References and Footnotes
- Pearson , W. and Lipman , D. 1988 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 85 : 2444 – 2448 .
- Altschul , S. , Gish , W. , Miller , W. , Myers , E. and Lipman , D. 1990 . J. Mol. Biol. , 215 : 403 – 10 .
- Altschul , S. F. , Madden , T. L. , Schaffer , A. A. , Zhang , J. , Zhang , Z. , Miller , W. and Lipman , D. J. 1997 . Nucleic Acids Res. , 17 : 3389 – 3402 .
- Cantalloube , H. , Nahum , C. , Achour , A. , Lehner , T. , Callebaut , I. , Burny , A. , Bizzini , B. , Mornon , J. P. , Zagury , D. and Zagury , J. F. 1994 . Comput. Appl. Biosci. , 10 : 153 – 161 .
- Cantalloube , H. , Labesse , G. , Chomilier , J. , Nahum , C. , Cho , Y. , Chams , V. , Achour , A. , Lachgar , A. , Mbika , J. , Issing , W. and Zagury , J. F. 1995 . Comput. Appl. Biosci. , 11 : 261 – 272 .
- Bleasby , A. J. , Akrigg , D. and Attwood , T. K. 1994 . Nucleic Acids Res. , 22 : 3574 – 3577 .
- Kallberg , Y. and Persson , B. 1999 . Bioinformatics , 15 : 260 – 261 .
- Li , W. , Jaroszewski , L. and Godzik , A. 2001 . Bioinformatics , 17 : 282 – 3 .
- Feng , D. , Johnson , M. and Doolittle , R. 1984 . J. Mol. Evol. , 21 : 112 – 125 .
- Henikoff , S. and Henikoff , J. 1992 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 89 : 10915 – 10919 .
- Berezovsky , I. , Kirzhner , V. , Kirzhner , A. , Rosenfeld , V. and Trifonov , E. 2003 . Prot. Engng. , 15 : 955 – 957 .
- Trifonov , E. N. , Kirzhner , A. , Kirzhner , V. M. and Berezovsky , I. N. 2001 . J. Mol. Evol. , 53 : 394 – 401 .
- Trifonov , E. N. and Berezovsky , I. N. 2003 . Curr. Opin. Struct. Biol. , 13 : 110 – 114 .
- Arabidopsis Genome Initiative . 2000 . Nature , 408 : 796 – 815 .
- Sonnhammer , E. L. and Durbin , R. 1994 . Comput. Applic. Biosci. , 10 : 301 – 307 .