45
Views
17
CrossRef citations to date
0
Altmetric
Original Articles

Z-DNA's Conformer Substates Revealed by FT-IR Difference Spectroscopy of Nonoriented Left-Handed Double Helical Poly(dG-dC)

, , , , &
Pages 595-614 | Received 28 Dec 2003, Published online: 15 May 2012

References and Footnotes

  • Pohl , F. M. and Jovin , T. M. 1972 . J. Mol. Biol. , 67 : 375 – 396 .
  • Patel , D. J. , Canuel , L. L. and Pohl , F. M. 1979 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 76 : 2508 – 2511 .
  • Wang , A. H.-J. , Quigley , G. J. , Kolpak , F. J. , Crawford , J. L. , van Boom , J. H. , van der Marel , G. and Rich , A. 1979 . Nature , 282 : 680 – 686 .
  • Wang , A. H.-J. , Quigley , G. J. , Kolpak , F. J. , van derMarel , G. , van Boom , J. H. and Rich , A. 1981 . Science , 211 : 171 – 176 .
  • Arnott , S. , Chandrasekaran , R. , Birdsall , D. L. , Leslie , A. G. W. and Ratcliff , R. L. 1980 . Nature , 283 : 743 – 745 .
  • Leslie , A. G. W. , Arnott , S. , Chandrasekaran , R. and Ratcliff , R. L. 1980 . J. Mol. Biol. , 143 : 4972
  • Rich , A. , Nordheim , A. and Wang , A. H.-J. 1984 . Ann. Rev. Biochem. , 53 : 791 – 846 .
  • Gessner , R. V. , Frederick , C. A. , Quigley , G. J. , Rich , A. and Wang , A. H.-J. 1989 . J. Biol. Chem. , 264 : 7921 – 7935 .
  • Schwartz , T. , Rould , M. A. , Lowenhaupt , K. , Herbert , A. and Rich , A. 1999 . Science , 284 : 1841 – 1845 .
  • Herbert , A. and Rich , A. 1999 . Genetica , 106 : 37 – 47 .
  • Drew , H. , Takano , T. , Tanaka , S. , Itakura , K. and Dickerson , R. E. 1980 . Nature , 286 : 567 – 573 .
  • Crawford , J. L. , Kolpak , F. J. , Wang , A. H.-J. , Quigley , G. J. , van Boom , J. H. , van der Marel , G. and Rich , A. 1980 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 77 : 4016 – 4020 .
  • Saenger , W. 1984 . Principles of Nucleic Acid Structure. New York, Berlin : Springer-Verlag .
  • Ho , P. S. and Mooers , B. H.M. 1997 . Biopolymers , 44 : 65 – 90 .
  • Genest , D. , Mazeau , K. and Ptak , M. 1987 . J. Biomol. Struct. Dynam. , 5 : 67 – 78 .
  • Westhof , E. , Chevrier , B. , Gallion , S. L. , Weiner , P. K. and Levy , R. M. 1986 . J. Mol. Biol. , 190 : 699 – 712 .
  • Eriksson , M. A. L. and Laaksonen , A. 1992 . Biopolymers , 32 : 1035 – 1059 .
  • Ohishi , H. , Nakanishi , I. and Tomita , K. 1997 . Biochem. Biophys. Res. Commun. , 236 : 146 – 150 .
  • Rüdisser , S. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 1997 . J. Am. Chem. Soc. , 119 : 12251 – 12256 .
  • Pichler , A. , Rüdisser , S. , Mitterböck , M. , Huber , C. G. , Winger , R. H. , Liedl , K. R. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 1999 . Biophys. J. , 77 : 398 – 409 .
  • Rüdisser , S. , Pichler , A. , Winger , R. H. , Liedl , K. R. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 2000 . J. Mol. Liquids , 86 : 137 – 149 .
  • Pichler , A. 1999 . Ph.D. Thesis, Institute of General, Inorganic and Theoretical Chemistry. University of Innsbruck, Innsbruck
  • Pichler , A. , Hallbrucker , A. , Winger , R. H. , Liedl , K. R. and Mayer , E. 2000 . J. Phys. Chem. B , 104 : 11354 – 11359 .
  • Pichler , A. , Rüdisser , S. , Winger , R. H. , Liedl , K. R. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 2000 . Chem. Phys. , 258 : 391 – 404 .
