References and Footnotes
- Felsenfeld , G. , Davies , D. R. and Rich , A. 1957 . J. Am. Chem. Soc. , 79 : 2023
- Lyamichev , V. I. , Mirkin , S. M. and Frank-Kamenetskii , M. D. 1986 . Biomol. Struct. Dyn. , 3 : 667 – 669 .
- Larsen , A. and Weintraub , H. 1982 . Cell , 29 : 609 – 622 .
- Mirkin , S. M. , Lyamichev , V. I. , Drushlyak , K. N. , Dobrynin , V. N. , Filippov , S. A. and Frank-Kamenetskii , M. D. 1987 . Nature , 330 : 495 – 497 .
- Htun , H. and Dahlberg , J. E. 1988 . Science , 241 : 1791 – 1796 .
- Wells , R. D. , Collier , D. A. , Hanvey , J. C. , Shimizu , M. and Wohlrab , F. 1988 . FASEB J. , 2 : 2939 – 2949 .
- Hampel , K. J. , Crosson , P. and Lee , J. S. 1991 . Biochemistry , 30 : 4455 – 4459 .
- Moser , H. E. and Dervan , P. B. 1987 . Science , 238 : 645 – 650 .
- Francois , J. C. , Behmoaras , T. S. and Helene , C. 1988 . Nucleic Acids Res , 16 : 11431 – 11440 .
- Cooney , M. , Czemuszewicz , G. , Postel , E. H. , Hint , S. J. and Hogan , M. E. 1988 . Science , 241 : 456 – 459 .
- Praseuth , D. , Perrouait , L. , Le Doan , T. , Chassignol , M. , Thoung , N. and Helene , C. 1988 . Proc. Nat. Acad. Sci. USA , 85 : 1349 – 1353 .
- Strobel , S. A. and Dervan , P. B. 1990 . Science , 249 : 72 – 75 .
- Griffin , L. C. and Dervan , P. B. 1989 . Science , 215 : 967 – 971 .
- Plum , G. E. , Park , Y. W. , Singleton , S. F. and Dervan , P. B. 1990 . Proc. Natl. Acad. Sci. , 87 : 9436 – 9440 .
- Yoon , K. , Hobbs , C. A. , Koch , J. , Sardaro , M. , Kunty , R. and Weis , A. L. 1992 . Proc. Natl. Acad. Sci , 89 : 3840 – 3844 .
- Manzini , G. , Xodo , L. E. , Gasparotto , D. , Quadrifoglio , F. , van der Marrel , G. A. and van Boom , J. H . 1990 . J. Mol. Biol. , 213 : 833 – 843 .
- Xodo , L. E. , Manzini , G. and Quadrifoglio , F. 1987 . Nucleic Acids Res. , 18 : 3557 – 3564 .
- Arnott , S. and Bond , P. J. 1973 . Nature N.B. , 244 : 99 – 101 .
- Arnott , S. and Selsing , E. 1974 . J. Mol. Biol. , 88 : 509 – 521 .
- Arnott , S. , Bond , P. J. , Selsing , E. and Smith , P. J. 1976 . C., Nucl. Acids. Res. , 11 : 4141 – 4155 .
- McShan , W. M. , Rossen , R. D. , Laughter , A. H. , Trial , J. , Kessler , D. J. , Zendegui , J. G. , Hogan , M. E. and Orson , F. M. 1992 . J. Biol. Chem. , 267 : 5712 – 5721 .
- Macaya , R. F. , Schnitze , P. and Feigon , J. 1992 . J. Am. Chem. Soc. , 114 : 781 – 783 .
- Macaya , R. , Wang , E. , Schultze , P. , Sklenar , V. and Feigon , J. 1992 . J. Mol. Biol. , 225 : 755 – 773 .
- Rajagopal , P. and Feigon , J. 1989 . Nature , 339 : 637 – 640 .
- Rajagopal , P. and Feigon , J. 1989 . Biochemistry , 28 : 7859 – 7890 .
- Akhebat , A. , Dagneaux , C. , Liquier , J. and Taillandier , E. 1992 . J Biomol. Struct. Dyn. , 10 : 577 – 588 .
- Howard , F. B. , Miles , H. D. , Liu , K. , Frazier , J. , Raghunathan , G. and Sasisekharan , V. 1992 . Biochemistry , 31 : 10671 – 10677 .
- Laughton , C. A. and Neidle , S. 1992 . J. Mol. Biol. , 223 : 519 – 529 .
