References and Footnotes
- Dobson , C. M. 2002 . Nature , 418 : 729 – 730 .
- Dobson , C. M. 2003 . Nature , 426 : 884 – 890 .
- Selkoe , D. J. 2003 . Nature , 426 : 900 – 904 .
- Nilsson , M. R. 2004 . Methods , 34 : 151 – 160 .
- Groenning , M. , Norrman , M. , Flink , J. M. , van de Weert , M. , Bukrinsky , J. T. , Schluckebier , G. and Frokjaer , S. 2007 . J Struct Biol. , 159 : 483 – 497 .
- Rochet , J. C. and Lansbury , P. T. Jr. 2000 . Curr Opin Struct Biol , 10 : 60 – 68 .
- Dobson , C. M. 2005 . Nature , 435 : 747 – 749 .
- Makin , O. S. and Serpell , L. C. 2005 . Methods Mol Biol , 299 : 67 – 80 .
- Hepler , R. W. , Grimm , K. M. , Nahas , D. D. , Breese , R. , Dodson , E. C. , Acton , P. , Keller , P. M. , Yeager , M. , Wang , H. , Shughrue , P. , Kinney , G. and Joyce , J. G. 2006 . Biochemistry , 45 : 15157 – 15167 .
- Lesne , S. , Koh , M. T. , Kotilinek , L. , Kayed , R. , Glabe , C. G. , Yang , A. , Gallagher , M. and Ashe , K. H. 2006 . Nature , 440 : 352 – 357 .
- Bucciantini , M. , Calloni , G. , Chiti , F. , Formigli , L. , Nosi , D. , Dobson , C. M. and Stefani , M. 2004 . J Biol Chem , 279 : 31374 – 31382 .
- Bucciantini , M. , Giannoni , E. , Chiti , F. , Baroni , F. , Formigli , L. , Zurdo , J. , Taddei , N. , Ramponi , G. , Dobson , C. M. and Stefani , M. 2002 . N attire , 416 : 507 – 511 .
- Hardy , J. and Selkoe , D. J. 2002 . Science , 297 : 353 – 356 .
- Klein , W. L. 2002 . Neurochem Int , 41 : 345 – 352 .
- Selkoe , D. J. 2004 . Nat Cell Biol , 6 : 1054 – 1061 .
- Kim , W. and Hecht , M. H. 2006 . Proc Natl Acad Sci USA , 103 : 15824 – 15829 .
- Wang , S. S. S. and Good , T. A. 2005 . J Chin Inst Chem Engrs , 35 : 533 – 559 .
- Kheterpal , I. , Williams , A. , Murphy , C. , Bledsoe , B. and Wetzel , R. 2001 . Biochemistry , 40 : 11757 – 11767 .
- Williams , A. D. , Portelius , E. , Kheterpal , I. , Guo , J. T. , Cook , K. D. , Xu , Y. and Wetzel , R. 2004 . J Mol Biol , 335 : 833 – 842 .
- Wurth , C. , Guimard , N. K. and Hecht , M. H. 2002 . J Mol Biol , 319 : 1279 – 1290 .
- Buchete , N. V. , Tycko , R. and Hummer , G. 2005 . J. Mol Biol , 353 : 804 – 821 .
- Zheng , J. , Jang , H. , Ma , B. , Tsai , C. J. and Nussinov , R. 2007 . Biophys J , 93 : 3046 – 3057 .
- Nelson , R. , Sawaya , M. R. , Balbirnie , M. , Madsen , A. O. , Riekel , C. , Grothe , R. and Eisenberg , D. 2005 . Nature , 435 : 773 – 778 .
- Sawaya , M. R. , Sambashivan , S. , Nelson , R. , Ivanova , M. I. , Sievers , S. A. , Apostol , M. I. , Thompson , M. J. , Balbirnie , M. , Wiltzius , J. J. , McFarlane , H. T. , Madsen , A. O. , Riekel , C. and Eisenberg , D. 2007 . Native , 447 : 453 – 457 .
- Ma , B. and Nussinov , R. 2002 . Proc Natl Acad Sci USA , 99 : 14126 – 14131 .
- Daidone , I. , Simona , F. , Roccatano , D. , Broglia , R. A. , Tiana , G. , Colombo , G. and Di Nola , A. 2004 . Proteins: Struct Funct Genet , 57 : 198 – 204 .
- Colombo , G. , Daidone , I. , Gazit , E. , Amadei , A. and Di Nola , A. 2005 . Proteins: Struct Funct Genet , 59 : 519 – 527 .
