Human Aldehyde Dehydrogenase Catalytic Activity and Structural Interactions with Coenzyme Analogs

References and Footnotes

• Yoshida , A. , Rzhetsky , A. , Hsu , L. C. and Chang , C. 1998 . Eur. J. Biochem. , 251 : 549 – 557 .
   PubMedGoogle Scholar
• Vallari , R. C. and Pietruszko , R. 1981 . Arch Biochem Biophys. , 212 : 9 – 19 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Sidhu , R. S. and Blair , A. H. 1975 . J. Biol. Chem. , 250 : 7894 – 7904 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Johansson , K. , El-Ahmad , M. , Ramaswamy , S. , Hjelmqvist , L. , Jornvall , H. and Eklund , H. 1998 . Protein Sci. , 7 : 2106 – 17 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Liu , Z. J. , Sun , Y. J. , Rose , J. , Chung , Y. J. , Hsiao , C. D. , Chang , W. R. , Kuo , I. , Perozich , J. , Lindahl , R. and Hempel , W. B.C.J. 1997 . Nat Struct Biol. , 4 : 317 – 26 .
   PubMedGoogle Scholar
• Moore , S. A. , Baker , H. M. , Blythe , T. J. , Kitson , K. E. and Kitson , T. M. 1998 . B.E.N. Structure. , 6 : 1541 – 51 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Steinmetz , C. G. , Xie , P. , Weiner , H. and Hurley , T. D. 1997 . Structure. , 5 : 701 – 11 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Rossman , M. G. , Lilias , A. , Branden , C.-I. and Banaszek , L. J. 1970 . Evolutionary and structural relationships among dehydrogenases Edited by: Boyer , P. D. 63 – 102 . 11
   Google Scholar
• Rossman , M. G. , Moras , D. and Olsen , K. W. 1974 . Nature , 250 : 194 – 199 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Anderson , B. M. and Kaplan , N. O. 1987 . Model studies and biological activity of analogs Edited by: Dolphin , D. , Poulson , R. and Abramovic , O. New York : John Wiley and Sons Inc. . pp 569611
   Google Scholar
• Becker , O. M. , MacKerell , J. , Roux , A. D.B. and Watanabe , M. 2001 . Computational Biochemistry and Biophysics Marcel-Dekker, Inc.: New York, pp 512
   Google Scholar
• Caves , L. S. , Evanseck , J. D. and Karplus , M. 1998 . Protein Sci. , 7 : 649 – 666 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Yin , D. , Yang , X. , Hu , Y. , Kuczera , K. , Schowen , R. L. , Borchardt , R. T. and Squier , T. C. 2000 . Biochemistry , 39 : 9811 – 9818 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• MacKerell , A. D. Jr. , Sommer , M. S. and Karplus , M. 1995 . J. Mol. Biol , 247 : 774 – 807 .
   PubMedGoogle Scholar
• Hehre , W. J. , Radom , L. , Schleyer , P. v.R. and Pople , J. A. 1986 . Ab Initio Molecular Orbital Theory New York : John Wiley & Sons .
   Google Scholar
• Pavandumar , P. N. V. , Seetharamulu , P. , Yao , S. , Saxe , J. D. , Reddy , D. G. and Hausheer , F. H. 1999 . J. Comp. Chem. , 20 : 365 – 382 .
   Google Scholar
• Wiberg , K. B. , Hadad , C. M. , Breneman , C. M. , Laidig , K. E. , Murcko , M. A. and LePage , T. J. 1991 . Science , 252 : 1266 – 1271 .
   PubMedGoogle Scholar
• Wymore , T. , Nicholas , H. B. and Hempel , J. 2001 . Chem. Biol. Interact. , 130–132 : 201 – 207 .
   PubMedGoogle Scholar
• Hempel , J. D. , Reed , D. M. and Pietruszko , R. 1982 . Alcohol Clin Exp Res. , 6 : 417 – 25 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Kurys , G. , Ambroziak , W. and Pietruszko , R. 1989 . J Biol Chem. , 264 : 4715 – 21 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Goa , J. 1953 . Scand. J. Clin. Lab. Invest. , 5 : 218 – 222 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Barrio , J. R. , Secrist , J. A. III and Leonard , N. J. 1972 . Proc. Ntl. Acad. Sci. USA , 69 : 2039 – 2042 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Horecker , B. L. and Kornberg , A. 1948 . J. Biol. Chem. , 175 : 385 – 390 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Stein , A. M. 1971 . FEBS Letters , 19 : 270 – 272 .