  • Pichler , A. , Rüdisser , S. , Winger , R. H. , Wellenzohn , B. , Flader , W. , Liedl , K. R. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 2001 . Appl. Spectrosc. , 55 : 9 – 22 .
  • Pichler , A. , Rüdisser , S. , Rauch , C. , Flader , W. , Wellenzohn , B. , Winger , R. H. , Liedl , K. R. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 2002 . J. Phys. Chem. B , 106 : 3263 – 3274 .
  • Pichler , A. , Rauch , C. , Flader , W. , Wellenzohn , B. , Liedl , K. R. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 2003 . J. Biomol. Struct. Dynam. , 20 : 547 – 559 .
  • Hogan , M. E. and Jardetzky , O. 1979 . Proc. Natl. Acad. Sci. , 76 : 6341 – 6345 .
  • Chou , S.-H. , Cheng , J.-W. and Reid , B. R. 1992 . J. Mol. Biol. , 228 : 138 – 155 .
  • Gorenstein , D. G. 1994 . Chem. Rev. , 94 : 1315 – 1338 .
  • Tisne , C. , Hantz , E. , Hartmann , B. and Delepierre , M. 1998 . J. Mol. Biol. , 279 : 127 – 142 .
  • Rüdisser , S. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 1996 . J. Phys. Chem. , 100 : 458 – 461 .
  • Rüdisser , S. , Hallbrucker , A. , Mayer , E. and Johari , G. P. 1997 . J. Phys. Chem. , 101 : 266 – 277 .
  • Loprete , D. M. and Hartman , K. A. 1991 . Biochem. Biophys. Res. Commun. , 174 : 1313 – 1317 .
  • Loprete , D. M. and Hartman , K. A. 1993 . Biochemistry , 32 : 4077 – 4082 .
  • Banyay , M. and Gräslund , A. 2002 . J. Mol. Biol. , 324 : 667 – 676 .
  • Benevides , J. M. and Thomas , G. J. Jr. 1983 . Nucleic Acids Res. , 11 : 5747 – 5761 .
  • Thamann , T. J. , Lord , R. C. , Wang , A. H.-J. and Rich , A. 1981 . Nucleic Acids Res. , 9 : 5443 – 5457 .
  • Behe , M. J. , Felsenfeld , G. , Szu , S. C. and Charney , E. 1985 . Biopolymers , 24 : 289 – 300 .
  • Pabo , C. O. and Sauer , R. T. 1992 . Annu. Rev. Biochem. , 61 : 1053 – 1095 .
  • Pichler , A. , Rüdisser , S. , Winger , R. H. , Liedl , K. R. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 2000 . J. Am. Chem. Soc. , 122 : 716 – 717 .
  • Falk , M. , Hartman , K. A. Jr. and Lord , R. C. 1963 . J. Am. Chem. Soc. , 85 : 391 – 394 .
  • Falk , M. , Poole , A. G. and Goymour , C. G. 1970 . Can. J. Chem. , 48 : 1536 – 1539 .
  • Fleissner , G. , Hage , W. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 1996 . Appl. Spectrosc. , 50 : 1235 – 1245 .
  • Taboury , J. A. , Liquier , J. and Taillandier , E. 1985 . Can. J. Chem. , 63 : 1904 – 1909 .
  • Keller , P. B. and Hartman , K. A. 1986 . Spectrochim. Acta , 42A : 299 – 306 .
  • Park , P. A. , Pethrick , R. J. D. and Thomas , B. H. 1974 . Internal Rotation in Molecules. Edited by: Orville-Thomas , W. L. London : Wiley .
  • Fishman , A. I. and Stolov , A. A. 1993 . Spectrochim. Acta. , 49A : 1435 – 1479 .
  • Rüdisser , S. , Fleissner , G. , Pichler , A. , Hallbrucker , A. and Mayer , E. 1999 . J. Mol. Structure , 479 : 237 – 243 .
  • Taillandier , E. , Taboury , J. , Liquier , J. , Sautiere , P. and Couppez , M. 1981 . Biochimie , 63 : 895 – 898 .
  • Pilet , J. and Leng , M. 1982 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 79 : 26
  • Keller , P. B. and Hartman , K. A. 1986 . Nucleic Acids Res. , 14 : 8167 – 8182 .
