 214 .
- Meyer , M. , Brandl , M. and Sühnel , J. 2001 . J. Phys. Chem. , A 105 : 8223 – 8225 .
- Meyer , M. , Schneider , C. , Brandl , M. and Sühnel , J. 2001 . J. Phys. Chem. A , 105 : 11560 – 11573 .
- Loit , G. , Hocquet , A. , Ghomi , M. , Meyer , M. and Sühnel , J. 2002 . Phys. Chem. Comm. , 5 : 94 – 98 .
- Gu , J. and Leszczynski , J. 2000 . J. Phys. Chem. A , 104 : 7353 – 7358 .
- Meyer , M. and Sühnel , J. 2003 . J. Phys. Chem. A , 107 in press
- Burgess , J. Ions in Solution: Basic Principles of Chemical Interactions 1998 Chichester : Ellis Horwood Limited .
- Kettani , A. , Bouaziz , S. , Gorin , A. , Zhao , H. , Jones , R. A. and Patel , D. J. 1998 . J. Mol. Biol. , 282 : 619 – 636 .
- Hardin , C. C. , Watson , T. , Corregan , M. and Bailey , C. 1992 . Biochemistry , 31 : 833 – 841 .
- Chaput , J. C. and Switzer , C. 1999 . Proc. Natl. Acad. Sci. , 96 : 10614 – 10619 .