   PubMedGoogle Scholar
• van Eys , J. , Ciotti , M. M. and Kaplan , N. O. 1958 . J. Biol. Chem. , 231 : 571 – 582 .
   PubMedGoogle Scholar
• Kaplan , N. O. and Ciotti , M. M. 1956 . J. Biol. Chem. , 221 : 823 – 832 .
   PubMedGoogle Scholar
• Kaplan , N. O. , Ciotti , M. M. and Stolzenbach , F. E. 1956 . J. Biol. Chem. , 221 : 833 – 844 .
   PubMedGoogle Scholar
• Lamborg , M. , Stolzenbach , F. E. and Kaplan , N. O. 1958 . J. Biol. Chem. , 231 : 685 – 694 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Pfleiderer , G. , Woenckhaus , C. and Nelbock-Hochsteter , N. 1965 . Ann. Chem. , 690 : 170 – 176 .
   Google Scholar
• Stein , A. M. , Lee , J. K. , Anderson , C. D. and Anderson , B. M. 1963 . Biochemistry , 2 : 1015 – 1017 .
   PubMedGoogle Scholar
• Lineweaver , H. and Burk , D. 1934 . J. Am. Chem. Soc. , 56 : 658 – 667 .
   Web of Science ®Google Scholar
• Cleland , W. W. 1979 . Meth. Enzymol. , 63 : 103 – 138 .
   PubMedGoogle Scholar
• Segel , I. H. 1975 . Enzyme Kinetics. Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems; New York : John Wiley & Sons .
   Google Scholar
• Brooks , B. R. , Bruccoleri , R. E. , Olafson , B. D. , States , D. J. , Swaminathan , S. and Karplus , M. 1983 . J. Comput. Chem. , 4 : 187 – 217 .
   Web of Science ®Google Scholar
• MacKerell , A. D. Jr. , Brooks , B. , Brooks , C. L. III , Nilsson , L. , Roux , B. , Won , Y. and Karplus , M. 1998 . CHARMM: The Energy Function and Its Paramerization with an Overview of the Program Edited by: Schleyer , P. v.R. , Clark , N. L. A. T. , Gasteiger , J. , Kollman , P. A. , Schaefer , H. F. III and Schreiner , P. R. 271 – 277 . Chichester : John Wiley & Sons . 1
   Google Scholar
• Halgren , T. A. 1996 . J. Comput. Chem. , 17 : 490 – 519 .
   Web of Science ®Google Scholar
• Ni , L. , Zhou , J. , Hurley , T. D. and Weiner , H. 1999 . Protein Sci. , 8 : 2784 – 90 .
   PubMedGoogle Scholar
• Ryckaert , J. P. , Ciccotti , G. and Berendsen , H. J. C. 1977 . J. Comp. Phys. , 23 : 327 – 341 .
   Web of Science ®Google Scholar
• Frisch , M. J. , Trucks , G. W. , Schlegel , H. B. , Scuseria , G. E. , Robb , M. A. , Cheeseman , J. R. , Zakrzewski , V. G. , Montgomery , J. A. Jr. , Stratmann , R. E. , Burant , J. C. , Dapprich , S. , Millam , J. M. , Daniels , A. D. , Kudin , K. N. , Strain , M. C. , Farkas , O. , Tomasi , J. , Barone , V. , Cossi , M. , Cammi , R. , Mennucci , B. , Pomelli , C. , Adamo , C. , Clifford , S. , Ochterski , J. , Petersson , G. A. , Ayala , P. Y. , Cui , Q. , Morokuma , K. , Malick , D. K. , Rabuck , A. D. , Raghavachari , K. , Foresman , J. B. , Cioslowski , J. , Ortiz , J. V. , Baboul , A. G. , Stefanov , B. B. , Liu , G. , Liashenko , A. , Piskorz , P. , Komaromi , I. , Gomperts , R. , Martin , R. L. , Fox , D. J. , Keith , T. , Al-Laham , M. A. , Peng , C. Y. , Nanayakkara , A. , Gonzalez , C. , Challacombe , M. , Gill , P. M. W. , Johnson , B. , Chen , W. , Wong , M. W. , Andres , J. L. , Gonzalez , C. , Head-Gordon , M. , Replogle , E. S. and Pople , J. A. 1998 . Gaussian 98; Pittsburgh , PA : Gaussian, Inc. .
