Advanced search
Publication Cover
Analytical Letters Volume 37, 2004 - Issue 11
Submit an article Journal homepage
135
Views
15
CrossRef citations to date
0
Altmetric
Mini‐Review

New Horizons with A Multi Dimensional Tool for Applications in Analytical Chemistry—Aptamer

Vivek Babu Kandimalla Department of Chemistry, State Key Laboratory of Coordination Chemistry, Institute of Chemical Biology, Nanjing University, Nanjing, 210093, P.R. China
&
Huangxian Ju Department of Chemistry, State Key Laboratory of Coordination Chemistry, Institute of Chemical Biology, Nanjing University, Nanjing, 210093, P.R. ChinaCorrespondence[email protected]
Pages 2215-2233 | Received 23 Jan 2004, Accepted 19 Mar 2004, Published online: 22 Aug 2007

References

  • Watson , J. and Krick , F. 1953 . Nature , 171 : 737
  • Famulok , M. 1999 . Curr. Opin. Struct. Biol. , 9 : 324
  • Famulok , M. and Mayer , G. 1999 . Curr. Top. Microbiol. Immunol. , 243 : 123
  • Jayasena , S. D. 1999 . Clin. Chem. , 45 : 1628
  • Proske , D. , Gilch , S. , Wopfner , F. , Schatzl , H. M. , Winnacker , E. L. and Famulok , M. 2002 . Chem. Biochem. , 3 : 717
  • Tuerk , L. and Gold , L. 1990 . Science , 249 : 505
  • Ellington , A. D. and Szostak , J. W. 1990 . Nature , 346 : 818
  • Ruckman , J. 1998 . J. Biol. Chem. , 273 : 20,556
  • Bacher , J. M. and Ellington , A. D. 1998 . DDT , 3 : 265
  • Gold , L. J. 1995 . Biol. Chem. , 270 : 13581
  • Gold , L. 1995 . Annu. Rev. Biochem. , 64 : 763
  • Li , J. J. , Fang , X. and Tan , W. 2002 . Biochem. Biophys. Res. Commun. , 292 : 31
  • Breaker , R. R. 2002 . Curr. Opin. Biotechnol. , 12 : 31
  • Luzi , E. , Mununni , M. , Tombelli , S. and Mascini , M. 2003 . Trends Anal. Chem. , 22 : 810
  • Murphy , M. B. , Fuller , S. T. , Richardson , P. M. and Doyle , S. A. 2003 . Nucl. Acids Res. , 31 : e110
  • John , G. B. and Johnathan , L. K. 1999 . Biosens. Bioelectron. , 14 : 457
  • Eaton , B. E. , Gold , L. and Zichi , D. A. 1995 . Chem. Biol. , 2 : 633
  • Gold , L. , Brown , D. , He , Y. Y. , Shtatland , T. , Singer , B. S. and Wu , Y. 1997 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 94 : 59
  • Kevin , N. M. , Kirk , B. J. , Julin , C. M. , Weil , M. and Gold , L. 1998 . Biochem. , 95 : 2902
  • Michael , B. M. , Fuller , S. T. , Richardson , P. M. and Doyle , S. A. 2003 . Nucl. Acids Res. , 31 : e110
  • Moreno , M. , Rincon , E. , Pineiro , D. , Fernandez , G. , Domingo , A. , Jimenez‐Ruiz , A. , Salinas , M. and Gonzalez , V. M. 2003 . Biochem. Biophys. Res. Commun. , 308 : 214
  • Famulok , M. J. 1994 . J. Am. Chem. Soc. , 116 : 1698
  • Nieuwlandt , D. , Wecker , M. and Gold , L. 1995 . Biochemistry , 34 : 5651
  • Wallace , S. T. and Schraeder , R. 1996 . RNA , 4 : 112
  • Buke , D. H. and Hoffman , D. C. 1997 . Chem. Biol. , 4 : 833
  • Kopylov , A. M. and Spiridonova , V. A. 2000 . Mol. Biol. , 34 : 940
  • O'Sullivan , C. K. 2002 . Anal. Bioanal. Chem. , 372 : 44
  • Gordan , E. M. , Barret , R. W. Dower , D. J. 1994 . J. Med. Chem. , 37 : 1385
  • Srisawat , C. , Goldstein , I. J. and Engelke , D. R. 2001 . Nucl. Acids Res. , 29 : 4
  • Bachler , M. , Schroeder , R. and Ahsen , U. 1999 . RNA , 5 : 1509
