Docking Studies on the Binding of Quinoline Derivatives and Hematin to Plasmodium Falciparum Lactate Dehydrogenase

References

• França , T. C.C. , Santos , M. G. and Villar , J. D. F. 2008 . Quim. Nova , 31 : 1271 – 1278 .
   Web of Science ®Google Scholar
• Silva , T. H. A. , Oliveira , M. T. , Santos , H. F. , Oliveira , A. B. and Almeida , W. B. 2005 . Quim. Nova , 28 : 244 – 249 .
   Google Scholar
• Martin , R. E. , Marchetti , R. V. , Cowan , A. I. , Howitt , S. M. , Bröer , S. and Kirk , K. 2009 . Science , 238 : 1283 – 1285 .
   Google Scholar
• Vale , N. , Moreira , R. and Gomes , P. 2006 . Bol Soc Port Quim , 99 : 61 – 73 .
   Google Scholar
• França , T. C.C. , Medeiros , A. L. , Santos Filho , O. A. , Santos , E. C. P. and Figueroa-Villar , J. D. 2004 . J Braz Chem Soc , 15 ( 3 ) : 450 – 454 .
   Web of Science ®Google Scholar
• França , T. C.C. , Pascutti , P. G. , Ramalho , T. C. and Figueroa-Villar , J. D. 2005 . Biophys Chem , 115 : 1 – 10 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• França , T. C.C. , Wilter , A. , Pascutti , P. G. , Ramalho , T. C. and Figueroa-Villar , J. D. 2006 . J Braz Chem Soc , 17 ( 7 ) : 1383 – 1392 .
   Web of Science ®Google Scholar
• da Silva , M. L. , da Silva , A. G. , Batista , P. R. , Figueroa-Villar , J. D. , Pascutti , P. G. and França , T. C.C. 2010 . Mol Sim , 36 ( 1 ) : 5 – 14 .
   Web of Science ®Google Scholar
• Dorn , A. , Vippagunta , S. R. , Matile , H. and Jaquet , C. 1998 . Biochem Pharmacol , 55 : 727 – 736 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Orjih , A. U. , Banyal , H. S. , Chevli , R. and Fitch , C. D. 1981 . Science , 214 : 667 – 669 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Foley , M. and Tilley , L. 1998 . Pharmacol Ther , 79 : 55 – 87 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Gluzman , I. Y. , Francis , S. E. , Oksman , A. , Smith , C. E. , Duffin , K. L. and Goldberg , D. E. 1994 . J Clin Inves. , 93 : 1602 – 1608 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Read , J. A. , Wilkinson , K. W. , Tranter , R. , Sessions , R. B. and Brady , R. L. 1999 . J Biol Chem , 274 : 10213 – 10218 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Granchi , C. , Bertini , S. , Macchia , M. and Minutolo , F. 2010 . Curr Med Chem , 17 ( 7 ) : 672 – 697 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Schumann , R. R. 2007 . Proc Natl Acad Sci USA , 104 : 1743 – 1744 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Thomsen , R. and Christensen , M. H. 2006 . J Med Chem , 49 : 3315 – 3321 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Portela , C. , Afonso , C. M. , Pinto , M. M. and Ramos , M. J. 2003 . FEBS Lett. , 547 : 217 – 222 .