- Gnanakaran , S. , Nussinov , R. and Garcia , A. E. 2006 . J Am Chem Soc , 128 : 2158 – 2159 .
- Gsponer , J. , Haberthur , U. and Caflisch , A. 2003 . Proc Natl Acad Sci USA , 100 : 5154 – 5159 .
- Melquiond , A. , Boucher , G. , Mousseau , N. and Derreumaux , E. 2005 . J Chem Phys , 122 : 174904
- Mousseau , N. and Derreumaux , P. 2005 . Acc Chem Res , 38 : 885 – 891 .
- Nguyen , H. D. and Hall , C. K. 2006 . J Am Chem Soc , 128 : 1890 – 1901 .
- Lopez de la Faz , M. , de Mori , G. M. , Serrano , L. and Colombo , G. 2005 . J. Mol Biol , 349 : 583 – 596 .
- Tartaglia , G. G. , Cavalli , A. , Fellarin , R. and Caflisch , A. 2005 . Protein Sci , 14 : 2723 – 2734 .
- Zanuy , D. and Nussinov , R. 2003 . J Mol Biol , 329 : 565 – 584 .
- Zanuy , D. , Haspel , N. , Tsai , H. H. , Ma , B. , Gunasekaran , K. , Wolfson , H. J. and Nussinov , R. 2004 . Phys Biol , 1 : 89 – 99 .
- Zanuy , D. , Porat , Y. , Gazit , E. and Nussinov , R. 2004 . Structure , 12 : 439 – 455 .
- Hwang , M. J. , Ni , X. , Waldman , M. , Ewig , C. S. and Hagler , A. T. 1998 . Biopolymers , 45 : 435 – 468 .
- Andersen , H. C. 1983 . J. Comput Phys , 52 : 24 – 34 .
- Tsai , H. H. , Zanuy , D. , Haspel , N. , Gunasekaran , K. , Ma , B. , Tsai , C. J. and Nussinov , R. 2004 . Biophys J , 87 : 146 – 158 .
- Haspel , N. , Zanuy , D. , Ma , B. , Wolfson , H. and Nussinov , R. 2005 . J Mol Biol , 345 : 1213 – 1227 .
- Ogawa , H. , Nakano , M. , Watanabe , H. , Starikov , E. B. , Rothstein , S. M. and Tanaka , S. 2008 . Comput Biol Chem , 32 : 102 – 110 .
- Zheng , J. , Ma , B. , Tsai , C. J. and Nussinov , R. 2006 . Biophys J , 91 : 824 – 833 .
- Cavalli , A. , Ferrara , F. and Caflisch , A. 2002 . Proteins: Struct Funct Genet , 47 : 305 – 314 .
- Rao , F. and Caflisch , A. 2003 . J. Comput Phys , 119 : 4035 – 4042 .
- Zheng , J. , Zanuy , D. , Haspel , N. , Tsai , C. J. , Aleman , C. and Nussinov , R. 2007 . Biochemistry , 46 : 1205 – 1218 .
- Colombo , G. , De Mori , G. M. and Roccatano , D. 2003 . Protein Sci , 12 : 538 – 550 .
- Colombo , G. , Roccatano , D. and Mark , A. E. 2002 . Proteins: Struct Funct Genet , 46 : 380 – 392 .
- Lopez de la Faz , M. , Lacroix , E. , Ramirez-Alvarado , M. and Serrano , L. 2001 . J. Mol Biol , 312 : 229 – 246 .
- Antzutkin , O. N. , Balbach , J. J. , Leapman , R. D. , Rizzo , N. W. , Reed , J. and Tycko , R. 2000 . Proc Natl Acad Sci USA , 97 : 13045 – 13050 .
- Benzinger , T. L. , Gregory , D. M. , Burkoth , T. S. , Miller-Auer , H. , Lynn , D. G. , Botto , R. E. and Meredith , S. C. 2000 . Biochemistry , 39 : 3491 – 3499 .
- Sato , T. , Kienlen-Campard , F. , Ahmed , M. , Liu , W. , Li , H. , Elliott , J. I. , Aimoto , S. , Constantinescu , S. N. , Octave , J. N. and Smith , S. O. 2006 . Biochemistry , 45 : 5503 – 5516 .
- Fradinger , E. A. , Monien , B. H. , Urbane , B. , Lomakin , A. , Tan , M. , Li , H. , Spring , S. M. , Condron , M. M. , Cruz , L. , Xie , C. W. , Benedek , G. B. and Bitan , G. 2008 . Proc Natl Acad Sci USA , 105 : 14175 – 14180 .