  • Andrew , R. , Smithers , N. , Chapman , T. , Parsons , S. and Rees , S. 2001 . FEBS Lett. , 506 : 85
  • Patel , D. J. 1997 . Curr. Opin. Chem. Biol. , 1 : 32
  • Hermann , T. and Patel , D. J. 2000 . Science , 287 : 820
  • Hermann , T. and Patel , D. J. 2000 . Struct. Fold. Des. , 15 : 47
  • Mc Gregor , A. , Murray , J. B. Adans , C. J. 1999 . J. Biol. Chem. , 74 : 2256
  • Willis , M. C. , Hieke , B. J. Uhlenbeck , O. C. 1993 . Science , 262 : 1255
  • Hieke , B. J. , Willis , M. C. , Koch , T. H. and Cech , T. R. 1994 . Biochemistry , 33 : 3364
  • Dougan , H. , Lyster , D. M. , Vo , C. V. , Stafford , A. , Weitz , J. and Hobbs , J. B. 2000 . Nucl. Med. Biol. , 27 : 289
  • Williams , K. P. , Liu , H. X. , Schumacher , T. N.M. , Lin , H. Y. , Ausiello , D. A. , Kim , P. S. and Bartel , D. P. 1997 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 94 : 11285
  • Green , L. S. , Jellinek , D. Bell , C. 1995 . Chem. Biol. , 2 : 683
  • Tam , R. C. , Wu‐Pong , S. Pai , B. 1999 . Antisense Nucl. Acid Drug Dev. , 9 : 289
  • Heidenreich , O. and Eckstein , F. 1992 . J. Biol. Chem. , 267 : 1904
  • Pagratis , N. C. , Bell , C. Chang , Y. C. 1997 . Nat. Biotechnol. , 15 : 68
  • Biesecker , G. , Dihel , L. , Enney , K. and Bendele , R. A. 1999 . Immunopharmacology , 42 : 219
  • Kusser , W. 2000 . Rev. Modern Biotechnol. , 74 : 27
  • Green , L. S. , Jellinek , D. , Bell , C. , Beebe , L. A. , Feistner , B. D. , Gill , S. C. , Jucker , F. M. and Janjic' , N. 1995 . Chem. Biol. , 2 : 683
  • Willis , M. C. , Collins , B. , Zhang , T. , Green , L. S. , Sebesta , D. P. , Carol , B. , Bell , Kellogg , B. E. , Gill , S. C. , Magallanez , A. , Knauer , S. , Bendele , R. A. , Gill , P. S. and Janjic , N. 1998 . Bioconjugat Chem. , 9 : 573
  • Hamaguchi , N. , Ellington , A. and Stanton , W. 2001 . Anal. Biochem. , 294 : 126
  • Stojanovic , M. N. , Prasd , P. de. and Landry , D. W. 2000 . J. Am. Chem. Soc. , 122 : 11547
  • Jhaveri , S. D. , Kirby , R. , Conrad , R. , Maglott , E. J. , Bowser , M. , Kennedy , R. T. , Glick , G. and Ellington , A. D. 2000 . J. Am Chem. Soc. , 122 : 2469
  • Yamana , K. , Ohtani , Y. , Nakano , H. and Saito , I. 2003 . Bioorg. Med. Chem. Lett. , 13 : 3429
  • Brune , M. 1998 . Biochemistry , 37 : 10370
  • Gilardi , G. , Zhou , Q. , Hibbert , L. and Cass , A. E. 1994 . Anal. Chem. , 66 : 3840
  • Marvin , J. S. 1997 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 94 : 4366
  • Jhaveri , S. , Rajendran , M. and Ellington , A. D. 2000 . Nat. Biotechnol. , 18 : 1293
  • Osborne , S. E. , Matsumura , I. and Ellington , A. D. 1997 . Curr. Opin. Chem. Biol. , 1 : 5
  • Jenison , D. W. Smith , R. D. 1999 . Comb. Chem. High Throughput Screen. , 2 : 271
  • Davis , K. A. , Abrams , B. , Lin , Y. and Jayasena , S. D. 1996 . Nucl. Acids Res. , 24 : 702
  • Osborne , S. E. and Ellington , A. D. 1997 . Chem. Rev. , 97 : 349
  • Brody , E. N. and Gold , L. 2000 . Mol. Biotechnol. , 74 : 5
  • Hesselberth , J. , Robertson , M. P. , Jhaveri , S. and Ellington , A. D. 2000 . Mol. Biotechnol , 74 : 15
  • Hicke , B. J. and Stephens , A. W. 2000 . J. Clin. Invest. , 106 : 923
  • Tuerk , C. and Gold , L. 1990 . Science , 9 : 505
