References and Footnotes
- Beveridge , D. L. and DiCapua , F. M. 1989 . Ann. Rev. Biophys. Biophys. Chem. , 18 : 431 – 492 .
- Cate , J. H. , Gooding , A. R. , Podell , E. and Zhou , K. 1996 . Science , 273 : 1678 – 1685 .
- Guteil , R. R. 1994 . Nucleic Acids Res. , 22 : 3502 – 3507 .
- Elgavish , T. E. , VanLoock , M. S. and Harvey , S. C. 1998 . J. Mol. Biol. , in press
- Neidhardt , F. C. 1987 . Escherichia coli and Salmonella typhimurium: Cellular and Molecular Biology Washington , D C. : American Society for Microbiology .
- Wang , J. C. 1985 . Ann. Rev. Biochem. , 54 : 665 – 697 .
- Stern , S. , Wilson , R. C. and Noller , H. F. 1986 . J. Mol. Biol. , 192 : 101 – 110 .
- Powers , T. and Noller , H. F. 1995 . RNA , 1 : 194 – 209 .
- Brimacombe , R. , Atmadja , J. and Stiege , W. A. 1988 . J. Mol. Biol. , 199 : 115 – 136 .
- Stem , S. and Weiser , B. 1988 . J. Mol. Biol. , 204 : 447 – 481 .
- Malhotra , A. and Harvey , S. C. 1994 . J. Mol Biol. , 240 : 308 – 340 .
- Hubbard , J. M. and Hearst , J. E. 1991 . J. Mol Biol. , 221 : 889 – 907 .
- Wang , R. , Alexander , R. W , VanLoock , M. S. , Vladimirov , S. , Bukhtiyarov , Y. , Harvey , S. C. and Cooperman , B. S. 1998 . J. Moi Biol. , submitted
- Mueller , F. and Brimacombe , R. A. 1997 . J. Mol Biol. , 271 : 524 – 544 .
- Mueller , F. and Brimacombe , R. A. 1997 . J. Mol Biol. , 271 : 545 – 565 .
- Mueller , F. , Stark , H. , van Heel , M. , Rinke-Appel , J. and Brimacombe , R. A. 1997 . J Mol. Biol. , 271 : 566 – 587 .
- Crowell , R. H. and Fox , R. H. Introduction to Knot Theory. Boston : Ginn & Company . (, 1963)
- Vologodskii , A. V. , Lukashin , A. V. , Frank-Kamenetskii , M. D. and Anshelevich , V. V. 1974 . Sov Phys.JETP , 39 : 1059 – 1063 .
- Harris , B. A. and Harvey , S. C. 1998 . J. Comp. Chem. , submitted
- Seibel , G. , Singh , U. C. , Weiner , P. K. , Caldwell , J. and Kollman , P. A. 1989 . AMBER 3.0 Revision A. San Francisco , CA : University of California .
- Malhotra , A. , Tan , R. K.-Z. and Harvey , S. C. 1994 . Biophys. J. , 66 : 1777 – 1795 .
- Tan , R. K.-Z. and Harvey , S. C. 1993 . J. Comp. Chem. , 14 : 455 – 470 .
- Sussman , J. L. , Holbrook , S. R. , Warrant , R. W. and Church , G. M. 1978 . Mol. Biol. , 123 : 607 – 630 .