References
- Wang , D. , Helquist , P. , Wiech , N. L. and Wiest , O. 2005 . J Med Chem , 48 : 693 – 6947 .
- Bolden , J. , Peart , M. and Johnstone , R. 2006 . Nature , 5 : 769 – 784 .
- Roth , S. Y. , Denu , J. M. and Allis , C. D. 2001 . Annu Rev Biochem , 70 : 81 – 120 .
- Hodawadekar , S. C. and Marmorstein , R. 2007 . Oncogene , 26 : 5528 – 5540 .
- Thiagallingam , S. 2003 . Annu NY Acad Sci , 983 : 84 – 100 .
- Pazin , M. J. and Kadonaga , J. T. 1997 . Cell , 89 : 325 – 328 .
- Pennisi , E. 1997 . Science , 275 : 155 – 157 .
- Gantt , S. L. , Gattis , S. G. and Fierke , C. A. 2006 . Biochemistry , 45 : 6170 – 6178 .
- Baylin , S. B. and Ohm , J. E. 2006 . Nature Rev Cancer , 6 : 107 – 116 .
- Xu , W. S. , Parmigiani , R. B. and Marks , P. A. 2007 . Oncogene , 26 : 5541 – 5552 .
- Lund , A. H. and van Lohuizen , M. 2004 . Genes Dev , 18 : 2315 – 2335 .
- Rosato , R. R. and Grant , S. 2003 . Cancer Biol Ther , 2 : 30 – 37 .
- Villar-Garea , A. and Esteller , M. 2004 . Int J Cancer , 112 : 171 – 178 .
- Jabbour , E. J. and Giles , F. J. 2005 . Curr Hematol Rep , 4 : 191 – 199 .
- Lindemann , R. K. , Gabrielli , B. and Johnstone , R. W. 2004 . Cell Cycle , 3 : 779 – 788 .
- Marks , P. and Jiang , X. 2005 . Cell Cycle , 4 : 549 – 551 .
- Abel , T. and Zukin , R. S. 2008 . Curr Opin Pharmacol , 8 : 57 – 64 .
- Verdin , E. , Dequiedt , F. and Kasler , H. G. 2003 . Trends Genet , 19 : 286 – 293 .
- Simonsson , M. , Heldin , C. H. , Ericsson , J. and Gronroos , E. 2005 . J Biol Chem , 280 : 21797 – 21803 .
- Li , M. , Luo , J. , Brooks , C. L. and Gu , W. 2002 . J Biol Chem , 277 : 50607 – 50611 .
- Kaiser , C. and James , S. R. 2004 . BMC Biol , 2 : 23
- Cui , Y. , Zhang , M. , Pestell , R. , Curran , E. M. , Welshons , W. V. and Fuqua , S. A. 2004 . Cancer Res , 64 : 9199 – 9208 .
- Vannini , A. , Volpari , C. , Filocamo , G. , Casavola , E. C. , Brunetti , M. , Renzoni , D. , Chakravarty , P. , Paolini , C. , De Francesco , R. , Gallinari , P. , Steinkuhler , C. and Di Marco , S. 2004 . Proc Natl Acad Sci USA , 101 : 15064 – 15069 .
- Christianson , D. W. and Lipscomb , W. N. 1989 . Acc Chem Res , 22 : 62 – 69 .
- Kadosh , D. and Struhl , K. 1998 . Genes Dev , 12 : 797 – 805 .
- Hassig , C. A. , Tong , J. K. , Fleischer , T. C. , Owa , T. , Grable , P. G. , Ayer , D. E. and Schreiber , S. L. 1998 . Proc Natl Acad Sci USA , 95 : 3519 – 3524 .
- Vanommeslaeghe , K. , Van Alsenoy , C. , De Proft , F. , Martins , J. C. , Tourwé , D. and Geerlings , P. 2003 . Org Biomol Chem , 21 : 2951 – 2957 .
- Somoza , J. R. , Skene , R. J. , Katz , B. A. , Mol , C. , Ho , J. D. , Jennings , A. J. , Luong , C. , Arvai , A. , Buggy , J. J. , Chi , E. , Tang , J. , Sang , B. C. , Verner , E. , Wynands , R. , Leahy , E. M. , Dougan , D. R. , Snell , G. , Navre , M. , Knuth , M. W. , Swanson , R. V. , McRee , D. E. and Tari , L. W. 2004 . Structure , 12 : 1325 – 1334 .
- Finnin , M. S. , Donigian , J. R. , Cohen , A. , Richon , V. M. , Rifkind , R. A. , Marks , P. A. , Breslow , R. and Pavletich , N. P. 1999 . Nature , 401 : 188 – 193 .
- Hildmann , C. , Wegener , D. , Riester , D. , Hempel , R. , Schober , A. , Merana , J. , Giurato , L. , Guccione , S. , Nielsen , T. K. , Ficner , R. and Schwienhorst , A. 2006 . J Biotech , 124 : 258 – 270 .
- Hassig , C. A. , Tong , J. K. , Fleischer , T. C. , Owa , T. , Grable , P. G. , Ayer , D. E. and Schreiber , S. L. 1998 . Proc Natl Acad Sci USA , 95 : 3519 – 3524 .
- Kadosh , D. and Struhl , K. 1998 . Genes Dev , 12 : 797 – 805 .
- Minucci , S. and Pelicci , P. G. 2006 . Nat Rev Cancer , 6 : 38 – 51 .
- Moradei , O. , Maroun , C. R. , Paquin , I. and Vaisburg , A. 2005 . Curr Med Chem Anti Canc Agents , 5 : 529 – 560 .
- Estiu , G. , West , N. , Mazitschek , R. , Greenberg , E. , Bradner , J. E. and Wiest , O. 2010 . Bioorg Med Chem , 18 : 4103 – 4110 .