   Google Scholar
• Foster , J. P. and Weinhold , F. 1980 . J. Am. Chem. Soc. , 102 : 7211 – 7218 .
   Web of Science ®Google Scholar
• Barone , V. , Cossi , M. and Tomasi , J. 1998 . J. Comp. Chem. , 19 : 404 – 417 .
   Web of Science ®Google Scholar
• Cossi , M. , Barone , V. , Camni , R. and Tomasi , J. 1996 . Chem. Phys. Let. , 255 : 327 – 335 .
   Web of Science ®Google Scholar
• Hempel , J. D. and Pietruszko , R. 1981 . J Biol Chem. , 256 : 10889 – 10896 .
   PubMedGoogle Scholar
• Hempel , J. D. , Pietruszko , R. , Fietzek , P. and Jornvall , H. 1982 . Biochemistry. , 21 : 6834 – 6838 .
   PubMedGoogle Scholar
• MacKerell , A. D. Jr. , MacWright , R. S. and Pietruszko , R. 1986 . Biochemistry. , 25 : 5182 – 9 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Abriola , D. P. , Fields , R. , Stein , S. , MacKerell , A. D. Jr. and Pietruszko , R. 1987 . Biochemistry. , 26 : 5679 – 84 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Sheikh , S. , Ni , L. , Hurley , T. D. and Weiner , H. 1997 . J Biol Chem. , 272 : 18817 – 22 .
   PubMedGoogle Scholar
• Ho , L. L. , MacKerell , A. D. Jr. and Bash , P. A. 1996 . J. Phys. Chem. , 100 : 2588 – 2596 .
   Google Scholar
• Chen , I.-J. and MacKerell , A. D. Jr. 1999 . Theoretical Chemistry Accounts , 103 : 483 – 494 .
   Google Scholar
• Lieske , S. , Yang , B. , Eldefrawi , M. E. , MacKerell , A. D. Jr. and Wright , J. 1998 . J. Med. Chem. , 41 : 864 – 867 .
   PubMedGoogle Scholar
• Shah , P. C. , Turan , S. C. and Pietruszko , R. 1991 . Alcohol. , 8 : 25 – 30 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Liu , Z. J. , Hempel , J. , Sun , J. , Rose , J. , Hsiao , D. , Chang , W. R. , Chung , Y. J. , Kuo , I. and Lindahl , R. 1997 . W.B.C. Adv Exp Med Biol. , 414 : 1 – 7 .
   PubMedGoogle Scholar
• Perozich , J. , Kuo , I. , Wang , B. C. , Boesch , J. S. , Lindahl , R. and Hempel , J. 2000 . Eur. J. Biochem. , 267 : 6197 – 6203 .
   PubMedGoogle Scholar
• Zhang , L. , Ahvazi , B. , Szittner , R. , Vrielink , A. and Meighen , E. 1999 . Biochemistry , 38 : 11440 – 11447 .
   PubMedGoogle Scholar
• Kurys , G. , Shah , P. C. , Kikonygo , A. , Reed , D. , Ambroziak , W. and Pietruszko , R. 1993 . Eur J Biochem. , 218 : 311 – 320 .
   PubMedGoogle Scholar
• Zepeda , S. , Monasterio , O. and Ureta , T. 1990 . Biochem. J. , 266 : 637 – 644 .
   PubMedGoogle Scholar
• Kikonyogo , A. , Abriola , D. P. , Dryjanski , M. and Pietruszko , R. 1999 . Eur J Biochem. , 262 : 704 – 12 .
   PubMedGoogle Scholar
• Izaguirre , G. , Kikonyogo , A. and Pietruszko , R. 1998 . Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. , 119 : 747 – 54 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Hempel , J. , Perozich , J. , Chapman , T. , Rose , J. , Boesch , J. S. , Liu , Z.-J. , Lindahl , R. and Wang , B.-C. 1999 . Adv. Exper. Med. Biol. , 463 : 53 – 59 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Perczel , A. , Farkas , Ö. and Csizmadia , I. G. 1995 . J. Am. Chem. Soc. , 117 : 1653 – 1654 .
   Google Scholar
• Wang , X. and Weiner , H. 1995 . Biochemistry. , 34 : 237 – 43 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Ni , L. , Sheikh , S. and Weiner , H. 1997 . J Biol Chem. , 272 : 18823 – 6 .
   PubMedGoogle Scholar