References and Footnotes
- Wilson , C. and Szostak , J. W. 1998 . Chemistry & Biology , 5 : 609 – 617 .
- Travascio , P. , Li , Y. and Sen , D. 1998 . Chemistry & Biology , 5 : 505 – 517 .
- Carmi , N. , Balkhi , S. R. and Breaker , R. R. 1998 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 95 : 2233 – 2237 .
- Santoro , S. W. and Joyce , G. F. 1997 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 94 : 4262 – 4266 .
- Robertson , D. L. and Joyce , G. F. 1990 . Nature , 344 : 467 – 468 .
- Schneider , D. J. , Feigon , J. , Hostomsky , Z. and Gold , L. 1995 . Biochemistry , 34 : 9599 – 9610 .
- Gold , L. , Polisky , B. , Uhlenbeck , O. and Yarus , M. 1995 . Annu. Rev. Biochem. , 64 : 763 – 797 .
- Tuerk , C. , MacDougal , S. and Gold , L. 1992 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 89 : 6988 – 6992 .
- Yang , Q. , Goldstein , I. J. , Mei , H.-Y. and Engelke , D. R. 1998 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 95 : 5462 – 5467 .
- Wang , K. Y. , McCurdy , S. , Shea , R. G. , Swaminathan , S. and Bolton , P. H. 1993 . Biochemistry , 32 : 1899 – 1904 .
- Patel , D. J. 1997 . Current Opinion in Chem. Biol. , 1 : 32 – 46 .
- Patel , D. J. , Suri , A. K. , Jiang , F. , Jiang , L. , Fan , P. , Kumar , R. A. and Nonin , S. 1997 . J. Mol. Biol. , 272 : 645 – 664 .
- Kelly , J. A. , Feigon , J. and Yeates , T. O. 1996 . J. Mol. Biol. , 256 : 417 – 422 .
- Zimmermann , G. R. , Jenison , R. D. , Wick , C. L. , Simorre , J.-P. and Pardi , A. 1997 . Nature Struct. Biology , 4 : 644 – 649 .
- Wang , E. and Feigon , J. 1999 . Oxford Handbook of Nucleic Acid Structure Edited by: Neidle , S. 355 – 388 . Surrey. : Oxford University Press . in
- Radhakrishnan , I. , Gao , X. , de losSantos , C. , Live , D. and Patel , D. J. 1991 . Biochemistry , 30 : 9022 – 9030 .
- Radhakrishnan , I. and Patel , D. J. 1993 . J. Am. Chem. Soc. , 115 : 1615 – 1617 .
- Patel , D. J. , Bouaziz , S. , Kettani , A. and Wang , Y. 1999 . Oxford Handbook of Nucleic Acid Structure Edited by: Neidle , S. 390 – 453 . Surrey. : Oxford University Press . in
- Smith , F. W. and Feigon , J. 1992 . Nature , 356 : 164 – 168 .
- Chou , S.-H. , Zhu , L. and Reid , R. R. 1996 . J. Mol. Biol. , 259 : 445 – 457 .
- Chou , S.-H. , Zhu , L. , Gao , Z. , Cheng , J.-W. and Reid , B. R. 1996 . J. Mol. Biol. , 264 : 981 – 1001 .
- Chou , S.-H. , Zhu , L. and Reid , B. R. 1997 . J. Mol. Biol. , 267 : 1055 – 1067 .
- Chou , S.-H. and Tseng , Y.-Y. 1999 . J. Mol. Biol. , 285 : 41 – 48 .
- Chou , S.-H. , Tseng , Y.-Y. and Wang , S.-W. 1999 . J. Mol. Biol. , 287 : 301 – 313 .
- Chou , S.-H. , Tseng , Y.-Y. , Chen , Y.-R. and Cheng , J.-W. 1999 . J. Biomol. NMR , 14 : 157 – 167 .
- Chou , S.-H. and Reid , B. R. 1999 . Oxford Handbook of Nucleic Acid Structure Edited by: Neidle , S. 331 – 354 . Surrey , , UK : Oxford University Press . in
- Cheng , J.-W. , Chou , S.-H. and Reid , B. R. 1992 . J. Mol. Biol. , 228 : 1037 – 1041 .
- Li , Y. , Zon , G. and Wilson , W. D. 1991 . Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A. , 88 : 26 – 30 .
