34
Views
7
CrossRef citations to date
0
Altmetric
Original Articles

Kinetic Effects on Signal Normalization in Oligonucleotide Microchips with Labeled Immobilized Probes

, , , , , , , & show all
Pages 235-244 | Received 25 Feb 2009, Published online: 15 May 2012

References and Footnotes

  • Chipping Forecast II . 2002 . Nature Genetics , 32 Supplement
  • Kolchinsky , A. and Mirzabekov , A. D. 2002 . Human Mutation , 19 : 343 – 360 .
  • Stoughton , R. B. 2005 . Annu Rev Biochem , 74 : 53 – 82 .
  • Gilad , Y. and Borevitz , J. 2006 . Curr Opin Genet Develop , 16 : 553 – 558 .
  • Chechetkin , V. R. , Prokopenko , D. V. , Makarov , A. A. and Zasedatelev , A. S. 2006 . Russian Nanotechnologies , 1 : 13 – 27 .
  • Pollack , J. R. 2007 . Amer J Pathol , 171 : 375 – 385 .
  • Yuen , T. , Wurmbach , E. , Pfeffer , R. L. , Ebersole , B. J. and Sealfon , S. C. 2002 . Nucleic Acids Res , 30 : e48
  • Yauk , C. L. , Berndt , M. L. , Williams , A. and Douglas , G. R. 2004 . Nucleic Acids Res , 32 : el24
  • Shippy , R. , Sendera , T. J. , Lockner , R. , Palaniappan , C. , Kaysser-Kranich , T. , Watts , G. and Alsobrook , J. 2004 . BMC Genomics , 5 : 61
  • Hardiman , G. 2004 . Pharmacogenomics , 5 : 487 – 502 .
  • Draghici , S. , Khatri , P. , Eklund , A. C. and Szallasi , Z. 2006 . Trends in Genetics , 22 : 101 – 109 .
  • Battaglia , C. , Salani , G. , Consolandi , C. , Bernardi , L. R. and De Bellis , G. 2000 . BioTechniques , 29 : 78 – 81 .
  • Shearstone , J. R. , Allaire , N. E. , Getman , M. E. and Perrin , S. 2002 . BioTechniques , 32 : 1051 – 1057 .
  • Wang , X. , Jia , S. , Meyer , L. , Xiang , B. , Chen , L.-Y. , Jiang , N. , Moreno , C. , Jacob , H. J. , Ghosh , S. and Hessner , M. J. 2006 . BMC Bioinformatics , 7 : 738
  • Yang , A. X. , Mejido , J. , Bhattacharya , B. , Petersen , D. , Han , J. , Kawasaki , E. S. and Puri , R. K. 2006 . Mol Biotechn , 34 : 303 – 315 .
  • Peterson , A. W. , Heaton , R. J. and Georgiadis , R. M. 2001 . Nucleic Acids Res. , 29 : 5163 – 5168 .
  • Naef , F. , Lim , D. A. , Patil , N. and Magnasco , M. 2002 . Phys Rev E , 65 : R040902 – 1 . -R040902–4
  • Binder , H. and Preibisch , S. 2005 . Biophys J , 89 : 337 – 352 .
  • Matveeva , O. V. , Shabalina , S. A. , Nemtsov , V. A. , Tsodikov , A. D. , Gesteland , R. F. and Atkins , J. F. 2003 . Nucleic Acids Res , 31 : 4211 – 4217 .
  • He , Z. , Wu , L. , Li , X. , Fields , M. W. and Zhou , J. 2005 . Appl Environ Microbiol , 71 : 3753 – 3760 .
  • Pozhitkov , A. , Noble , P. A. , Domazet-Loso , T. , Nolte , A. W. , Sonnenberg , R. , Staehler , P. , Beier , M. and Tautz , D. 2006 . Nucleic Acids Res , 34 : e66
  • Rubina , A. Yu. , Pan'kov , S. V. , Dementieva , E. I. , Pen'kov , D. N. , Butygin , A. V. , Vasiliskov , V. A. , Chudinov , A. V. , Mikheikin , A. L. , Mikhailovich , V. M. and Mirzabekov , A. D. 2004 . Anal Biochem , 325 : 92 – 106 .
  • Mikhailovich , V. , Lapa , S. , Gryadunov , D. , Sobolev , A. , Strizhkov , B. , Chernyh , N. , Skotnikova , O. , Irtuganava , O. , Moroz , A. , Litvinov , V. , Vladimirskii , M. , Perelman , M. , Chernousova , L. , Erokhin , V. , Zasedatelev , A. and Mirzabekov , A. 2001 . J Clinical Microbiology , 39 : 2531 – 2540 .
