References and Footnotes
- Prager , E. M. and Jollès , P. 1996 . “ Animal Lysozymes C and G: An Overview. ” . In Lysozyme: Model Enzymes in Biochemistry and Biology. Edited by: Jollès , P. Switzerland : Birkhäuser-Verlag Basel .
- Merlini , G. and Bellotti , V. 2005 . Clin. Chim. Acta. , 357 : 168 – 172 .
- Artymiuk , P. J. and Blake , C. C. 1981 . J. Mol. Biol. , 152 : 737 – 762 .
- Pepys , M. B. 1996 . “ The Oxford Textbook of Medicine. ” . In Amyloidosis. Edited by: Weatherall , D. J. , Ledingham , J. G. G. and Warell , D. A. Oxford , , UK : Oxford University Press .
- Kelly , J. W. 1998 . Curr. Opin. Struct. Biol. , 8 : 101 – 106 .
- Lai , Z. , Colon , W. and Kelly , J. W. 1996 . Biochemistry , 35 : 6470 – 6482 .
- Wetzel , R. 1996 . Cell. , 86 : 699 – 702 .
- Funahashi , J. , Takano , K. , Ogasahara , K. , Yamagata , Y. and Yutani , K. 1996 . J. Biochem. , 120 : 1216 – 1223 .
- Forloni , G. , Angeretti , N. , Chiesa , R. , Monzani , E. , Salmona , M. , Bugiani , O. and Tagliavini , F. 1993 . Nature , 362 : 543 – 546 .
- Miroy , G. J. , Lai , Z. , Lashuel , H. , Peterson , S. A. , Strang , C. and Kelly , J. W. 1996 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 93 : 15051 – 15056 .
- Booth , D. R. , Sunde , M. , Bellotti , V. , Robinson , C. V. , Hutchinson , W. L. , Fraser , P. E. , Hawkins , P. N. , Dobson , C. M. , Radford , S. E. , Blake , C. C. and Pepys , M. B. 1997 . Nature , 385 : 787 – 793 .
- Morozova-Roche , L. A. , Zurdo , J. , Spencer , A. , Noppe , W. , Receveur , V. , Archer , D. B. , Joniau , M. and Dobson , C. M. 2000 . J. Struct. Biol. , 130 : 339 – 351 .
- Nelson , J. W. and Kallenbach , N. R. 1989 . Biochemistry , 28 : 5256 – 5261 .
- Lehrman , S. R. , Tuls , J. L. and Lund , M. 1990 . Biochemistry , 29 : 5590 – 5596 .
- Segawa , S. , Fukuno , T. , Fujiwara , K. and Noda , Y. 1991 . Biopolymers , 31 : 497 – 509 .
- Thomas , P. D. and Dill , K. A. 1993 . Protein Sci. , 2 : 2050 – 2065 .
- Buck , M. 1998 . Q. Rev. Biophys. , 3 : 297 – 355 .
- Hong , D.-P. , Hoshino , M. , Kuboi , R. and Goto , Y. 1999 . J. Am. Chem. Soc. , 121 : 8427 – 8433 .
- Hirota-Nakaoka , N. and Goto , Y. 1999 . Bioorg. Med. Chem. , 7 : 67 – 73 .
- Goda , S. , Takano , K. and Yamagat , Y. 2000 . Protein Sci. , 9 : 369 – 375 .
- Krebs , M. R. H. , Wilkins , D. K. and Chung , E. W. 2000 . J. Mol. Biol. , 300 : 541 – 549 .
- Goda , S. , Takano , K. , Yamagata , Y. , Maki , S. , Namba , K. and Yutani , K. 2002 . J. Biochem. , 132 : 655 – 661 .
- Allen , M. P. and Tildesley , D. J. 1987 . Computer Simulations of Liquids. Clarendon : Oxford .
- McCammon , J. A. and Harvey , S. C. 1987 . Dynamics of Proteins and Nucleic Acids. Cambridge University Press : London .
- Rapaport , D. C. 1995 . The Art of Molecular Dynamics Simulation. Cambridge , , UK : Cambridge University Press .
- Brooks , C. L. 1998 . Curr. Opin. Struct. Biol. , 8 : 222 – 226 . 3rd
- Li , A. and Daggett , V. 1994 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 91 : 10430 – 10434 .
- Karplus , M. and Šali , A. 1995 . Curr. Opin. Struct. Biol. , 5 : 58 – 73 .
- Liu , H.-L. and Wang , W.-C. 2002 . Chem. Phys. Lett. , 366 : 284 – 290 .