   PubMedGoogle Scholar
• Menting , J. G. , Tilley , L. , Deady , L. W. , Ng , K. , Simpson , R. J. , Cowman , A. F. and Foley , M. 1997 . Mol Biochem Parasitol , 88 : 215 – 224 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Ompraba , G. , Velmurugan , D. , Louis , P. A. and Rafi , Z. A. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 489 – 499 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Cambria , M. T. , Di Marino , D. , Falconi , M. , Garavaglia , S. and Cambria , A. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 501 – 509 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Chen , C. Y. C. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 627 – 640 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Huang , H. J. , Lee , K. J. , Yu , H. W. , Chen , C. Y. , Hsu , C. H. , Chen , H. Y. , Tsai , F. J. and Chen , C. Y. C. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 23 – 37 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Nekrasov , A. N. and Zinchenko , A. A. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 85 – 96 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Tao , Y. , Rao , Z. H. and Liu , S. Q. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 143 – 157 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Huang , H. J. , Lee , K. J. , Yu , H. W. , Chen , H. Y. , Tsai , F. J. and Chen , C. Y. C. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 187 – 200 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Kahlon , A. K. , Roy , S. and Sharma , A. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 201 – 210 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Nasiri , R. , Bahrami , H. , Zahedi , M. , Moosavi-Movahedi , A. A. and Sattarahmady , N. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 211 – 226 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Banappagari , S. , Ronald , S. and Satyanarayanajois , S. D. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 289 – 308 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Yang , Z. , Wu , N. , Fu , Y. , Yang , G. , Wang , W. , Zu , Y. and Efferth , T. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 323 – 330 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Chang , T. T. , Huang , H. J. , Lee , K. J. , Yu , H. W. , Chen , H. Y. , Tsai , F. J. , Sun , M. F. and Chen , C. Y. C. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 : 309 – 321 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Mangels , C. , Frank , A. O. , Ziegler , J. , Klingenstein , R. , Schweimer , K. , Willbold , D. , Korth , C. , Rosch , P. and Schwarzinger , S. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 163 – 170 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Chen , C. Y. , Chang , Y. H. , Bau , D. T. , Huang , H. J. , Tsai , F. J. , Tsai , C. H. and Chen , C. Y. C. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 171 – 178 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Andrianov , A. M. and Anishchenko , I. V. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 179 – 193 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Ramalho , T. C. , Caetano , M. S. , Da Cunha , E. F.F. , Souza , T. C. S. and Rocha , M. V. J. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 195 – 207 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Akten , E. D. , Cansu , S. and Doruker , P. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 13 – 25 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Hage-Melim , L. I.D. S. , Da Silva , C. H.T.D.P. , Semighini , E. P. , Taft , C. A. and Sampaio , S. V. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 27 – 35 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Praveena , G. and Kolandaivel , P. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 37 – 47 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Meynier , C. , Guerlesquin , F. and Roche , P. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 27 : 49 – 57 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Zhong , L. and Xie , J. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 26 : 525 – 533 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Parthiban , M. , Rajasekaran , M. B. , Ramakumar , S. and Shanmughavel , P. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 26 : 535 – 547 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Andrianov , A. M. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 26 : 445 – 454 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Suma Mohan , S. , Perry , J. J. P. , Poulose , N. , Nair , B. G. and Anilkumar , G. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 26 : 455 – 464 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Bairagya , H. R. , Mukhopadhyay , B. P. and Sekar , K. 2009 . J Biomol Struct Dyn , 26 : 497 – 507 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Ramalho , T. C. , Rocha , M. V. J. , Cunha , E. F. F. , Oliveira , L. C. A. and Carvalho , K. T. G. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 28 ( 2 ) : 227 – 238 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Guimarães , A. P. , Oliveira , A. A. , Cunha , E. F. F. , Ramalho , T. C. and França , T. C.C. 2011 . J Biomol Struct Dyn , 28 ( 4 ) : 455 – 469 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Guimaräes , A. P. , Oliveira , A. A. , Cunha , E. F. F. , Ramalho , T. C. and França , T. C.C. 2011 . J Mol Mod , in press
   Google Scholar
• da Silva , C. H.T.P. , Carvalho , I. and Taft , C. A. 2007 . J Biomol Struct Dyn , 24 ( 6 ) : 515 – 523 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Cunha , E. F. F. , Barbosa , E. F. , Oliveira , A. A. and Ramalho , T. C. 2010 . J Biomol Struct Dyn , 27 ( 5 ) : 619 – 625 .
