References and Footnotes
- Pomerantz , R. J. and Horn , D. L. 2003 . Nat Med , 9 : 867 – 873 .
- Poignard , P. , Saphire , E. O. , Parren , P. W. and Burton , D. R. 2001 . Annu Rev Immunol , 19 : 253 – 274 .
- Eckert , D. and Kim , P. S. 2001 . Annu Rev Biochem , 70 : 777 – 810 .
- Burton , D. R. , Desrosiers , R. C. , Doms , R. W. , Koff , W. C. , Kwong , P. D. , Moore , J. P. , Nabel , G. J. , Sodroski , J. , Wilson , I. A. and Wyatt , R. T. 2004 . Nat Immunol , 5 : 233 – 236 .
- Salzwedel , K. , Smith , E. D. , Dey , B. and Berger , E. A. 2000 . J Virol , 74 : 326 – 333 .
- Kwong , P. D. , Wyatt , R. , Robinson , J. , Sweet , R. W. , Sodroski , J. and Hendrickson , W. A. 1998 . Nature , 393 : 648 – 659 .
- Kwong , P. D. , Wyatt , R. , Robinson , J. , Sweet , R. W. , Sodroski , J. and Hendrickson , W. A. 2000 . Struct Fold Des , 8 : 1329 – 1339 .
- Chan , D. C. , Fass , D. , Berger , J. M. and Kim , P. S. 1997 . Cell , 89 : 263 – 273 .
- Weissenhorn , W. , Dessen , A. , Harrison , S. C. , Skehel , J. J. and Wiley , D. C. 1997 . Nature , 387 : 426 – 430 .
- Moore , J. P. and Doms , R. W. 2003 . Proc Natl Acad Sci USA , 100 : 10598 – 10602 .
- Greenberg , M. , Cammack , N. , Salgo , M. and Smiley , L. 2004 . Rev Med Virol , 14 : 321 – 337 .
- Zwick , M. B. , Saphire , E. O. and Burton , D. R. 2004 . Nat Med , 10 : 133 – 134 .
- Chen , B. , Vogan , E. , Gong , H. Y. , Skehel , J. J. , Wiley , D. C. and Harrison , S. C. 2005 . Nature , 433 : 834 – 841 .
- Chen , B. , Vogan , E. M. , Gong , H. Y. , Skehel , J. J. , Wiley , D. C. and Harrison , S. C. 2005 . Structure , 13 : 197 – 211 .
- Kwong , P. D. 2005 . Nature , 433 : 815 – 816 .
- Wyatt , R. , Kwong , P. D. , Desjardins , E. , Sweet , R. W. , Robinson , J. , Hendrickson , W. A. and Sodroski , J. G. 1998 . Nature , 393 : 705 – 711 .
- Pantophlet , R. and Burton , D. R. 2003 . Trends Mol Med , 9 : 468 – 473 .
- Kwong , P. D. , Doyle , M. L. , Casper , D. J. , Cicala , C. , Leavitt , S. A. , Majeed , S. , Steenbeke , T. D. , Venturi , M. , Chaiken , I. , Fung , M. , Katinger , H. , Parren , P. W.I. H. , Robinson , J. , Ryk , D. V. , Wang , L. P. , Burton , D. R. , Freire , E. , Wyatt , R. , Sodroski , J. , Hendrickson , W. A. and Arthos , J. 2002 . Nature , 420 : 678 – 682 .
- Onufriev , A. , Bashford , D. and Case , D. A. 2004 . Proteins , 55 : 383 – 394 .
- Wu , Y. L. , Cao , Z. J. , Yi , H. , Jiang , D. H. , Mao , X. , Liu , H. and Li , W. X. 2004 . Biophys J , 87 : 105 – 112 .
- Gohlke , H. , Kiel , C. and Case , D. A. 2003 . J Mol Biol , 330 : 891 – 913 .
- Gohlke , H. and Case , D. A. 2003 . J Comput Chem , 25 : 238 – 250 .
- Berman , H. M. , Westbrook , J. , Feng , Z. , Gilliland , G. , Bhat , T. N. , Weissig , H. , Shindyalov , I. N. and Bourne , P. E. 2000 . Nucleic Acids Res , 28 : 235 – 242 .
- Guex , N. and Peitsch , M. C. 1997 . Electrophoresis , 18 : 2714 – 2723 .
- Case , D. A. , Pearlman , D. A. , Caldwell , J. W. , Cheatham , T. E. III , Wang , J. M. , Ross , W. S. , Simmerling , C. , Darden , T. , Merz , K. M. , Stanton , R. V. , Cheng , A. , Vincent , J. J. , Crowley , M. , Tsui , V. , Gohlke , H. , Radmer , R. , Duan , Y. , Pitera , J. , Massova , I. , Seibel , G. L. , Singh , U. C. , Weiner , P. and Kollman , P. A. 2002 . AMBER , 7 University of California, San Francisco
- Lu , M. , Blacklow , S. C. and Kim , P. S. 1995 . Nat Struct Biol , 2 : 1075 – 1082 .
