References and Footnotes
- Adams , M. W.W. and Kelly , R. M. 1995 . Chem Eng. News , 73 : 32 – 42 .
- Querol , E. , Perez-Pons , J. A. and Mozo-Villarias , A. 1996 . Protein Eng. , 9 : 256 – 271 .
- Haney , P. , Konisky , J. , Koretke , K. K. , Luthey-Schulten , Z. and Wolynes , P. G. 1997 . Proteins: Struct. Funct. Genet. , 28 : 117 – 130 .
- Russell , R. J.M. , Ferguson , J. M.C. , Haugh , D. W. , Danson , M. J. and Taylor , G. L. 1997 . Biochemistry , 36 : 9983 – 9994 .
- Salminen , T. , Teplyakov , A. , Kankare , J. , Cooperman , B. S. , Lahti , R. and Goldman , A. 1996 . Protein Science , 5 : 1014 – 1025 .
- Zuber , H. 1988 . Biophys. Chem. , 29 : 171 – 179 .
- Bogin , O. , Peretz , M. , Hacham , Y. , Korkhin , Y. , Frolow , F. , Kalb (Gilboa) , A. J. and Burstein , Y. 1998 . Protein Science , 7 : 1156 – 1163 .
- Watanabe , K. , Hata , Y. , Kizaki , H. , Katsube , Y. and Suzuki , Y. 1997 . J. Mol. Biol. , 269 : 142 – 153 .
- Vogt , G. and Argos , P. 1997 . Fold and Des. , 2 : S40 – S46 .
- Vogt , G. , Woell , S. and Argos , P. 1997 . J. Mol. Biol. , 269 : 631 – 643 .
- Day , M. W. , Hsu , B. T. , Joshua-Tor , L. , Park , J. B. , Zhou , Z. H. , Adams , M. W.W. and Rees , D. C. 1992 . Protein Science , 7 : 1494 – 1507 .
- Yip , K. S.P. , Stillman , T. J. , Britton , K. L. , Artymiuk , P. J. , Baker , P. J. , Sedelnikova , S. E. , Engel , P. C. , Pasquo , A. , Chiaraluce , R. , Consalvi , V. , Scandurra , R. and Rice , D. W. 1995 . Structure , 3 : 1147 – 1158 .
- Yip , K. S.P. , Britton , K. L. , Stillman , T. J. , Lebbink , J. , Vos , W. M.D. , Robb , F. T. , Vetriani , C. , Maeder , D. and Rice , D. W. 1998 . Eur. J. Biochem. , 255 : 336 – 346 .
- Bult , C. J. , White , O. , Olsen , G. J. Venter , J. C. 1996 . Science , 273 : 1058 – 1073 .
- Kawarabayasi , Y. , Sawada , M. , Horikawa , H. Kikuchi , H. 1998 . DNA Res. , 5 : 55 – 76 .
- Klenk , H. P. , White , O. , Tomb , J. F. Venter , J. C. 1997 . Nature , 390 : 364 – 370 .
- Kumar , S. , Tsai , C. J. and Nussinov , R. 1999 . Submitted
- Horovitz , A. and Fersht , A. R. 1992 . J. Mol. Biol. , 224 : 733 – 740 .
- Marqusee , S. and Sauer , R. T. 1994 . Protein Sci. , 3 : 2217 – 2225 .
- Pervushin , K. , Billeter , M. , Siegal , G. and Wuthrich , K. 1996 . J. Mol. Biol. , 264 : 1002 – 1012 .
- Lounnas , V. and Wade , R. C. 1997 . Biochemistry , 36 : 5402 – 5417 .
- Xu , D. , Lin , S. L. and Nussinov , R. 1997 . J. Mol. Biol. , 265 : 68 – 84 .
- Singh , U. C. 1988 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 85 : 4280 – 4284 .
- Serrano , L. , Horovitz , A. , Avron , B. , Bycroft , M. and Fersht , A. R. 1990 . Biochemistry , 29 : 9343 – 9352 .
- Barril , X. , Aleman , C. , Orozco , M. and Luque , F. J. 1998 . Proteins: Struct. Funct. Genet. , 32 : 67 – 79 .