- Heus , H. A. and Pardi , A. 1991 . Science , 253 : 191 – 194 .
- Chou , S.-H. , Cheng , J.-W. and Reid , B. 1992 . J. Mol. Biol. , 228 : 138 – 155 .
- Ebel , S. , Lane , A. N. and Brown , T. 1992 . Biochemistry , 31 : 12083 – 12086 .
- Lane , A. , Martin , S. R. , Ebel , S. and Brown , T. 1992 . Biochemistry , 31 : 12087 – 12095 .
- SantaLucia , J. J. and Turner , D. 1993 . Biochemistry , 32 : 12612 – 12623 .
- Maskos , K. , Gunn , B. M. , LeBlanc , D. A. and Morden , K. M. 1993 . Biochemistry , 32 : 3583 – 3595 .
- Chou , S.-H. , Zhu , L. and Reid , B. R. 1994 . J. Mol. Biol. , 244 : 259 – 268 .
- Chou , S.-H. , Cheng , J.-W. , Fedoroff , O. and Reid , B. R. 1994 . J. Mol. Biol. , 241 : 467 – 479 .
- Katahira , M. , Kanagawa , M. , Sato , H. , Uesugi , S. , Fujii , S. , Kohno , T. and Maeda , T. 1994 . Nucleic Acids Res. , 22 : 2752 – 2759 .
- Lane , A. , Ebel , S. and Brwon , T. 1994 . Europ. J. Biochem. , 220 : 717 – 727 .
- Green , K. L. , Jones , R. L. , Li , Y. , Robinson , H. , Wang , A. H. , Zon , G. and Wilson , W. D. 1994 . Biochemistry , 33 : 1053 – 1062 .
- Walter , A. E. , Wu , M. and Turner , D. H. 1994 . Biochemistry , 33 : 11349 – 11354 .
- Li , Y. and Agrawal , S. 1995 . Biochemistry , 34 : 10056 – 10062 .
- Pley , H. W. , Flaherty , K. M. and McKay , D. B. 1994 . Nature , 372 : 68 – 74 .
- Scott , W. G. , Finch , J. T. and Klug , A. 1995 . Cell , 81 : 991 – 1002 .
- Cate , J. H. , Gooding , A. R. , Podell , E. , Zhou , K. , Golden , B. L. , Kundrot , C. E. , Cech , T. R. and Doudna , J. A. 1996 . Science , 273 : 1678 – 1685 .
- Correll , C. C. , Freeborn , B. , Moore , P. B. and Steitz , T. A. 1997 . Cell , 91 : 705 – 712 .
- Wilson , W. D. , Dotrong , M. H. , Zuo , E. T. and Zon , G. 1988 . Nucleic Acids Res. , 16 : 5137 – 5151 .
- Chou , S.-H. , Cheng , J.-W. , Fedoroff , O. Y. , Chuprina , V. P. and Reid , B. R. 1992 . J. Amer. Chem. Soc. , 114 : 3114 – 3115 .
- Li , Y. , Zon , G. and Wilson , W. D. 1991 . Biochemistry , 30 : 7566 – 7572 .
- Katahira , M. S.H. , Mishima , K. , Uesugi , S. and Fujii , S. 1993 . Nucleic Acids Res. , 21 : 5418 – 5424 .
- SantaLucia , J. J. , Kierzek , R. and Turner , D. H. 1990 . Biochemistry , 29 : 8813 – 8819 .
- Santoro , S. W. and Joyce , G. F. 1998 . Biochemistry , 37 : 13330 – 13342 .
- Mauffret , O. , Amir-Aslani , A. , Maroun , R. G. , Monnot , M. , Lescot , E. and Fermandjian , S. 1998 . J. Mol. Biol. , 283 : 643 – 655 .
- Amir-Aslani , A. , Mauffret , O. , Sourgen , F. , Neplaz , S. , Maroun , R. G. , Lescot , E. , Tevanian , G. and Fermandjian , S. 1996 . J. Mol. Biol. , 263 : 776 – 788 .
- Hunter , W. N. , Brown , T. , Anand , N. N. and Kennard , O. 1986 . Nature , 320 : 552 – 555 .
- Gao , X. and Patel , D. J. 1987 . J. Biol. Chem. , 262 : 16973 – 16984 .