- Dwyer , J. J. , Hasan , A. , Wilson , K. L. , White , J. M. , Matthews , T. J. and Delmedico , M. K. 2003 . Biochemistry , 42 : 4945 – 4953 .
- Eckert , D. and Kim , P. S. 2001 . Proc Natl Acad Sci USA , 98 : 11187 – 11192 .
- Louis , J. M. , Nesheiwat , I. , Chang , L. C. , Clore , G. M. and Bewley , C. A. 2003 . J Biol Chem , 278 : 20278 – 20285 .
- Kilby , J. M. , Hopkins , S. , Venetta , T. M. , DiMassimo , B. , Cloud , G. A. , Lee , J. Y. , Alldredge , L. , Hunter , E. , Lambert , D. , Bolognesi , D. , Matthews , T. , Johnson , M. R. , Nowak , M. K. , Shaw , G. M. and Saag , M. S. 1998 . Nat Med , 4 : 1302 – 1307 .
- Ferrer , M. , Kapoor , T. M. , Strassmaier , T. , Weissenhorn , W. , Skehel , J. J. , Oprian , D. , Schreiber , S. L. , Wiley , D. C. and Harrison , S. C. 1996 . Nat Struct Biol , 6 : 953 – 960 .
- Sia , S. K. , Carr , P. A. , Cochran , A. G. , Malashkevich , V. N. and Kim , P. S. 2002 . Proc Natl Acad Sci USA , 99 : 14664 – 14669 .
- Sia , S. K. and Kim , P. S. 2003 . Proc Natl Acad Sci USA , 100 : 9756 – 9761 .
- Joyce , J. G. , Hurni , W. M. , Bogusky , M. J. , Garsky , V. M. , Liang , X. P. , Citron , M. P. , Danzeisen , R. C. , Miller , M. D. , Shiver , J. W. and Keller , P. M. 2002 . J Biol Chem , 277 : 45811 – 45820 .
- Root , M. J. , Kay , M. S. and Kim , P. S. 2001 . Science , 291 : 884 – 888 .
- Root , M. J. and Hamer , D. H. 2003 . Proc Natl Acad Sci USA , 100 : 5016 – 5021 .
- Kwong , P. D. , Wyatt , R. , Statentau , Q. J. , Sodroski , J. and Hendrickson , W. A. 2000 . J Virol , 74 : 1961 – 1972 .
- Pan , Y. P. , Ma , B. Y. , Keskin , O. and Nussinov , R. 2004 . J Biol Chem , 279 : 30523 – 30530 .
- Rizzuto , C. D. , Wyatt , R. , Hernandez-Ramos , N. , Sun , Y. , Kwong , P. D. , Hendrickson , W. A. and Sodroski , J. A. 1998 . Science , 280 : 1949 – 1953 .
- Binley , J. M. , Sanders , R. W. , Clas , B. , Schuelke , N. , Master , A. , Guo , Y. , Kajumo , F. , Anselma , D. J. , Maddon , P. J. , Olson , W. C. and Moore , J. P. 2000 . J Virol , 74 : 627 – 643 .
- Schulke , N. , Vesanen , M. , Sanders , R. W. , Zhu , P. , Lu , M. , Anselma , D. J. , Villa , A. R. , Parren , P. W.H. I. , Binley , J. M. , Roux , K. H. , Maddon , P. J. , Moore , J. P. and Olson , W. C. 2002 . J Virol , 76 : 7760 – 7776 .
- Yang , X. Z. , Florin , L. , Farzan , M. , Kolchinsky , P. , Kwong , P. D. , Sodroski , J. and Wyatt , R. 2000 . J Virol , 74 : 4746 – 4754 .
- Yang , X. Z. , Wyatt , R. and Sodroski , J. 2001 . J Virol , 75 : 1165 – 1171 .
- Srivastava , I. K. , VanDorsten , K. , Vojtech , L. , Barnett , S. W. and Stamatatos , L. 2003 . J Virol , 77 : 2310 – 2320 .
- Helseth , E. , Olshevsky , U. , Furman , C. and Sodroski , J. 1991 . J Virol , 65 : 2119 – 2123 .
- Wyatt , R. , Desjardin , E. , Olshevsky , U. , Nixon , C. , Binley , J. , Olshevsky , V. and Sodroski , J. 1997 . J Virol , 71 : 9722 – 9731 .
- York , J. and Nunberg , J. H. 2004 . J Virol , 78 : 4921 – 4926 .
- Boutonnet , N. , Janssens , W. , Boutton , C. , Verschelde , J. L. , Heyndrickx , L. , Beirnaert , E. , Groen , G. V. D. and Lasters , I. 2002 . J Virol , 76 : 7595 – 7606 .
- Abrahamyan , L. G. , Markosyan , R. M. , Moore , J. P. , Cohen , F. S. and Melikyan , G. B. 2003 . J Virol , 77 : 5829 – 5836 .
- Chen , J. , Lee , K. H. , Steinhauer , D. A. , Stevens , D. J. , Skehel , J. J. and Wiley , D. C. 1998 . Cell , 95 : 409 – 417 .