- Thangapandian , S. , John , S. , Sakkiah , S. and Lee , K. W. 2010 . J Mol Graph Model , 29 : 382 – 395 .
- Thangapandian , S. , John , S. , Sakkiah , S. and Lee , K. W. 2010 . Eur J Med Chem , 45 : 4409 – 4417 .
- Butler , K. V. , He , R. , McLaughlin , K. , Vistoli , G. , Langley , B. and Kozikowski , A. P. 2009 . ChemMedChem , 4 : 1292 – 1301 .
- Wang , D. , Helquist , P. , Wiech , N. L. and Wiest , O. 2005 . J Med Chem , 48 : 6936 – 6947 .
- KrennHrubec , K. , Marshall , B. L. , Hedglin , M. , Verdin , E. and Ulrich , S. M. 2007 . Bioorg Med Chem Lett , 17 : 2874 – 2878 .
- Sternson , S. M. , Wong , J. C. , Grozinger , C. M. and Schreiber , S. L. 2001 . Org Lett , 3 : 4239 – 4242 .
- Haggarty , S. J. , Koeller , K. M. , Wong , J. C. , Grozinger , C. M. and Schreiber , S. L. 2003 . Proc Natl Acad Sci USA , 100 : 4389 – 4394 .
- Hu , E. , Dul , E. , Sung , C. , Chen , Z. , Kirkpatrick , R. , Zhang , G. , Johanson , K. , Liu , R. , Lago , A. , Hofmann , G. , Macarron , R. , Frailes , M. D. L. , Perez , P. , Krawiec , J. , Winkler , J. and Jaye , M. 2003 . J Pharmacol Exp Ther , 307 : 720 – 728 .
- Apweiler , R. , Bairoch , A. , Wu , C. H. , Barker , W. C. , Boeckmann , B. , Ferro , S. , Gasteiger , E. , Huang , H. , Lopez , R. , Magrane , M. , Martin , M. J. , Natale , D. A. , O'Donovan , C. , Redaschi , N. and Yeh , L. L. 2004 . Nucleic Acids Res , 1 : D115 – D119 .
- McGinnis , S. and Madden , T. L. 2004 . Nucleic Acids Res , 1 : W20 – W25 .
- Eswar , N. , Marti-Renom , M. A. , Webb , B. , Madhusudhan , M. S. , Eramian , D. , Shen , M. , Pieper , U. and Sali , A. 2006 . Comparative Protein Structure Modeling With MODELLER. Current Protocols in Bioinformatics. John Wiley & Sons, Inc. . Supplement 15, 5.6.1–5.6.30
- Sali , A. and Blundell , T. L. 1993 . Mol Biol , 234 : 779 – 815 .
- Laskowski , R. A. , MacArthur , M. W. , Moss , D. and Thornton , J. M. 1993 . J Appl Cryst , 26 : 283 – 291 .
- Hooft , R. W. W. , Vriend , G. , Sander , C. and Abola , E. E. 1996 . Nature , 381 : 272 – 272 .
- Wiederstein , M. and Sippl , M. J. 2007 . Nucleic Acids Res , 35 : W407 – W410 .
- Gessica , F. and Christian , S. 2005 . Patents WO/2005/071079
- Verdonk , M. L. , Cole , J. C. , Hartshorn , M. J. , Murray , C. W. and Taylor , R. D. 2003 . Proteins , 52 : 609 – 623 .
- Cheng , F. , Wang , Q. , Chen , M. , Quiocho , F. A. and Ma , J. 2008 . Proteins , 70 : 1228 – 1234 .
- Jin , B. , Lee , H. M. and Kim , S. K. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 457 – 464 .
- Roy , S. and Thakur , A. R. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 443 – 455 .
- Carra , C. and Cucinotta , F. A. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 407 – 427 .
- Yu , Y. , Wang , Y. , He , J. , Liu , Y. , Li , H. , Zhang , H. and Song , Y. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 641 – 649 .
- Cao , Z. and Wang , J. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 651 – 661 .
- Sharma , S. , Sonavane , U. B. and Joshi , R. R. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 663 – 676 .
- Aman , M. J. , Karauzum , H. , Bowden , M. G. and Nguyen , T. L. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 1 – 12 .
- Chang , L. K. , Zhao , J. H. , Liu , H. L. , Wu , J. W. , Chuang , C. K. , Liu , K. T. , Chen , J. T. , Tsai , W. B. and Ho , Y. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 39 – 50 .
- Yuan , Y. , Knaggs , M. H. , Poole , L. B. , Fetrow , J. S. and Salsbury , F. R. Jr. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 51 – 70 .
- Koshy , C. , Parthiban , M. and Sowdhamini , R. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 71 – 83 .
- Sharadadevi , A. and Nagaraj , R. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 541 – 550 .
- Tuszynska , I. and Bujnicki , J. M. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 511 – 520 .
- Sklenovsky , P. and Otyepka , M. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 521 – 539 .
- Tao , Y. , Rao , Z. and Liu , S. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 143 – 158 .
- Hess , B. , Kutzner , C. , van der Spoel , D. and Lindahl , E. 2008 . J Chem Theory Comput , 4 : 435 – 447 .
- van der Spoel , D. , Lindahl , E. , Hess , B. , Groenhof , G. , Mark , A. E. and Berendsen , H. J. C. 2005 . J Comput Chem , 26 : 1701 – 1718 .
- Balasubramanian , S. , Ramos , J. , Luo , W. , Sirisawad , M. , Verner , E. and Buggy , J. J. 2008 . Leukemia , 22 : 1026 – 1034 .
- Wang , D. 2009 . Curr Top Med Chem , 9 : 241 – 256 .