  • Cox , J. C. , Rajendran , M. , Riedel , T. , Davidson , E. A. , Sooter , L. J. , Bayer , T. S. , Schmitz‐Brown , M. and Ellington , A. D. 2002 . Comb. Chem. High Throughput Screen , 5 : 289
  • Jenison , R. C. , Gill , S. C. , Pardi , A. and Polisky , B. 1994 . Science , 263 : 1425
  • Xu , W. and Ellington , A. D. 1996 . Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , 93 : 7475
  • Jenison , R. C. , Gill , S. C. , Pardi , A. and Polisky , B. 1994 . Science , 263 : 1425
  • Conrad , R. , Keranen , L. M. , Ellington , A. D. and Newton , A. C. 1994 . J. Biol. Chem. , 269 : 32051
  • Ito , Y. , Fujita , S. , Kawazoe , N. and Imanishi , Y. 1998 . Anal. Chem. , 70 : 3510
  • Drolet , D. W. , Jayasena , S. D. and Gold , L. US Patent 5, 789163 .
  • Pagratis , N. C. , Bell , C. Chang , Y. C. 1997 . Nat. Biotechnol. , 15 : 68
  • Liu , S. Q. , Yu , J. H. and Ju , H. X. 2003 . J. Electroanal. Chem. , 540 : 61
  • Yu , J. H. , Liu , S. Q. and Ju , H. X. 2003 . Biosens. Bioelectron. , 19 : 401
  • Rekha , K. , Thakur , M. S. and Karanth , N. G. 2000 . Curr. Rev. Biotechnol. , 20 : 213
  • Thakur , M. S. and Karanth , N. G. 2003 . Advances in Biosensors Edited by: Malhotra , B. D. and Turner , A. P.F. Vol. 5 , 131 Elsevier Science BV. .
  • Stefan , R. I. , Girmai , B. R. , Frederick , V. S.J. and Hassan , Y. A.E. 2003 . Talanta , 59 : 883
  • Mallat , E. , Barceló , D. , Barzen , C. , Gauglitz , G. and Abuknesha , R. 2001 . Trends Anal. Chem. , 20 : 124
  • Du , D. , Yan , F. , Liu , S. and Ju , H. X. 2003 . J. Immunol. Methods , 283 : 67
  • Ju , H. X. , Yan , G. F. , Chen , F. and Chen , H. Y. 1999 . Electroanalysis , 11 : 124
  • Dai , Z. , Yan , F. , Chen , J. and Ju , H. X. 2003 . Anal. Chem. , 75 : 5429
  • Rekha , K. , Gouda , M. D. , Thakur , M. S. and Karanth , N. G. 2000 . Biosens. Bioelectron. , 15 : 499
  • Yu , J. H. and Ju , H. X. 2003 . Anal. Chim. Acta. , 486 : 209
  • Liu , S. Q. and Ju , H. X. 2003 . Analyst , 124 : 1420
  • Bousse , L. 1996 . Sensor Actuator B: Chem. , 34 : 270
  • Jellinek , D. , Green , L. S. , Bell , C. and Janjic , N. 1994 . Biochemistry , 33 : 10450
  • Jellinek , D. , Linott , C. K. , Rifkin , D. B. and Janjic , N. 1993 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 90 : 11227
  • Smith , D. , Kischenheuter , G. P. Charlton , J. 1995 . Chem. Biol. , 2 : 741
  • Potyrailo , R. A. , Conrad , R. C. , Ellington , A. D. and Hieftje , G. M. 1998 . Anal. Chem. , 70 : 3419
  • Deng , Q. , German , I. , Buchanan , D. and Kennedy , R. T. 2001 . Anal. Chem. , 73 : 5415
  • Rusconi , C. P. , Yeh , A. , Lyerly , H. K. , Lawson , J. H. and Sullenger , B. A. 2000 . Thromb. Haemost. , 84 : 841
  • Gregory , B. , Dihel , L. , Enney , K. and Bendele , R. A. 1999 . Immunopharmacology , 42 : 219
  • Donald , H. , Scates , B. L. , Andrews , K. and Gold , L. 1996 . J. Mol. Biol. , 264 : 650
  • Leva , S. , Lichte , A. , Burmeister , J. , Muhn , P. , Jahnke , D. , Fesser , D. , Erfurth , J. , Burgstaller , P. and Klussmann , S. 2002 . Chem. Biol. , 9 : 351
  • Homann , M. and Goringer , H. U. 2001 . Nucl. Acids Res. , 27 : 2006
  • Hicke , B. J. , Marion , C. , Chang , Y. F. , Gould , T. , Lynott , C. K. , Parma , D. , Schmidt , P. G. and Warren , S. 2001 . J. Biol. Chem. , 276 : 48644