   PubMedGoogle Scholar
• Pattabiraman , N. , Martinez , H. M. and Shapiro , B. A. 2002 . J Biomol Struct Dyn , 20 ( 3 ) : 397 – 411 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Bernstein , F. C. , Koetzle , T. F. , Williams , G. J. , Meyer , E. E. , Brice , M. D. , Rodgers , J. R. , Kennard , O. , Shimanouchi , T. and Tasumi , M. 1977 . J Mol Biol , 112 : 535 – 542 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Berman , H. M. , Westbrook , J. , Feng , Z. , Gilliland , G. , Bhat , T. N. , Weissig , H. , Shindyalov , I. N. and Bourne , P. E. 2000 . Nucleic Acids Res , 28 : 235 – 242 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Frisch , M. J. , Trucks , G. W. , Schlegel , H. B. , Scuseria , G. E. , Robb , M. A. , Cheeseman , J. R. , Zakrewski , V. G. , Montgomery , J. A. , Stratman , R. E. , Vurant , J. C. , Dapprich , S. , Millam , J. M. , Daniels , A. D. , Kudin , K. N. , Strain , M. C. , Farkas , O. , Tomasi , J. , Barone , V. , Cossi , M. , Cammi , R. , Mennuci , B. , Pomelli , C. , Adamo , C. , Clifford , S. , Ochterski , J. , Petersson , G. A. , Ayala , P. Y. , Cui , Q. , Morokuma , K. , Malick , D. K. , Rabuch , A. D. , Raghavachari , K. , Foresman , J. B. , Cioslowshi , J. , Ortiz , J. V. , Stefanov , B. B. , Liu , G. , Liashenko , A. , Piskorz , P. , Komaromi , I. , Gomperts , R. , Martin , R. L. , Foz , D. J. , AlLaham , T. M. , Peng , C. Y. , Nanayakkara , A. , Gonzalez , C. , Challacombe , M. , Gill , P. M. W. , Jonson , B. , Chen , W. , Wong , M. W. , Andres , J. L. , Gonzalez , C. , Head-Gordon , M. , Reploge , E. S. and Pople , J. A. 1998 . Gaussian 98, revison A.6. Pittsburg , PA : Gaussian .
   Google Scholar
• Yang , J. and Chen , C. 2004 . Proteins , 55 : 288 – 304 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Gehlhaar , D. K. , Verkhivker , G. , Rejto , P. A. , Fogel , D. B. , Fogel , L. J. and Freer , S. T. 1995 . Proceedings of the Fourth International Conference on Evolutionary Programming , : 615 – 627 .
   Google Scholar
• Gehlhaar , D. K. , Bouzida , D. and Rejto , P. A. 1998 . Proceedings of the Seventh International Conference on Evolutionary Programming , : 449 – 461 .
   Google Scholar
• Hess , B. , Kutzner , C. , van der Spoel , D. and Lindahl , E. 2008 . J Chem Theor Comput , 4 ( 3 ) : 435 – 447 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Schuettelkopf , A. W. and Van Aalten , D. M.F. 2004 . Acta Crystallogr, Sect. D: Biol Crystallogr , 1355
   Google Scholar
• Oostenbrink , C. , Villa , A. , Mark , A. E. and van Gunsteren , W. F. 2004 . J Comput Chem , 25 ( 13 ) : 1656 – 1676 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Humphrey , W. , Dalke , A. and Schulte , K. 1996 . J Mol Graph , 14 : 33 – 38 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar
• Koradi , R. , Billeter , M. and Wüthrich , K. 1996 . J Mol Graph , 14 : 51 – 55 .
   PubMedGoogle Scholar
• Warren , D. 2002 . The PyMOL molecular graphics system San Carlos , CA : DeLano Scientific .
   Google Scholar
• Gomez , M. S. , Piper , R. C. , Hunsaker , L. A. , Royer , R. E. , Deck , L. M. , Makler , M. T. and Jagt , D. L. V. 1997 . Mol Biochem Parasitol , 90 : 235 – 246 .
   PubMed Web of Science ®Google Scholar