Genetic studies of PGM1 subtypes: population data from the Asian-Pacific area

Summary

The distribution of PGM1 phenotypes from persons belonging to various ethnic groups in the Asian-Pacific area has been analysed using isoelectric focusing (I.E.F.) in 0·35 mm thick polyacrylamide gels pH5–7. Comparison of the four common allotype frequencies indicates well-marked differences in their distribution.

The PGM 1*1+ allotype frequency varies from 43 to 77% in Western Samoa and Port Moresby, respectively. Melanesians from Papua New Guinea and Fiji, Aborigines from central Australia and Indonesians from the Lesser Sunda islands have higher frequencies of the PGM1*1- allotypes (21–25%), whereas east Asians and Indian populations have approximately half this frequency.

Indian populations are distinctive in having higher frequencies of the PGM1*2+ allotype (22–31%). However, the lowest values (2%) are recorded in Micronesians. The Polynesians, except for Cook Islanders, are characterized by having the highest frequencies (23%) of the PGM1*2- allotype. These values are in contrast to the Papua New Guineans and Australian Aborigines where the PGM1*2- allotype reaches minimum values of approximately 1%.

A new PGM1*7 Delhi allotype which we recently detected in Delhi, north India, has been found with polymorphic frequency in Madras, south India.

The allotype frequencies have been used for genetic distance analysis to demonstrate the genetic affinities between the populations studied.

Zusammenfassung

Die Verteilung der PGM1-Phänotypen bei Personen verschiedener ethnischer Gruppen der asiatischen Region des Pazifik wurde mithilfe der Isoelektrofokussierung in 0,35 mm dickem Polyacrylamid-Gel vom pH 5–7 untersucht. Ein Vergleich der Häufigkeiten der 4 gängigen Allotypen zeigt ausgeprägte Verteilungsunterschiede.

Die Allotypenfrequenz von PGM1*1 + variiert zwischen 43 und 77% in Westsamoa und Port Moresby. Melanesier von Papua-Neu-Guinea und Fiji, Eingeborene aus Zentralaustralien und Indonesier von den kleinen Sundainseln haben höhere Häufigkeiten der Allotypen von PGM1*1 - (21–25%), wohingegen ostasiatische und indische Bevölkerungen etwa die Hälfte dieser Frequenz aufweisen.

Indische Bevölkerungen unterscheiden sich durch eine höhere Frequenz des Allotyps PGM1*2 + (22–31%). Die niedrigsten Werte (2%) werden dagegen bei Mikronesiern berichtet. Die Polynesier mit Ausnahme der Cook-Insulaner sind durch die höchste Frequenz (23%) des Allotyps PGM1*2 - charakterisiert. Diese Werte heben sich von den Papua-Neu-Guineaern und australischen Eingeborenen ab, bei denen der Allotyp PGM1*2 - mit etwa 1% ein Minimum erreicht.

Ein neuer Allotyp PGM1*7 Delhi, den wir vor kurzem in Delhi in Nordindien entdeckt haben, wurde mit polymorpher Häufigkeit in Madras in Südindien gefunden.

Die Allotypenhäufigkeiten wurden für eine genetische Abstandsanalyse benutzt, um die genetischen Ähnlichkeiten zwischen den untersuchten Bevölkerungen darzustellen.

Résumé

La distribution des phénotypes PGM1 chez des personnes appartenant à divers groupes ethniques de l'aire Pacifique Asiatique a été analysée à l'aide de la focalisation isoéléctrique (IEF) en gels de polyacrylamide de 0,35 mm d'épaisseur à pH 5–7. La comparaison des fréquences des 4 allotypes communs indique des différences bien marquées dans leur distribution.

La fréquence de l'allotype PGM1*1 + varie de 43 à 77% en Samoa occidental et Port Moresby respectivement. Les Mélanésiens de Papouasie-Nouvelle Guinée et de Fidji, les Aborigènes d'Australie centrale et les Indonésiens des îles Petites Sunda ont des fréquences plus élevées des allotypes PGM1*1 - (21–25%) tandis que les populations d'Asie orientale et de l'Inde ont approximativement la moitié de cette fréquence.

Les populations indiennes se distinguent par des fréquences plus élevées de l'allotype PGM1*2 + (22–31%). Cependant, les valeurs les plus basses (2%) sont enregistrées chez les Micronésiens. Les Polynésiens, sauf les habitants des îles Cook, sont caractérisés par les fréquences les plus élevées (23%) de l'allotype PGM1*2 -. Ces valeurs contrastent avec celles des habitants de Papouasie-Nouvelle Guinée et des Aborigènes australiens où l'allotype PGM1*2 - atteint des valeurs minimum d'environ 1%.

Un nouvel allotype PGM1*7 Delhi que nous avons récemment détecté à Delhi, en Inde du Nord, a été trouvé à fréquence polymorphique à Madras, en Inde du Sud.

Les fréquences des allotypes ont été employées pour une analyse de distances génétiques en vue de démontrer les affinités génétiques entre les populations étudiées.