References and Footnotes
- Zimmermann , H. W. 1986 . Angewandte Chemie Internat. Ed. , 25 : 115 – 130 .
- Bloomfield , V. , Crothers , D. and Tinoco , I. Jr. 1974 . Physical Chemistry of Nucleic Acids New York : Harper and Row .
- Berman , H. M. and Young , P. R. 1981 . Ann. Rev. Biophys. Bioeng. , 10 : 87 – 114 .
- Wilson , W. D. and Jones , R. L. 1982 . Intercalation Chem. , 1 : 445 – 501 .
- Neidle , S. and Abraham , Z. 1984 . CRC Crit. Rev. Biochem. , 17 : 73 – 121 .
- Tewey , K. M. , Chen , G. L. , Nelson , A. and Liu , E. F. 1984 . J. Biol. Chem. , 259 : 9182 – 9187 .
- Le Pecq , J.-B. and Paoletti , C. 1967 . J. Mol. Biol. , 27 : 87 – 106 .
- Bittman , R. 1969 . J. Mol. Bio. , 46 : 251 – 268 .
- Le Pecq , J.-B. 1971 . Meth. Biochem. Anal. , 20 : 41 – 86 .
- Peacocke , A. R. 1973 . Chem. Heterocyc. Compd. , 9 : 723 – 757 .
- Pauluhn , J. and Zimmermann , H. W. 1978 . Ber. Bunsenges. Phys. Chem. , 82 : 1265 – 1278 .
- Polygen Corporation, Waltham . 1990 . Massachusetts QUANTA , 30
- Singh , U. C. , Weiner , P. K. , Seibel , G. and Kollman , P. A. 1989 . AMBER Vol. 32 , San Francisco : University of California .
- Arnott , S. and Hukins , M. 1972 . Biochem. Biophys. Res. Communications , 47 : 1504 – 1510 .
- Lybrand , T. and Kollman , P. 1985 . Biopolymers , 24 : 1863 – 1875 .
- Sobell , H. M. , Tsai , C. , Jain , S. C. and Gilbert , S. G. 1977 . J. Mol. Biol. , 114 : 333 – 365 .
- Singh , U. C. and Kollman , P. A. 1984 . J. Comp. Chem. , 5 : 129 – 145 .
- Bresloff , J. L. and Crothers , D. M. 1975 . J. Mol. Biol. , 95 : 103 – 123 .
- Packand , G. R. and Loew , G. 1978 . Biochim. Biophys. Acta , 519 : 163 – 172 .
- Ornstein , R. and Rein , R. 1979 . Biopolymers , 18 : 2821 – 2847 .
- Nuss , M. E. , Marsh , F. J. and Kollman , P. A. 1979 . J. Am. Chem. Soc. , 101 : 825 – 833 .
- Miller , K. J. , Macrea , J. and Pycior , J. F. 1980 . Biopolymers , 19 : 2067 – 2089 .
- Miller , K. J. , Brodzinsky , R. and Hall , S. 1980 . Biopolymers , 19 : 2091 – 2122 .
- Rudolph , B. R. and Case , D. A. 1989 . Biopolymers , 28 : 851 – 871 .
- Prabhakaran , M. and Harvey , S. C. 1985 . J. Phys. Chem. , 89 : 5767 – 5769 .
- Saenger , W. 1984 . Principles of Nucleic Acid Structure 116 – 119 . New York : Springer-Verlag .
- Wakelin , L. P.G. and Waring , M. J. 1980 . J. Mol Biol. , 144 : 183 – 214 .
- MacGregor , R. B. Jr. , Clegg , R. M. and Jovin , T. M. 1987 . Biochemistry , 26 : 4008 – 4016 .
- Berman , H. M. , Sussman , J. L. , Joshua-Tor , L. , Revich , G. G. and Ripley , L. S. 1992 . J. Biomolec. Struct. Dynamics , 10 : 317 – 331 .