Complete mitochondrial genome of Saltator similis (Aves, Passeriformes)

References

• Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. 1990. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 215:403–410.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Bernt M, Donath A, Jühling F, Externbrink F, Florentz C, Fritzsch G, Pütz J, Middendorf M, Stadler PF. 2013. MITOS: improved de novo metazoan mitochondrial genome annotation. Mol Phylogenet Evol. 69:313–319.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• BirdLife International. 2018. Species factsheet: Saltator similis; [accessed 2018 Oct 25]. http://www.birdlife.org.
   Google Scholar
• Borges RC, Oliveira A, Bernardo N, Costa RMMC. 2006. Diagnóstico da fauna silvestre apreendida e recolhida pela Polícia Militar de Meio Ambiente de Juiz de Fora, MG (1998 e 1999). Revista Brasileira de Zoociências. 8:23–33.
   Google Scholar
• Destro GFG. 2012. Efforts to combat wild animals trafficking in Brazil. In: Lammed GA, editor. Biodiversity enrichment in a diverse world. Sao Paolo: InTech; p. 421–436.
   Google Scholar
• Felker RM, Dörr AC, Rovedder AP, Piazza EM, Dick G. 2013. Levantamento parcial da avifauna apreendida pelo Escritório Regional do Ibama de Santa Maria-RS. Revista Eletrônica em Gestão, Educação e Tecnologia Ambiental, Santa Maria, v 11, n. 11, p. 2506–2510; [accessed 2016 Aug 18]. http://cascavel.ufsm.br/revistas/ojs-2.2.2/index.php/reget/article/download/8734/pdf
   Google Scholar
• Felsenstein J. 1985. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution. 39:783–791.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Franco MR, Câmara FM, Rocha DCC, Souza RM, Oliveira NJF. 2012. Animais silvestre apreendidos no período de 2002 a 2007 na macrorregião de Montes Claros. Minas Gerais. Enciclopédia Biosfera, Centro Científico Conhecer. 8:1007–1018.
   Google Scholar
• Françoso E, Gomes F, Arias MC. 2015. A protocol for isolating insect mitochondrial genomes: a case study of NUMT in Melipona flavolineata (Hymenoptera: Apidae). Mitochondrial DNA Part A. 27:1–4.
   Web of Science ®Google Scholar
• Freitas ACP, Oviedo-Pastrana ME, Vilela DAR, Pereira PLL, Loureiro LOC, Haddad JPA, Martins NRS, Soares DFM. 2015. Diagnóstico de animais ilegais recebidos no centro de triagem de animais silvestres de Belo Horizonte, Estado de Minas Gerais, no ano de 2011. Cienc Rural. 45:163–170.
   Web of Science ®Google Scholar
• Gasteiger E, Gattiker A, Hoogland C, Ivanyi I, Appel RD, Bairoch A. 2003. ExPASy: the proteomics server for in-depth protein knowledge and analysis. Nucleic Acids Res. 31:3784–3788.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Gogliath M, Bisaggio EL, Ribeiro LB, Resgalla AE, Borges RC. 2010. Avifauna apreendida e entregue voluntariamente ao Centro de Triagem de Animais Silvestres (Cetas) do Ibama de Juiz de Fora, Minas Gerais. Atualidades Ornitológicas on-Line; 154:55–59 [accessed 2016 Aug 18]. http://www.ao.com.br/download/ao154_55.pdf.
   Google Scholar
• Gonder MK, Mortensen HM, Reed FA, de Sousa A, Tishkoff SA. 2007. Whole-mtDNA genome sequence analysis of ancient African Lineages. Mol Biol Evol. 24:757–768.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Guala G, Döring M. 2019. Integrated Taxonomic Information System (ITIS). National Museum of Natural History, Smithsonian Institution. [accessed via GBIF.org on 2019-05-17] Checklist dataset https://doi.org/10.15468/rjarmt
   Google Scholar
• Kimura M. 1980. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J Mol Evol. 16:111–120.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Liang W, Yunlin Z, Zhenggang X, Tian H, Libo Z, Shiquan L. 2018. The complete mitochondrial genome and phylogeny of Geospiza magnirostris (Passeriformes: Thraupidae). Conserv Gen Res. 2:1–3.
   Google Scholar
• Ludwig S, Martins APV, Queiroz ALL, Carmo AO, Oliveira-Mendes BBR, Kalapothakis E. 2017. Complete mitochondrial genome of Sporophila maximiliani (Ave, Passeriformes). Mitochondrial DNA Part B. 2:2:417–418.
   Web of Science ®Google Scholar
• Manhães MA, Loures-Ribeiro A. 2011. The avifauna of the Poço D’Anta Municipal Biological Reserve, Juiz de Fora, MG. Biota Neotrop. 11:275–286.
   Web of Science ®Google Scholar
• Nunes PB, Barreto AS, Franco EZ. 2012. Subsídios à ação fiscalizatória no combate ao tráfico de aves silvestres e exóticas em Santa Catarina. Ornithologia. Matinhos, n. 5, n. 1, p. 28–33; [accessed 2016 Aug 2]. http://www.cemave.net/publicacoes/index.php/ornithologia/article/view/75/78.
   Google Scholar
• Quinn TW, Wilson AC. 1993. Sequence evolution in and around the mitochondrial control region in birds. J Mol Evol. 37:417–425.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Raposo do Amaral F, Neves LG, Resende MF Jr, Mobili F, Miyaki CY, Pellegrino KC, Biondo C. 2015. Ultraconserved elements sequencing as a low-cost source of complete mitochondrial genomes and microsatellite markers in non-model amniotes. PLoS One. 10:e0138446.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Saitou N, Nei M. 1987. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol Biol Evol. 4:406–425.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• SEMA/PMA. Polícia Militar Ambiental De São Paulo (PMA-SP). 2006. Tráfico de Animais Silvestres da Fauna Nacional – Dados estatísticos e estratégias operacionais 2001–2005; [accessed 2016 Aug 3]. http://www.pea.org.br/educativo/relatorio_policia_ambiental.pdf
   Google Scholar
• Silva NS. 2015. Espécimes recebidos no centro de triagem de animais silvestres de salvador/BA durante os anos de 2012 a 2014. Trabalho de Conclusão de Curso. Salvador: Universidade Federal da.
   Google Scholar
• Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. 2013. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol. 30:2725–2729.
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Universidade Federal De Viçosa (UFV). 2009. Museu de Zoologia João Moojen. Bicho da vez n° 4. Trinca-ferro-verdadeiro (Saltator similis); [accessed 2018 Dec 15]. http://www.museudezoologia.ufv.br/bichodavez/edicao04.pdf
   Google Scholar
• Zocche JJ, Viana IR. 2013. Avifauna apreendida no extremo sul catarinense: apreensões feitas durante oito anos de fiscalização e combate à captura de aves silvestres. Revista Brasileira de Biociências. Porto Alegre. 11:395–404.
   Google Scholar