  • Hwang , J. , Fauzi , H. , Fukuda , K. , Sekiya , S. , Kakiuchi , N. , Taira , K. , Kusakabe , I. and Nishikawa , S. 2000 . Nucl. Acids Symp. Ser. , 44 : 253
  • Wanga , B. , Hanb , K. and Leea , S. W. 2003 . FEBS Lett. , 548 : 85
  • Ylera , F. , Lurz , R. , Erdmann , V. A. and Furste , J. P. 2002 . Biochem. Biophys. Res. Commun. , 290 : 1583
  • Nam , V. V. , Oh , J.‐W. and Lai , M. M. 2003 . Virology , 307 : 301
  • Spiridonova , V. A. , Rog , E. V. , Dugina , T. N. , Strukova , S. M. and Kopylov , A. M. 2003 . Russian, J. Bioorg. Chem. , 29 : 450 Translated from Bioorganicheskaya Khimiya, 2003, 29, 495
  • Dang , C. and Jayasena , S. D. 1996 . J. Mol. Biol. , 264 : 268
  • Yakimovich1 , O. Y. , Alekseev , Y. I. , Maksimenko , A. V. , Voronina , O. L. and Lunin , V. G. 2003 . Biochem. (Moscow) , 68 : 228 Translated from Biokhimiya, 2003, 68, 274
  • Fredriksson , S. , Gullberg , M. , Jarvius , J. , Olsson , C. , Pietras , K. , Gústafsdóttir , S. M. , Östman , A. and Landegren , U. 2002 . Nat. Biotechnol. , 20 : 473
  • Jhaveri , S. , Manjula , R. and Ellington , A. D. 2000 . Nat. Biotechnol. , 18 : 1293
  • Robert , E. M. , Joseph , R. N. and Sullenger , B. A. 2002 . Mol. Ther. , 6 : 30
  • Daniels , D. A. , Sohal , A. K. , Rees , S. and Grisshammer , R. 2002 . Anal. Biochem. , 305 : 214
  • Potyrailo , R. A. , Conrad , R. C. , Ellington , A. D. and Hieftje , G. M. 1998 . Anal. Chem. , 70 : 3419
  • Myoyong , L. , David , R. and Walt1 , A. 2000 . Anal. Biochem. , 282 : 142
  • Gatto‐Menking , D. L. , Yu , H. , Bruno , J. G. , Goode , M. T. , Miller , M. and Zulich , A. W. 1995 . Biosens. Bioelectron. , 10 : 501
  • Bruno , J. G. and Yu , H. 1996 . Appl. Environ. Microbiol. , 62 : 3474
  • Bruno , J. G. and Johnathan , L. K. 1999 . Biosens. Bioelectron. , 14 : 457
  • Yamamoto , R. , Katahira , M. , Nishikawa , S. , Baba , T. , Taira , K. and Kumar , P. K.R. 2000b . Genes to Cells , 5 : 371
  • Yamamoto , R. and Kumar , P. K.R. 2000a . Genes to Cells , 5 : 389
  • Thomas , G. M. , Hamaguchi , N. and Stanton , M. 2003 . Anal. Biochem. , 319 : 244
  • Kotia , R. B. , Li , L. and McGown , L. B. 2000 . Anal. Chem. , 72 : 827
  • Romig , T. S. , Bell , C. and Drolet , D. W.J. 1999 . Chromatogr. B , 731 : 275

Reprints and Corporate Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

To request a reprint or corporate permissions for this article, please click on the relevant link below:

Order Reprints Request Corporate Permissions

Academic Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

Obtain permissions instantly via Rightslink by clicking on the button below:

Request Academic Permissions

If you are unable to obtain permissions via Rightslink, please complete and submit this Permissions form. For more information, please visit our Permissions help page.

Related research

People also read lists articles that other readers of this article have read.

Recommended articles lists articles that we recommend and is powered by our AI driven recommendation engine.

Cited by lists all citing articles based on Crossref citations.
Articles with the Crossref icon will open in a new tab.