- Hausheer , F. H. , Singh , U. C. , Saxe , J. D. , Colvin , O. M. and Tso , P. O.P. 1990 . Anti Cancer Drug Des. , 5 : 159 – 167 .
- Cheng , N. and Pettitt , M. 1992 . J. Amer. Chem. Soc. , 114 : 4465 – 4474 .
- Westhof , E. , Dumas , P. and Moras , D. 1985 . J. Mol. Biol. , 184 : 119 – 145 .
- Jones , T. A. 1985 . Interactive Computer Graphics FRODO in . Methods in Enzymology , 115 : 157 – 171 .
- Brunger , A. 1992 . X-PLOR 3.0 Manual Yale University .
- Pearlman , D. A. , Case , D. A. , Caldwell , J. C. , Seibel , G. L. , Singh , U. C. , Weiner , P. and Kollman , P. A. 1991 . AMBER 4.0 San Fransisco : University of California .
- Ravishanker , G. , Swarainathan , S. , Beveridge , D. L. , Lavery , R. and Sklenar , H. 1989 . J. Biomol. Struc. Dyn. , 6 : 669 – 699 .
- Dickerson , D. E. 1989 . EMBO J. , 8 : 1 – 4 .
- 1992 . SYBYL, Tripos Associates, Inc, St Louis, Missouri, USA
- Arnott , S. and Hukins , D. W.L. 1972 . Biochem. Biophys. Res. Com. , 48 : 1392 – 1398 .
- Arnott , S. and Hukins , D. W.L. 1973 . Biochem. Biophys. Res. Com , 47 : 1504 – 1509 .
- Sundaralingam , M. 1969 . Biopolymers , 7 : 821 – 860 .
- Sundaralingam , M. and Sekharudu , C. 1988 . in DNA bending and Curvature Edited by: Olson , W. K. , Sarma , M. H. , Sarma , R. H. and Sundaralingam , M. 9 – 23 . Adenine Press .
- Sundaralingam , M. 1973 . “Conformation of Biological Molecules and Polymers: The Jerusalem Symposia on Quantum Chemistry and Biochemistry Jerusalem V
- Calladine , C. R. 1982 . J. Mol. Biol. , 161 : 343 – 352 .
- Krawczyk , S. H. , Milligan , J. F. , Wadwani , S. , Moulds , C. , Froehler , B. and Mattencci , M. D. 1992 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 89 : 3761 – 3764 .
- Posvic , T. J. and Dervan , P. B. 1989 . J. Am. Chem. Soc. , 111 : 3059 – 3061 .
- Lee , B. and Richards , F. M. 1971 . J. Mol. Biol , 55 : 379 – 400 .
- Sekharudu , C. and Sundaralingam , M. Proceedings of the VIII Conversation in Biomolecular Stereodynamics Abstract No. a177
- Park , Y. W. and Breslauer , K. J. 1992 . Proc. Noll Acad. Sci. USA. , 89 : 6653 – 6657 .
- DeLos Santos , C. , Rosen , M. and Patel , D. 1989 . Biochemistry , 28 : 7282 – 7289 .
- Kan , L. S. , Callahan , D. E. , Trapane , T. L. , Miller , P. S. , Tso , P. O.P. and Huang , D. H. 1991 . J. Biomol Struct Dyn. , 8 : 911 – 933 .
- Umemoto , K. , Sarma , M. H. , Gupta , G. , Luo , J. and Sarma , R. H. 1990 . J. Am. Chem. Soc. , 112 : 4539 – 4545 .
- Mooren , M. M.W. , Pulleyblank , D. E. , Wijmenga , S. S. , Blommers , M. J.J. and Hilbers , C. W. 1990 . Nucleic Acids Res. , 18 : 6523 – 6529 .
- Pilch , D. S. , Brousseall , R. and Shafer , R. H. 1990 . Nucleic Acids Res , 18 : 5743 – 5750 .
- Pilch , D. S. , Levenson , C. and Shafer , R. H. 1990 . Proc. Natl Acad. Sci. USA , 87 : 1942 – 1946 .
- Radhakrishnan , I. and Patel , D. J. 1992 . Biochemistry , 31 : 2514 – 2523 .
- Liquier , J. , Coffiner , P. , Firon , M. and Taillandier , E. 1991 . J Biomol. Struct. Dyn. , 9 : 437 – 445 .
- Ohms , J. and Ackerman , T. 1990 . Biochemistry , 29 : 5237 – 5244 .
- Ouali , M. , Letellier , R. , Adnet , F. , Liquier , J. , Sun , J.-S. , Lavery , R. and Taillander , E. 1993 . Biochemistry , 32 : 2098 – 2103 .