- Liu , H.-L. and Wang , W.-C. 2003 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 20 : 615 – 622 .
- Liu , H.-L. and Hsu , C.-M. 2003 . Chem. Phys. Lett. , 375 : 119 – 125 .
- Liu , H.-L. and Hsu , C.-M. 2003 . J. Chin. Chem. Soc. , 50 : 1235 – 1240 .
- Liu , H.-L. , Ho , Y. and Hsu , C.-M. 2003 . Chem. Phys. Lett. , 372 : 249 – 254 .
- Liu , H.-L. , Ho , Y. and Hsu , C.-M. 2003 . J. Biomed. Sci. , 10 : 302 – 312 .
- Liu , H.-L. , Shu , Y.-C. and Wu , Y.-H. 2003 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 20 : 741 – 746 .
- Liu , H.-L. , Wang , W.-C. and Hsu , C.-M. 2003 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 20 : 567 – 574 .
- Hwang , M.-J. , Ni , X. , Waldman , X. , Ewig , C. S. and Hagler , A. T. 1998 . Biopolymers , 45 : 435 – 468 .
- Kell , G. S. 1967 . J. Chem. Eng. Data , 12 : 66 – 69 .
- Kabsch , W. and Sander , C. 1983 . Biopolymers , 22 : 2577 – 2637 .
- Gilquin , B. , Guilbert , C. and Perahia , D. 2000 . Proteins: Struct. Funct. Genet. , 41 : 58 – 74 .
- Nimrod , G. , Glaser , F. , Steinberg , D. , Ben-Tal , N. and Pupko , T. 2005 . Bioinformatics , 1 : 328 – 337 .
- Knott , M. , Kaya , H. and Chan , H. S. 2004 . Polymer , 45 : 623 – 632 .
- Smith , L. J. , Sutcliffe , M. J. , Redfield , C. and Dobson , C. M. 1993 . J. Mol. Biol. , 229 : 930 – 944 .
- Moraitakis , G. and Goodfellow , J. M. 2003 . Biophys. J. , 84 : 2149 – 2158 .
- Williams , M. A. , Thornton , J. M. and Goodfellow , J. M. 1997 . Protein Eng. , 10 : 895 – 903 .
- Li , A. and Daggett , V. 1998 . J. Mol. Biol. , 275 : 677 – 694 .
- Lins , R. D. , Pereira , C. S. and Hünenberger , P. H. 2004 . Proteins: Struct. Funct. Bioinformatics. , 55 : 177 – 186 .
- Hünenberger , P. H. , Mark , A. E. and van Gunsteren , W. F. 1995 . Proteins: Struct. Funct. Genet. , 21 : 196 – 213 .
- Liu , W. , Bratko , D. , Prausnitz , J. M. and Blanch , H. W. 2004 . Biophys. Chem. , 107 : 289 – 298 .
- Yonezawa , Y. , Tanaka , S. , Kubota , K. , Wakabayashi , K. , Yutani , S. and Fujiwara , S. 2002 . J. Mol. Biol. , 323 : 237 – 251 .
- Miranker , A. , Radford , S. E. , Karplus , M. and Dobson , C. M. 1991 . Nature , 349 : 633 – 636 .
- Miranker , A. , Robinson , C. V. , Radford , S. E. , Aplin , R. T. and Dobson , C. M. 1993 . Science , 262 : 896 – 900 .
- Pepys , M. B. , Hawkins , P. N. , Booth , D. R. , Vigushin , D. M. , Tennent , G. A. , Soutar , A. K. , Totty , N. , Nguyen , O. , Blake , C. C. , Terry , C. J. , Feest , T. G. , Zalin , A. M. and Hsuan , J. J. 1993 . Nature , 362 : 553 – 557 .
- Tobias , D. J. , Sneddon , S. F. and Brooks , C. L. 1990 . J. Mol. Biol. , 216 : 783 – 796 . 3rd
- Zimmerman , S. S. and Scheraga , H. A. 1977 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 74 : 4126 – 4129 .
- Dyson , H. J. , Sayre , J. R. , Merutka , G. , Shin , H. C. , Lerner , R. A. and Wright , P. E. 1992 . J. Mol. Biol. , 226 : 819 – 835 .
- Skolnick , J. and Kolinski , A. 1991 . J. Mol. Biol. , 221 : 499 – 531 .
- Yang , A. S. , Hitz , B. and Honig , B. 1996 . J. Mol. Biol. , 259 : 873 – 882 .
- Dobson , C. M. , Evans , P. E. and Redford , S. E. 1994 . Trands. Biochem. Sci. , 19 : 31 – 37 .