- Sun , D. P. , Sauer , U. , Nicholson , H. and Matthews , B. W. 1991 . Biochemistry , 30 : 7142 – 7153 .
- Dao-pin , S. , Anderson , D. E. , Baase , W. A. , Dahlquist , F. W. and Matthews , B. W. 1991 . Biochemistry , 30 : 11521 – 11529 .
- Hendsch , Z. S. and Tidor , B. 1994 . Protein Sci. , 3 : 211 – 226 .
- Waldburger , C. D. , Schildbach , J. F. and Sauer , R. T. 1995 . Nature Struct. Biol. , 2 : 122 – 128 .
- Honig , B. H. and Hubell , W. L. 1984 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 81 : 5412 – 5416 .
- Elcock , A. H. 1998 . J. Mol. Biol. , 284 : 489 – 502 .
- Robb , F. T. , Park , J. B. and Adams , M. W.W. 1992 . Biochim. Biophys. Acta , 1120 : 267 – 272 .
- Klump , H. , DiRuggiero , J. , Kessel , M. , Park , J. B. , Adams , M. W.W. and Robb , F. T. 1992 . J. Biol. Chem. , 267 : 22681 – 22685 .
- Baker , P. J. , Britton , L. K. , Engel , P. C. , Farrants , G. W. , Lilley , K. S. , Rice , D. W. and Stillman , T. J. 1992 . Proteins: Struct. Funct. Genet. , 12 : 75 – 86 .
- Stillman , T. J. , Baker , P. J. , Britton , L. K. and Rice , D. W. 1993 . J. Mol. Biol. , 234 : 1131 – 1139 .
- Bernstein , F. , Koetzle , T. , Williams , G. , Meyer , E. J. , Brice , M. , Rodgers , J. , Kennard , O. , Shimanuchi , T. and Tasumi , M. 1977 . J. Mol. Biol. , 112 : 535 – 542 .
- Tsai , C. J. , Lin , S. L. , Wolfson , H. and Nussinov , R. 1996 . J. Mol. Biol. , 260 : 604 – 620 .
- Tsai , C. J. and Nussinov , R. 1997a . Protein Sci. , 6 : 24 – 42 .
- Tsai , C. J. and Nussinov , R. 1997b . Protein Sci. , 6 : 1426 – 1437 .
- Tsai , C. J. , Xu , D. and Nussinov , R. 1997 . Protein Sci. , 6 : 1 – 13 .
- Lee , B. K. and Richards , F. M. 1971 . J. Mol. Biol. , 55 : 379 – 400 .
- Gilson , M. K. , Rashin , A. , Fine , R. and Honig , B. 1985 . J. Mol. Biol. , 183 : 503 – 516 .
- Gilson , M. K. , Sharp , K. A. and Honig , B. H. 1988 . J. Comp. Chem. , 9 : 327 – 335 .
- Gilson , M. K. and Honig , B. H. 1988 . Proteins: Struct. Funct. Genet. , 4 : 7 – 18 .
- Sharp , K. A. and Honig , B. 1990 . Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. , 19 : 301 – 332 .
- Honig , B. , Sharp , K. and Yang , A. 1993 . J. Phys. Chem. , 97 : 1101 – 1109 .
- Sitkoff , D. , Sharp , K. A. and Honig , B. 1994 . J. Phys. Chem. , 98 : 1978 – 1988 .
- Radzicka , A. and Wolfenden , R. 1988 . Biochemistry , 27 : 1664 – 1670 .
- Gilson , M. K. and Honig , B. H. 1987 . Nature , 330 : 84 – 86 .
- Klapper , I. , Hagstrom , R. , Fine , R. , Sharp , K. and Honig , B. 1986 . Proteins: Struct. Funct. Genet. , 1 : 47 – 59 .
- Lide , D. R. , ed. 1999 . CRC Handbook of chemistry and physics . 79th edition. 1998 -
- Elcock , A. H. and McCammon , J. A. 1997 . J. Phys. Chem. B , 101 : 9624 – 9634 .