Cohorts, overlapping generations and consanguinity estimates

Summary

A number of problems in human population genetics involve determining the effects of non-random mating due to cultural or geographic factors, and therefore requires determination of expectations based on random mating. These expectations are usually taken to be the arithmetic mean of the contributions of all possible pairs drawn from a subpopulation of individuals of mating age during a specified period. This cohort approach in effect treats the subpopulation as a discrete generation. In real populations, however, the pool of potential mates with whom any individual may be paired is continually changing, and not all pairs are eligible, on demographic grounds, to mate for equal lengths of time. A simple means of avoiding problems due to this discrepancy between method and reality is suggested and applied to data from an isolated Caribbean population in order to determine whether treating cohorts as discrete generations introduces serious bias into estimates of expected consanguinity. The results suggest that any such biases are likely to be negligible, but may be important in some special circumstances.

Zusammenfassung

Einige Probleme der Populationsgenetik des Menschen umschliessen die Bestimmung der Wirkungen von nicht zufälliger Partnerwahl durch kulturelle oder geographische Faktoren und bedürfen daher der Bestimmung der Erwartungen bei zufälliger Partnerwahl. Diese Erwartungen werden üblicherweise angenommen als das arithmetische Mittel der Beiträge aller möglicher Paare aus einer Unterbevölkerung von Individuen im Partnerwahlalter während einer bestimmten Zeit. Dieser Kohortenansatz behandelt letztlich die Unterbevölkerung als eine diskrete Generation. In realen Bevölkerungen ändert sich jedoch beständig der Kreis der möglichen Partner, mit dem jedes Individuum gepaart werden kann, und aus demographischen Gründen sind nicht alle Paare für gleiche Zeiträume zur Partnerwahl auswählbar. Eine einfache Maßnahme zur Vermeidung von Problemen aufgrund dieser Diskrepanz zwischen Methode und Realität wird vorgeschlagen und angewandt auf Daten einer isolierten karibischen Bevölkerung, um zu bestimmen, ob die Behandlung von Kohorten als diskrete Generationen einen ernsten Fehler in die Schätzwerte der erwarteten Konsanguinität einführt. Die Ergebnisse legen nahe, daß solche Fehler wahrscheinlich vernachlässligbar sind, aber unter einigen besonderen Umständen wichtig sein können.

Résumé

Nombre de problèmes en génétique des populations humaines impliquent la détermination des effets du choix du conjoint suite à des facteurs culturels ou géographiques, et requièrent dès lors la détermination des valeurs attendues sur la base d'unions au hasard. Ces valeurs attendues sont habituellement considérées comme étant la moyenne arithmétique des contributions de toutes les paires possibles tirées d'une sous-population d'individus d'àge mariable durant une période spécifiée. Cette approche par cohorte a pour effet de traiter la sous-population comme une génération discontinue. Dans les populations réelles, cependant, le réservoir de conjoints potentiels avec qui tout individu peut ètre apparié change continuellement, et toutes les paires ne sont pas qualifiées, sur une base démographique, à s'unir pour des durées de temps égales. Un moyen simple d'éviter les problèmes dûs à ce désaccord entre méthode et réalité est suggéré et appliqué à des données sur une population isolée des Caraïbes en vue de déterminer si le fait de traiter les cohortes comme des générations discontinues introduit un biais sérieux dans les estimations de consanguinité attendue. Les résultats suggèrent que tout biais de ce genre tend à ètre négligeable, mais peut ètre important dans certaines circonstances spéciales.