References and Footnotes
- Nagaich , A. K. , Zhurkin , V. B. , Sakamoto , H. , Gorin , A. A. , Clore , G. M. , Gronenborn , A. M. , Appella , E. and Harrington , R. E. 1997 . J. Biol. Chem. , 272 : 14830 – 14841 .
- König , P. and Richmond , T. J. 1993 . J. Mol. Biol. , 233 : 139 – 154 .
- Grove , A. , Galeone , A. , Mayol , L. and Geiduschek , E. P. 1996 . J. Mol. Biol. , 260 : 120 – 125 .
- Jordi , B. J. , Owen-Hughes , T. A. , Hulton , C. S. and Higgins , C. F. 1995 . EMBO J. , 14 : 5690 – 5700 .
- Nègre , D. , Bonod-Bidaud , C. , Oudot , C. , Prost , J-F. , Kolb , A. , Ishihama , A. , Cozzone , A. J. and Cortay , J-C. 1997 . Nucleic Acids Res. , 25 : 713 – 718 .
- Grossched1 , R. 1995 . Curr. Opin. Cell. Biol. , 7 : 362 – 370 .
- Sjøttem , E. , Anderson , C. and Johansen , T. 1997 . J. Mol. Biol. , 267 : 490 – 504 .
- Olson , W. K. , Marky , N. L. , Jernigan , R. L. and Zhurkin , V. B. 1993 . J. Mol. Biol. , 232 : 530 – 554 .
- Tsai , L. and Luo , L. F. 2000 . J. Theor. Biol. , 207 : 177 – 194 .
- Hogan , M. E. , Roberson , M. W. and Austin , R. H. 1989 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 86 : 9273 – 9277 .
- Kahn , J. D. , Yun , E. and Crothers , D. M. 1994 . Nature , 368 : 163 – 166 .
- Bailly , C. M. , Waring , J. and Travers , A. A. 1995 . J. Mol. Biol. , 253 : 1 – 7 .
- Ornstein , R. , Rein , R. , Breen , D. and MacElroy , R. 1978 . Biopolymers , 17 : 2341 – 2360 .
- Brukner , I. , Jurukovski , V. and Savic , A. 1990 . Nucl. Acids Res. , 18 : 891 – 894 .
- Brukner , I. , Sanchez , R. , Suck , D. and Pongor , S. 1995 . EMBO J. , 14 : 1812 – 1818 .
- Olson , W. K. , Gorin , A. A. , Lu , X-J , Hock , M. and Zhurkin , V. B. 1998 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 95 : 11163 – 11168 .
- Satchwell , S. C. , Drew , H. R. and Travers , A. A. 1986 . J. Mol. Biol. , 191 : 659 – 675 .
- Pedersen , A. G. , Jensen , L. J. , Brunak , S. , Stærfeldt , H-H. and Ussery , D. W. 2000 . J. Mol. Biol. , 299 : 907 – 930 .
- Bolshoy , A. and Nevo , E. 2000 . Genome Research. , 10 : 1185 – 1193 .
- Baldi , P. , Brunak , S. , Chauvin , Y. and Pederson , A. G. 1999 . Bioinformatics , 15 ( 11 ) : 918 – 929 .
- Baldi , P. and Baisnée , P-F. 2000 . Bioinformatics , 16 ( 10 ) : 865 – 889 .
- Shore , D. and Baldwin , R. L. 1983 . J. Mol. Biol. , 170 : 957 – 981 .
- Levene , S. D. and Crothers , D. M. 1986 . J. Mol. Biol. , 189 : 61 – 72 .
- Cognet , J. A. H. , Pak1eza , C. , Cherny , D. , De1ain , E. and Cam , E. L. 1999 . J. Mol. Biol. , 285 : 997 – 1009 .
- Tsai , L. and Sun , Z. R. 2001 . FEBS Lett. , 507 : 225 – 230 .
- Berman , H. M. , O1son , W. K. , Beveridge , D. L. , Westbrook , J. , Ge1bin , A. , Demeny , T. , Hsieh , S.-H , Srinivasan , A. R. and Schneider , B. 1992 . Biophys. J. , 63 : 751 – 759 .
- Lu , X-J , Shakked , Z. and Olson , W. K. 2000 . J. Mol. Biol. , 300 : 819 – 840 .
- Benson , D. A. , Karsch-Mizrachi , I. , Lipman , D. J. , Ostell , J. , Rapp , B. A. and Wheeler , D. L. 2002 . Nucleic Acids Res. , 30 ( 1 ) : 17 – 20 .
- Praz , V. , Périer , R. C. , Bonnard , C. and Bucher , P. 2002 . Nucleic Acids Res. , 30 ( 1 ) : 322 – 324 .
- Diekmann , S. 1989 . J Mol. Biol. , 205 : 787 – 791 .
- Yanagi , K. , Privé , G. G. and Dickerson , R. E. 1991 . J. Mol. Biol. , 217 : 201 – 214 .
- Tung , C. H. and Harvey , S. C. 1984 . Nucl. Acids Res. , 12 : 3343 – 3356 .
- Hunter , C. A. 1993 . J. Mol. Biol. , 230 : 1025 – 1054 .
- Grove , A. , Ga1eone , A. , Yu , E. , Mayol , L. and Geiduschek , E. P. 1998 . J. Mol. Biol. , 282 : 731 – 739 .
- Davis , N. A. , Majee , S. S. and Kahn , J. D. 1999 . J. Mol. Biol. , 291 : 249 – 265 .
- Bareket-Samish , A. , Cohen , L. and Haran , T. E. 2000 . J. Mol. Biol. , 299 : 965 – 977 .