  • Gryadunov , D. , Mikhailovich , V. , Lapa , S. , Roudinskii , N. , Donnikov , M. , Pan'kov , S. , Markova , S. , Kuz'min , A. , Chernousova , L. , Skotnikova , O. , Moroz , A. , Zasedatelev , A. and Mirzabekov , A. 2005 . Clinical Microbiology and Infection , 11 : 531 – 539 .
  • Pan'kov , S. , Kreindlin , E. , Somova , O. , Moiseeva , O. , Zasedatelev , A. and Barsky , V. 2006 . Russian Patent , N2309959 February 02
  • Barsky , Y. , Grammatin , A. , Ivanov , A. , Kreindlin , E. , Kotova , E. , Barskii , V. and Mirzabekov , A. 1998 . J Opt Technol , 65 : 938 – 941 .
  • Johnson , N. L. and Leone , F. C. 1977 . Statistics and Experimental Design in Engineering and the Physical Sciences New York : Wiley .
  • Sorokin , N. V. , Chechetkin , V. R. , Livshits , M. A. , Vasiliskov , V. A. , Turygin , A. Y. and Mirzabekov , A. D. 2003 . J Biomol Struct Dyn , 21 : 279 – 288 .
  • Sorokin , N. V. , Chechetkin , V. R. , Pan'kov , S. V. , Somova , O. G. , Livshits , M. A. , Donnikov , M. Y. , Turygin , A. Y. , Barsky , V. E. and Zasedatelev , A. S. 2006 . J Biomol Struct Dyn , 24 : 57 – 66 .
  • Chechetkin , V. R. 2007 . Physics Letters A , 366 : 460 – 465 .
  • Dai , H. , Meyer , M. , Stepaniants , S. , Ziman , M. and Stoughton , R. 2002 . Nucleic Acids Res , 30 : e86
  • Sartor , M. , Schwanekamp , J. , Halbleib , D. , Mohamed , I. , Karyala , S. , Medvedovic , M. and Tomlinson , C. R. 2004 . Bio Techniques , 36 : 790 – 796 .
  • Sorokin , N. V. , Chechetkin , V. R. , Livshits , M. A. , Pan'kov , S. V. , Donnikov , M. Y. , Gryadunov , D. A. , Lapa , S. A. and Zasedatelev , A. S. 2005 . J Biomol Struct Dyn , 22 : 725 – 734 .
  • Sorokin , N. V. , Yurasov , D. Y. , Cherepanov , A. I. , Kozhekbaeva , J. M. , Chechetkin , V. R. , Gra , O. A. , Livshits , M. A. , Nasedkina , T. V. and Zasedatelev , A. S. 2007 . J Biomol Struct Dyn , 24 : 571 – 578 .
  • Blossey , R. and Bosio , A. 2002 . Langmuir , 18 : 2952 – 2954 .
  • Pappaert , K. , Ottevaere , H. , Thienpont , H. , van Hummelen , P. and Desmet , G. 2006 . BioTechniques , 41 : 609 – 616 .
  • Zhang , Y. , Hammer , D. A. and Graves , D. J. 2005 . Biophys J , 89 : 2950 – 2959 .
  • Bishop , J. , Blair , S. and Chagovetz , A. M. 2006 . Biophys J , 90 : 831 – 840 .
  • Bishop , J. , Wilson , C. , Chagovetz , A. M. and Blair , S. 2007 . Biophys J , 92 : L10 – L12 .
  • Bishop , J. , Chagovetz , A. M. and Blair , S. 2008 . Biophys J , 94 : 1726 – 1734 .

Reprints and Corporate Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

To request a reprint or corporate permissions for this article, please click on the relevant link below:

Academic Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

Obtain permissions instantly via Rightslink by clicking on the button below:

If you are unable to obtain permissions via Rightslink, please complete and submit this Permissions form. For more information, please visit our Permissions help page.