  • Liquier , J. and Taillandier , E. 1996 . Infrared Spectroscopy of Biomolecules. Edited by: Mantsch , H. H. and Chapman , D. Wiley-Liss .
  • Thamann , T. J. , Lord , R. C. , Wang , A. H. J. and Rich , A. 1981 . Nucleic Acids Res. , 9 : 5443 – 5457 .
  • Arnott , S. , Chandrasekaran , R. , Puigjaner , L. C. , Walker , J. K. , Hall , I. H. , Birdsall , D. L. and Ratcliff , R. L. 1983 . Nucleic Acids Res. , 11 : 1457 – 1474 .
  • Taillandier , E. , Liquier , J. and Taboury , J. A. 1985 . Advances in Infrared and Raman Spectroscopy, Vol. 12. Edited by: Clark , R. J. H. and Hester , R. E.
  • Parry , D. B. , Samant , M. G. and Melroy , O. R. 1991 . Appl. Spectrosc. , 45 : 999 – 1007 .
  • Jackson , M. and Mantsch , H. H. 1995 . Crit. Rev. Biochem. Molec. Biol. , 30 : 95 – 120 .
  • Vandeginste , B. G. M. and Galan , L. D. 1975 . Anal. Chem. , 47 : 2124 – 2132 .
  • Maddams , W. F. 1980 . Appl. Spectrosc. , 32 : 245 – 267 .
  • Mantsch , H. H. , Casal , H. L. and Jones , R. N. 1986 . Spectroscopy of Biological Systems. Edited by: Clark , R. J. H. and Hester , R. E. New York : John Wiley & Sons .
  • Braiman , M. S. and Rothschild , K. J. 1988 . Ann. Rev. Biophys. Biophys. Chem. , 17 : 541 – 570 .
  • Pimentel , G. C. and Sederholm , C. H. 1956 . J. Chem. Phys. , 24 : 639 – 641 .
  • Guan , Y. and Thomas , G. J. Jr. 1996 . Biopolymers , 39 : 813 – 835 .
  • Guan , Y. and Thomas , G. J. Jr. 1996 . Biophys. J. , 71 : 2802 – 2814 .
  • Taboury , J. A. , Taillandier , E. , Lumbroso , P. , Neumann , J.-M. , Tran-Dinh , S. , d'Estaintot , B. L. , Huynh-Dinh , T. and Igolen , J. 1985 . J. Biomol. Struct. Dynam. , 2 : 1185 – 1203 .
  • Ghomi , M. , Letellier , R. and Taillandier , E. 1988 . Biopolymers , 27 : 605 – 616 .
  • Urpi , L. , Fita , I. , Ridoux , J. P. , Liquier , J. , Igolen , J. , Iglesias , F. , Huynhdinh , T. , Verdaguer , N. , Subirana , J. A. and Taillandier , E. 1989 . Nucleic Acids Res. , 17 : 6669 – 6680 .
  • Basham , B. , Eichman , B. F. and Ho , P. S. 1998 . Oxford Handbook of Nucleic Acid Structure. Edited by: Neidle , S. Oxford : Oxford University Press .
  • Fratini , A. V. , Kopka , M. L. , Drew , H. R. and Dickerson , R. E. 1982 . J. Biol. Chem. , 257 : 14686 – 14707 .
  • Flader , W. , Wellenzohn , B. , Winger , R. H. , Hallbrucker , A. , Mayer , E. and Liedl , K. R. 2001 . J. Phys. Chem. B , 105 : 10379 – 10387 .
  • Sokolov , A. P. , Grimm , H. and Kahn , R. 1999 . J. Chem. Phys. , 110 : 7053 – 7057 .
  • Adam , S. , Taboury , J.-A. , Taillandier , E. , Popinel , A. , Huynh-Dinh , T. and Igolen , J. 1986 . J. Biomol. Struct. Dynam. , 3 : 873 – 885 .

Reprints and Corporate Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

To request a reprint or corporate permissions for this article, please click on the relevant link below:

Academic Permissions

Please note: Selecting permissions does not provide access to the full text of the article, please see our help page How do I view content?

Obtain permissions instantly via Rightslink by clicking on the button below:

If you are unable to obtain permissions via Rightslink, please complete and submit this Permissions form. For more information, please visit our Permissions help page.