References and Footnotes
- Goff , S. P. 1992 . Annu. Rev. Genet. , 26 : 527 – 544 .
- Thomas , M. and Brady , L. 1997 . Tibtech. , 15 : 167 – 172 .
- Andrake , M. D. and Skalka , A. M. 1996 . J. Biol. Chem. , 271 : 19633 – 19636 .
- Engelman , A. and Craige , R. 1992 . J. Virol , 66 : 6361 – 6369 .
- Kulkolsky , J. , Jones , K. S. , Katz , R. A. , Mack , J. P.G. and Skalka , A. M. 1992 . Mol. Cell. Biol. , 12 : 23312338
- van Gent , D. C. , Oude Groeneger , A. A.M. and Plasterk , R. H.A. 1994 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 91 : 6654 – 6658 .
- Dyda , F. , Hickman , A. B. , Jenkins , T. M. , Engelman , A. , Craigie , R. and Davies , D. R. 1994 . Science , 266 : 1981 – 1986 .
- Bujacz , G. , Alexandratos , J. , Zhou-liu , Q. , Clement-Mella , C. and Wlodawer , A. 1996 . FEBS Lett. , 398 : 175 – 178 .
- Lins , R. , Briggs , J. M. , Straatsma , T. P. , Carlson , H. A. , Greenwald , J. , Choe , S. and McCammon , J. A. submitted for publication
- Bujacz , G. , Jaskolski , M. , Alexandratos , J. , Wlodawer , A. , Merkel , G. , Katz , R. A. and Skalka , A. M. 1995 . J. Mol. Biol. , 253 : 333 – 346 .
- Goldgur , Y. , Dyda , F. , Hickman , A. B. , Jenkins , T. M. , Craigie , R. and Davies , D. R. 1998 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 95 : 9150 – 9154 .
- Beese , L. S. and Steitz , T. A. 1991 . EMBO J. , 10 : 25 – 33 .
- Harte , W. E. Jr. , Swaminathan , S. and Beveridge , D. L. 1992 . Proteins Struct. Fund. Genet. , 13175194
- Berendsen , H. J.C. , Grigera , J. R. and Straatsma , T. P. 1987 . J. Comp. Chem. , 91 : 6269 – 6271 .
- Essman , U. , Perera , L. , Berkowitz , M. L. , Darden , T. , Lee , H. and Pedersen , L. G. 1995 . J. Chem. Phys. , 103 : 8577 – 8593 .
- Berendsen , H. J. C. , Postma , J. P. M. , van Gunsteren , W. F. , DiNola , A. and Haak , J. R. 1984 . J. Chem. Phys. , 81 : 3684 – 3690 .
- Ryckaert , J. P. , Ciccotti , G. and Berendsen , H. J. C. 1977 . J. Comp. Phys. 23 327 – 341 .
- Cornell , W. D. , Cieplak , P. , Bayly , C. I. , Gould , I. R. , Merz , K. M. , Ferguson , D. M. , Spellmeyer , D. C. , Fox , T. , Caldwell , J. W. and Kollman , P. 1995 . J. Am. Chem. Soc. , 117 : 5179 – 5197 .
- 1998 . NWChem, A Computational Chemistry Package for Parallel Computers, Version 3.2. High Performance Computational Chemistry Group, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, WA 99352, USA
- Amadei , A. , Linssen , A. B.M. and Berendsen , H. J.C. 1993 . Proteins Struct. Fund. Genet. , 17 : 412425
- Vriend , G. 1990 . J Moi Graph. , 8 : 52 – 56 .
- McCammon , J. A. and Harvey , S. C. 1987 . Dynamics of proteins and nucleic acids. Cambridge University Press Cambridge
- Madura , J. D. , Briggs , J. M. , Wade , R. C. and Gabdoulline , R. R. 1998 . Encyclopaedia of Computational Chemistry John Wiley .
- Ermak , D. L. and McCammon , J. A. 1978 . J. Chem. Phys. , 69 : 1352 – 1360 .
- Levitt , M. 1976 . J. Mol. Biol. , 104 : 59 – 107 .
- McCammon , J. A. , Northrup , S. H. , Karplus , M. and Levy , R. M. 1980 . Biopolymers. , 19 : 2033 – 2045 .
- Wade , R. C. , Davis , M. E. , Luty , B. A. , Madura , J. D. and McCammon , J. A. 1993 . Biophys. J. , 64 : 9 – 15 .
- Jorgensen , W. L. and Tirado-Rives , J. 1988 . J. Am. Chem. Soc. , 110 : 1657 – 1666 .
- Madura , J. D. , Briggs , J. M. , Wade , R. C. , Davis , M. E. , Luty , B. A. , Ilin , A. , Antosiewicz , J. , Gilson , M. K. , Bagheri , B. , Scott , L. R. and McCammon , J. A. 1995 . Comp. Phys. Commun. , 91 : 57 – 95 .
- Beese , L. S. , Derbyshire , V. and Steitz , T. A. 1993 . Science. , 260 : 352 – 355 .
- Williams , J. C. and McDermott , A. E. 1995 . Biochemistry , 34 : 8309 – 8319 .
- Derreumaux , P. and Schlick , T. 1998 . Biophys. J. , 74 : 72 – 81 .