- Brown , T. , leonard , G. A. , Booth , E. D. and Kneale , G. 1990 . J. Mol. Biol. , 212 : 437 – 440 .
- Boulard , Y. , Cognet , J. A. H. , Gabarro-Arpa , J. , LeBret , M. , Carbonnaux , C. and Fazakerley , G. V. 1995 . J. Mol. Biol. , 246 : 194 – 208 .
- Cai , Z. and Tinoco , I. J. 1996 . Biochemistry , 35 : 6026 – 6036 .
- Legault , P. and Pardi , A. 1997 . J. Am. Chem. Soc. , 119 : 6621 – 6628 .
- Allawi , H. T. and SantaLucia , J. J. 1998 . Biochemistry , 37 : 9435 – 9444 .
- Jang , S. B. , Hung , L.-W. , Chi , Y.-I. , Holbrook , E. L. , Carter , R. J. and Holbrok , S. R. 1998 . Biochemistry , 37 : 11726 – 11731 .
- Cate , J. H. , Gooding , A. R. , Podell , E. , Zhou , K. , Golden , B. L. , Szewczak , A. A. , Kundrot , C. E. , Cech , T. R. and Doudna , J. A. 1996 . Science , 273 : 1696 – 1699 .
- Costa , M. and Michel , F. 1997 . EMBO, J. , 16 : 3289 – 3302 .
- Plateau , P. and Gueron , M. 1982 . J. Amer. Chem. Soc. , 104 : 7310 – 7311 .
- Gueron , M. , Plateau , P. and Decorps , M. 1991 . Progress in NMR Spectroscopy , 23 : 135 – 209 .
- Chou , S.-H. , Flynn , P. and Reid , B. R. 1989 . Biochemistry , 28 : 2422 – 2435 .
- Chou , S.-H. , Flynn , P. and Reid , B. 1989 . Biochemistry , 28 : 2422 – 2435 .
- Chou , S.-H. , Flynn , P. , Wang , A. and Reid , B. 1991 . Biochemistry , 30 : 5248 – 5257 .
- Calladine , C. R. and Drew , H. R. 1984 . J. Mol. Biol. , 178 : 773 – 782 .
- Sklenar , V. , Miyashiro , H. , Zon , G. , Miles , H. T. and Bax , A. 1986 . FEBS Letters , 208 : 94 – 98 .
- Zhu , L. , Chou , S.-H. and Reid , B. R. 1996 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 93 : 12159 – 12164 .
- Zhu , L. , Chou , S.-H. and Reid , R. B. 1995 . J. Mol. Biol. , 254 : 623 – 637 .
- Gorenstein , D. G. , Schroeder , S. A. , Fu , J. M. , Metz , J. T. , Roongta , V. and Jones , C. R. 1988 . Biochemistry , 27 : 7223 – 7237 .
- Giessner-Prettre , C. , Pullman , B. , Ribas-Prado , F. , Cheng , D. M. , Iuorno , V. and Ts'o , P. O. P. 1984 . Biopolymer , 23 : 377 – 387 .
- Sarma , R. H. , Mynott , R. J. , Wood , D. J. and Hruska , F. E. 1973 . J. Am. Chem. Soc. , 95 : 6457 – 6459 .
- Zhu , L. , Chou , S.-H. and Reid , B. R. 1995 . Nature Structural Biology , 2 : 1012 – 1017 .
- Egli , M. and Gessner , R. V. 1995 . Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , 92 : 180 – 184 .
- Nishinaka , T. , Ito , Y. , Yokoyama , S. and Shibata , T. 1997 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 94 : 6623 – 6628 .
- Nishio , M. , Umezawa , Y. , Hirota , M. and Takeuchi , Y. 1995 . Tetrahderon , 51 : 8665 – 8701 .
- James , K. D. and Ellington , A. D. 1997 . Chemistry & Biology , 4 : 595 – 605 .
- Lin , C.-H. , Wang , W. , Jones , R. A. and Patel , D. J. 1998 . Chemistry & Biology , 5 : 555 – 572 .
- Hare , D. R. , Wemmer , D. E. , Chou , S.-H. , Drobny , G. and Reid , B. R. 1983 . J. Mol. Biol. , 171 : 319 – 336 .