References and Footnotes
- Tuite , E. M. and Nordén , B. 1994 . J. Am. Chem. Soc. , 116 : 7548 – 7556 .
- Rohs , R. , Sklenar , H. , Lavery , R. and Röder , B. 2000 . J. Am. Chem. Soc. , 122 : 2860 – 2866 .
- Tuite , E. M. and Kelly , J. M. 1993 . J. Photochem. Photobiol. B , 21 : 103 – 124 .
- Laustriat , G. 1986 . Biochimie , 68 : 771 – 778 .
- Rohs , R. 1997 . Spektroskopische Untersuchungen und theoretische Modellierungen physikalischer Eigenschaften von Farbstoff-Oligonukleotid-Konjugaten. Humboldt University Berlin . Diploma Thesis
- Nordén , B. and Tjerneld , F. 1982 . Biopolymers , 21 : 1713 – 1734 .
- Wang , J. , Hogan , M. and Austin , R. H. 1982 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 79 : 5896 – 5900 .
- Hogan , M. , Wang , J. , Austin , R. H. , Monitto , C. L. and Hershkowitz , S. 1982 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 79 : 3518 – 3522 .
- Lyng , R. , Härd , T. and Nordén , B. 1987 . Biopolymers , 26 : 1327 – 1345 .
- Bradley , D. F. , Stellwagen , N. C. , O'Konski , C. T. and Paulson , C. M. 1972 . Biopolymers , 11 : 645 – 652 .
- Müller , W. and Crothers , D. M. 1975 . Eur. J. Biochem. , 54 : 267 – 277 .
- OhUigin , C. , McConnell , D. J. , Kelly , J. M. and van der Putten , W. J.M. 1987 . Nucleic Acids Research , 15 : 7411 – 7427 .
- Tuite , E. M. and Kelly , J. M. 1995 . Biopolymers , 35 : 419 – 433 .
- Kelly , J. M. , van der Putten , W. J.M. and McConnell , D. J. 1987 . Photochem. Photobiol. , 45 : 167 – 175 .
- van der Putten , W. J.M. and Kelly , J. M. 1989 . Photochem. Photobiol. , 49 : 145 – 151 .
- Hagmar , P. , Pierrou , S. , Nielsen , P. , Nordén , B. and Kubista , M. 1992 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 9 : 667 – 679 .
- Rohs , R. and Sklenar , H. 2001 . Indian J. Biochem. Biophys. , 38 : 1 – 6 .
- Dickerson , R. E. and Drew , H. R. 1981 . J. Mol. Biol. , 149 : 761 – 786 .
- Nelson , H. C. M. , Finch , J. T. , Luisi , B. F. and Klug , A. 1987 . Nature , 330 : 221 – 226 .
- Lavery , R. , Zakrzewska , K. and Pullman , A. 1984 . J. Comput. Chem. , 5 : 363 – 373 .
- Lavery , R. , Zakrzewska , K. and Sklenar , H. 1995 . Comput. Phys. Commun. , 91 : 135 – 158 .
- Lavery , R. , Sklenar , H. , Zakrzewska , K. and Pullman , B. 1986 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 3 : 989 – 1014 .
- Hingerty , B. E. , Ritchie , R. H. , Ferrell , T. L. and Turner , J. E. 1985 . Biopolymers , 24 : 427 – 439 .
- Zakrzewska , K. , Madami , A. and Lavery , R. 1996 . Chem. Phys. , 204 : 263 – 269 .
- Harvey , S. C. 1989 . Proteins: Structure, Function, and Genetics , 5 : 78 – 92 .
- Davis , M. E. and McCammon , J. A. 1990 . Chem. Rev. , 90 : 509 – 521 .
- Honig , B. and Nicholls , A. 1995 . Science , 268 : 1144 – 1149 .
- Zacharias , M. and Sklenar , H. 1997 . Biophys. J. , 73 : 2990 – 3003 .
- Zacharias , M. and Sklenar , H. 1999 . J. Mol. Biol. , 289 : 261 – 275 .
- Gilson , M. K. , Sharp , K. A. and Honig , B. 1987 . J. Comput. Chem. , 9 : 327 – 335 .
- Davis , M. E. , Madura , J. D. , Luty , B. A. and McCammon , J. A. 1991 . Comput. Phys. Commun. , 62 : 187 – 198 .
- Rashin , A. A. and Honig , B. 1985 . J. Phys. Chem. , 89 : 5588 – 5593 .
- Sharp , K. A. and Honig , B. 1990 . J. Phys. Chem. , 94 : 7684 – 7692 .
- Lavery , R. and Sklenar , H. 1988 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 6 : 63 – 91 .
- Lavery , R. and Sklenar , H. 1989 . J. Biomol. Struct. Dyn. , 6 : 655 – 667 .
- Stofer , E. and Lavery , R. 1994 . Biopolymers , 34 : 337 – 346 .
- Sobell , H. M. 1985 . Biological Macromolecules and Assemblies 2, Nucleic Acids & Interactive Proteins Edited by: Jurnak , F. A. and MacPherson , A. 171 – 232 . New York : Wiley .
- Hawkins , C. A. , Watson , C. , Yan , Y. , Gong , B. and Wemmer , D. E. 2001 . Nucleic Acids Res. , 29 : 936 – 942 .
- Bennett , M. , Krah , A. , Wien , F. , Garman , E. , Mckenna , R. , Sanderson , M. and Neidle , S. 2000 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 97 : 9476 – 9481 .
- Tuite , E. , Kelly , J. M. , Beddard , G. S. and Reid , G. S. 1994 . Chem. Phys. Lett. , 226 : 517 – 524 .
- Reid , G. D. , Whittaker , D. J. , Day , M. A. , Creely , C. M. , Tuite , E. M. , Kelly , J. M. and Beddard , G. S. 2001 . J. Am. Chem. Soc. , 123 : 6953 – 6954 .
- Reid , G. D. , Whittaker , D. J. , Day , M. A. , Turton , D. A. , Kayser , V. , Kelly , J. M. and Beddard , G. S. 2002 . J. Am. Chem. Soc. , 124 : 5518 – 5527 .
- Rohs , R. 2002 . Simulation der Strukturbildung und Ligandenbindung von Nukleinsäuren im Raum kollektiver und innerer Variablen. Free University Berlin . Ph. D. Thesis